💻 Category

bioinformatics

1244 papers

Bio-informatica is de fascinerende brug tussen biologie en datawetenschap. In dit veld helpen onderzoekers computers om enorme hoeveelheden biologische informatie te ontcijferen, van het decoderen van ons DNA tot het begrijpen hoe virussen muteren. Het is de motor achter veel moderne doorbraken in de gezondheidszorg en de ecologie, waarbij complexe patronen in levende systemen worden vertaald naar bruikbare inzichten.

Op Gist.Science maken we de nieuwste ontdekkingen in dit vakgebied toegankelijk voor iedereen. Wij verwerken elke nieuwe preprint die wordt gepubliceerd op bioRxiv, de belangrijkste bron voor nog niet-peer-reviewed onderzoek in de levenswetenschappen. Voor elk document bieden we zowel een duidelijke, alledaagse uitleg als een gedetailleerde technische samenvatting, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in jargon.

Hieronder vindt u de meest recente bijdragen uit de wereld van bio-informatica, zorgvuldig samengevat voor u.

Cross-etiology transcriptomic conservation in hepatocellular carcinoma reveals opposing proliferation and hepatocyte-loss programs validated across cohorts

Deze studie toont aan dat hepatocellulair carcinoom, ongeacht de oorzaak, wordt gedefinieerd door twee tegengestelde, geconserveerde transcriptomische programma's (proliferatie en verlies van hepatocyten), waarbij HBV-geassocieerde tumoren bovendien een unieke, proliferatie-onafhankelijke letselcomponent vertonen die wordt gekwantificeerd door een gevalideerde HCCStateScore.

Romero, R., Toledo, C.2026-03-13💻 bioinformatics

Learning the All-Atom Equilibrium Distribution of Biomolecular Interactions at Scale

AnewSampling is een nieuw, overdraagbaar generatief raamwerk dat voor het eerst de evenwichtsverdeling van biomoleculaire interacties op atomaair niveau nauwkeurig nabootst en zo de hoge rekenkosten van moleculaire dynamica overwint door gebruik te maken van een grote database en een innovatieve kwasi-ruimtegeneratieve aanpak.

Wang, Y., Xu, Y., Li, W., Yu, H., Tan, W., Li, S., Huang, Q., Chen, N., Wu, X., Wu, Q., Liu, K.2026-03-13💻 bioinformatics

Fast and accurate resolution of ecDNA sequence using Cycle-Extractor

Het artikel introduceert Cycle-Extractor, een snelle en nauwkeurige methode die een gemengd-integer lineair programma gebruikt om ecDNA-structuren uit zowel korte als lange leessequencing-data te reconstrueren, waarbij het aanzienlijk sneller is dan bestaande tools en met lange leesdata complexere en betrouwbaardere structuren kan onthullen.

Faizrahnemoon, M., Luebeck, J., Hung, K. L., Rao, S., Prasad, G., Tsz-Lo Wong, I., G. Jones, M., S. Mischel, P., Y. Chang, H., Zhu, K., Bafna, V.2026-03-13💻 bioinformatics

MetaResNet: Enhancing Microbiome-Based Disease Classification through Colormap Optimization and Imbalance Handling

Deze studie introduceert MetaResNet, een op residual blocks en attention mechanisms gebaseerd CNN-architectuur dat aantoont dat de selectie van een 'Jet'-kleurenschema in combinatie met SMOTE voor het aanpakken van class-imbalance de prestaties van microbiome-gebaseerde ziekteclassificatie significant verbetert ten opzichte van bestaande methoden.

Qureshi, A., Wahid, A., Qazi, S., Khattak, H. A., Hussain, S. F.2026-03-13💻 bioinformatics

EoRNA2: Autonomous Data Discovery and Processing for Databasing of Gene Expression Data

Dit artikel beschrijft de nieuwe versie van de EoRNA-database voor gerst, die dankzij een geautomatiseerde workflow een orde van grootte meer samples bevat, een volledig herbouwde webinterface heeft en een nieuwe, uitgebreide referentie-transcriptdataset biedt, terwijl de onderliggende infrastructuur nu generiek en openbaar beschikbaar is voor andere soorten.

Milne, L., Simpson, C. G., Guo, W., Mayer, C.-D., Milne, I., Bayer, M.2026-03-13💻 bioinformatics