💻 Category

bioinformatics

869 papers

Bio-informatica is de fascinerende brug tussen biologie en datawetenschap. In dit veld helpen onderzoekers computers om enorme hoeveelheden biologische informatie te ontcijferen, van het decoderen van ons DNA tot het begrijpen hoe virussen muteren. Het is de motor achter veel moderne doorbraken in de gezondheidszorg en de ecologie, waarbij complexe patronen in levende systemen worden vertaald naar bruikbare inzichten.

Op Gist.Science maken we de nieuwste ontdekkingen in dit vakgebied toegankelijk voor iedereen. Wij verwerken elke nieuwe preprint die wordt gepubliceerd op bioRxiv, de belangrijkste bron voor nog niet-peer-reviewed onderzoek in de levenswetenschappen. Voor elk document bieden we zowel een duidelijke, alledaagse uitleg als een gedetailleerde technische samenvatting, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in jargon.

Hieronder vindt u de meest recente bijdragen uit de wereld van bio-informatica, zorgvuldig samengevat voor u.

💻 bioinformatics

AI4Life Open Calls and Public Challenges: why, how, and what we have learned.

Door de uitvoering van drie Open Calls en drie Public Challenges tussen 2023 en 2025 heeft het AI4Life-initiatief 22 biobeeldanalyseprojecten ondersteund en onthuld dat hoewel de adoptie van FAIR deep learning te maken heeft met aanzienlijke implementatiehinderpalen, de primaire flessenhals voor wetenschappelijke AI in de biologie niet ligt in de methodeontwikkeling, maar in de beschikbaarheid van data, annotaties en gedeelde infrastructuur.

Galinova, V., Seifi, M., Serrano Solano, B., Lidayova, K., Dalle Nogare, D., Corbat, A. A., Talks, J., Giacomello, E., G (…)2026-07-30
💻 bioinformatics

Spectronaut-nf: A Nextflow Pipeline for Parallel Processing of DIA Data with Spectronaut

Spectronaut-nf is een schaalbare Nextflow-pipeline die efficiënte, geparallelliseerde verwerking van grootschalige DIA-proteomics-datasets op high-performance computing-omgevingen mogelijk maakt, waardoor de analysetijd aanzienlijk wordt verkort terwijl consistente identificatieresultaten worden behouden in vergelijking met single-workstation of single-node opstellingen.

Kotimoole, C. N., Arefian, M., McKay, E. C., Kasaragod, S., Skoraczynski, G., Collins, B. C.2026-07-30
💻 bioinformatics

A geometric-to-neural cascade for cerebral microbleed detection in susceptibility-weighted MRI

Dit artikel presenteert een volledig geautomatiseerde, driestaps geometrisch-naar-neurale cascade-pipeline die subject-adaptieve unsupervised kandidaatgeneratie combineert met twee lichtgewicht 3D ResNet-classifiers, getraind op minimale human-in-the-loop labels, om een hoge nauwkeurigheid te bereiken bij de detectie van cerebrale microbloedingen in susceptibiliteitsgewogen MRI, terwijl het aantal fout-positieven door vasculaire en niet-vasculaire mimics aanzienlijk wordt verminderd.

Bogdanov, S., Rudravaram, G., Saunders, A. M., Kim, M. E., LeFevre, J., Charles, J., Jain, S., Schrag, M. S., Landman, B (…)2026-07-28
💻 bioinformatics

Spaceland: Histology-Guided Reconstruction of High-Resolution Whole-Organ 3D Molecular Atlases from Sparse Spatial Transcriptomics

Spaceland is een morfologie-gestuurd computationeel framework dat continue, hoog-resolutie 3D moleculaire atlas van volledige organen reconstrueert door ijle ruimtelijke transcriptomica te integreren met seriële H&E-histologie, waardoor schaalbare virtuele weefselmodellering mogelijk wordt zonder de noodzaak van uitputtende experimentele bemonstering.

Xu, F., Zhuang, Z., Zhu, Y., Ying, B., Hou, N., Lin, W., Wang, L., Yang, C., song, j.2026-07-27
💻 bioinformatics

Estimation of biological age using HRV data: comparison of the Klemera-Dubal method with the multiple linear regression method

Deze studie vergelijkt meervoudige lineaire regressie (MLR), bias-gecorrigeerde MLR en de Klemera-Doubal Method (KDM) voor het schatten van de biologische leeftijd op basis van hartslagvariabiliteitsgegevens bij 343 proefpersonen, waarbij wordt vastgesteld dat KDM de laagste schattingsfout oplevert, terwijl de bias-gecorrigeerde MLR een verbeterde nauwkeurigheid biedt ten opzichte van ongecorrigeerde MLR, maar beperkt wordt door de afhankelijkheid van chronologische leeftijd.

Pysaruk, A.2026-07-27
💻 bioinformatics

GPSNorm: Gaussian Process Spatial Normalization for Spatial Transcriptomics

GPSNorm is een nieuw Bayesiaans ruimtelijk normalisatiekader dat technische variatie, ruimtelijke structuur en biologisch signaal gezamenlijk modelleert met behulp van een hiërarchische Gaussische procesbenadering om normalisatieonzekerheid door te geven aan downstream differentiële expressieanalyse, waardoor de robuustheid en interpreteerbaarheid van ruimtelijke transcriptomica-gegevens worden verbeterd.

Taychameekiatchai, A., Zhan, X., Xiao, G., Ruan, P.2026-07-27
💻 bioinformatics

deepthought: the microscopy acquisition stack as an object of study

Dit artikel presenteert "deepthought", een modulaire stack voor microscopie-acquisitie die veelvoorkomende componenten zoals apparaattoegang en opslag standaardiseert, terwijl de applicatiespecifieke interpretatie- en doelwitlogica wordt geïsoleerd, waardoor autonome, 'analysis-in-the-loop' beeldvorming mogelijk wordt over diverse biologische scenario's heen, zoals high-throughput screening en langdurige live-cell tracking.

Kesavan, P. S., Devadasan, S., Bohra, D.2026-07-26