302 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze studie introduceert en valideert MARTINI 3 grofkorrelige modellen van het mycobacteriële buitenmembraan, die aantonen dat de herschikking, diffusie en aggregatie van PDIM-lipiden sterk worden beïnvloed door membraanvloeibaarheid en lipidesamenstelling.
Deze studie introduceert een gestandaardiseerd, open-source framework dat fluorescentielevensduur- en anisotropiebeeldvorming combineert met moleculaire helderheidsmetingen om kwantitatief en reproduceerbaar receptoroligomerisatie en bindingsconstanten in levende cellen te analyseren onder fysiologische omstandigheden.
Dit onderzoek toont aan dat celtoestandsveranderingen worden gekenmerkt door 'sloppiness', waarbij de dynamiek grotendeels wordt bepaald door een paar 'stijve' parameters die een pad van minste actie volgen, terwijl talloze 'slordige' parameters weinig invloed hebben.
Dit artikel toont aan dat het hybride fotone-entropy-computersysteem Dirac-3, in vergelijking met klassieke exacte methoden, zeer effectief is voor het oplossen van complexe vaste-ruggengraat eiwitontwerpproblemen door oplossingen te vinden die dicht bij het optimum liggen met een veel gunstigere schaalbaarheid voor grotere instanties.
Dit onderzoek toont aan dat *Bacillus subtilis*-biofilms door de wisselwerking tussen waterabsorberende poly-γ-glutamaat en kruisverbindingen vormende exopolysacchariden een zwellend gel vormen, wat leidt tot een fase-overgang en de ontwikkeling van macroscopische rimpelingen.
Deze paper introduceert het concept van 'density misfit barrier traps' als een nieuwe klasse van lokale minima die de nauwkeurigheid van macromoleculaire ensemble-modellen beperken, en beschrijft de 'Untangle Challenge' die is opgezet om algoritmen te ontwikkelen die uit deze valkuilen kunnen ontsnappen voor betere structuurverfijning.
Deze studie toont aan dat serumlipoproteïnen de vorming van toxische oligomeren van het Staphylococcus aureus-toxine PSMα3 remmen, waardoor celsterfte wordt voorkomen en een nieuw perspectief wordt geboden voor de ontwikkeling van geneesmiddelen tegen S. aureus-infecties.
Dit onderzoek onthult dat de mechanische eigenschappen en hiërarchische structuur van E. coli-biofilms het resultaat zijn van een afstembaar composiet waarbij stijve curli-vezels het zwellen van pEtN-cellulose beperken, wat nieuwe mogelijkheden biedt voor het ontwerpen van levende materialen.
Deze studie presenteert een systematisch raamwerk voor het ontwerpen van sequence-geoptimaliseerde peptiden die de vloeistof-vloeistof-fasescheiding van α-synuclein rationeel moduleren, waardoor algemene ontwerpprincipes worden gevestigd voor het engineeren van condensaatmodulatoren.
Deze studie toont aan dat RNA als contextafhankelijke regulator fungeert die de assemblagedynamiek en biologische activiteit van het virulente amyloïde PSMα3 en het menselijke verdedigingspeptide LL-37 moduliert via faseovergangen en aggregatie, waarbij het de cytotoxiciteit van LL-37 reduceert terwijl het de virulentie van PSMα3 behoudt.