302 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze paper introduceert edENM, een op essentiële dynamica gebaseerd elastisch netwerkmodel dat is geoptimaliseerd voor DNA, RNA en proteïne-nucleïnezuurcomplexen om realistische conformationele dynamica te simuleren en geïntegreerd is in het eBDIMS-framework voor het bestuderen van functionele bewegingen in grote moleculaire complexen.
Dit artikel introduceert SAP (Segment Any Plant), een trainingsvrij framework dat het vooraf getrainde Segment Anything Model 2 (SAM2) gebruikt om nauwkeurige, few-shot segmentatie en kwantificering van plantentijdreeksen mogelijk te maken zonder specifieke herscholing.
Dit onderzoek toont aan dat de vorming van hub-structuren door het transcriptiefactor Dorsal in Drosophila-embryo's een emergent gevolg is van de kinetiek van DNA-binding die wordt bepaald door het aantal bindingsmotieven in de enhancer, en niet direct de transcriptie-uitbarstingen voorspelt of veroorzaakt.
Dit artikel introduceert een modulaire eiwitladder die, dankzij zijn consistentie over verschillende expressiesystemen en labelingstrategieën, dient als universeel referentiepunt om FRET-afstandsmetingen te standaardiseren en te vertalen tussen diverse experimentele platforms, van in vitro tot in cellen.
Dit onderzoek presenteert een nieuw deterministisch discreet wiskundig model voor biologische weefselgroei dat mechanische celinteracties beschrijft, en leidt daaruit een continu reactie-diffusie model af dat de experimenteel waargenomen gladmakende effecten van kromming op weefselgroei succesvol reproduceert.
Deze studie toont aan dat het introduceren van een proline op positie 2 in de M2-M3-linker van de α1-subunit van GABA-A-receptoren fungeert als een moleculaire rem die wordt opgeheven, waardoor het kanaal meer gevoelig wordt voor GABA en vaker spontaan activeert.
Deze studie beschrijft de ontwikkeling van "chlamylipo", een bio-hybride microzwemmer bestaande uit een in een liposoom ingesloten *Chlamydomonas*-alg, en onthult dat de voortstuwing en stroming worden gegenereerd door periodieke membraandefor maties die krachten effectief overbrengen via viskeuze wrijving en membraanvervorming.
Dit onderzoek toont aan dat de fasegescheiden condensaten van de transcriptiefactoren Nanog, Oct4 en Sox2 een niet-additief, synergistisch 'leverancier-ontvanger'-mechanisme voor DNA-rekrutering vertonen, waarbij DNA de ruimtelijke organisatie van de condensaten herstructureert en zo een extra laag van genexpressieregulatie biedt.
Dit onderzoek toont aan dat de ribosomale tunnelvernauwing geen statisch obstakel is, maar een dynamisch, flexibel poortmechanisme dat zich aanpast aan de aanwezigheid en samenstelling van de groeiende polypeptideketen.
Deze studie bepaalt de cryo-EM-structuur van het Pseudomonas-transceptor CbrA, onthult de interactie met het kleine peptide CbrX en biedt inzicht in de moleculaire mechanismen van histidine-transport en signaaltransductie die essentieel zijn voor metabolisme en virulentie.