⚛️ Category

biophysics

365 papers

Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.

Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.

Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.

⚛️ biophysics

Binding Paths: Describing Small Molecule Interactions with Disordered Proteins via a Markov State Model

Dit artikel introduceert een op Markov State Models gebaseerd framework dat de interacties van kleine moleculen met ongeordende eiwitten karakteriseert via dynamische "bindingspaden" in plaats van statische pockets, waardoor herkenningsmechanismen worden gerationaliseerd en drugbare regio's worden geïdentificeerd om drug discovery voor voorheen onbehandelbare targets te faciliteren.

Louet, A. A. B., Hummer, G., Vendruscolo, M.2026-02-09
⚛️ biophysics

Early-Enrichment Hit Discovery via Reversible-Work c(t) Estimation in Metadynamics (CTMD)

Dit artikel introduceert CTMD, een snel, natuurkundig gebaseerd en open-source metadynamica-protocol dat de reversibele werk-schatter c(t) gebruikt om robuuste vroege verrijking in virtuele screening te bereiken, waarmee effectief de kloof wordt overbrugd tussen benaderende docking/AI-methoden en dure vrije-energieberekeningen, terwijl memorisatie-artefacten en trainingsset-biases die worden waargenomen bij recente AI co-folding benaderingen worden vermeden.

Adury, V. S. S., Tiwary, P., Gu, X., Shekhar, M.2026-02-08
⚛️ biophysics

Unbend: Correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model

Het artikel introduceert "Unbend", een nieuwe functie in de cisTEM-software die gebruikmaakt van een 3D kubische spline-model om gelokaliseerde door de bundel geïnduceerde monsterbeweging in cryo-EM-beelden te corrigeren, wat de detectiepercentages van deeltjes en de signaal-ruisverhoudingen aanzienlijk verbetert over diverse monstertypen heen, terwijl er minimale extra vervorming wordt geïntroduceerd.

Kong, L., Zottig, X., Elferich, J., Grigorieff, N.2026-02-07
⚛️ biophysics

Structural basis for hydrolytic splicing of a circularly permuted group II intron

Deze studie presenteert biochemische gegevens en hoogresolutie cryo-EM-structuren van een circulair gepermuteerd groep II-intron uit *Comamonas testosteroni* om de mechanistische overgang van vertakkings- naar hydrolytische splicingpaden te verduidelijken, waarbij actieve-plaatsherrangschikkingen worden onthuld die de productie van circulair RNA mogelijk maken en nieuwe strategieën voor therapeutische engineering bieden.

Ling, X., Jinbiao, M., Chen, Z.2026-02-07
⚛️ biophysics

Active Site Local Environment Allows Acidic and Basic Synergy in Enzymatic Ester Hydrolysis by PETase

Dit artikel onthult dat het PETase-enzym door de lokale omgeving van zijn actieve centrum een synergetische zure en basische katalyse bereikt voor esterhydrolyse, waarbij een protonenpendel wordt gebruikt voor nucleofielgeneratie en waterstofbinding voor transitietoestandsstabilisatie, wat daarmee specifieke eiwitengineeringstrategieën suggereert om de plastic-afbrekende reactiviteit te verbeteren.

Fan, J., Ha, Y.2026-02-05
⚛️ biophysics

Droplet on Demand Tape Drive and XES Prototypes for Time-Resolved Serial Crystallography at VMXi, Diamond Light Source

Dit artikel presenteert prototype-experimenten bij de VMXi-beamline van Diamond Light Source die de haalbaarheid demonstreren van het combineren van droplet-on-demand tape drive monsterlevering met röntgenemissiespectroscopie (XES) voor tijdsopgeloste seriële kristallografie op een derde generatie synchrotron, een methodologie die voorheen beperkt was tot XFEL's.

Aller, P., Sanchez-Weatherby, J., Telfer, A., Bosman, R., Devenish, N. E., Hinchliffe, P., Horrell, S., Ip, J., Littlewo (…)2026-02-04
⚛️ biophysics

Going around phase defects: reliable phase mapping for realistic data

Dit artikel introduceert een verbeterde "extended phase mapping"-methode die fasedefecten veroorzaakt door geleidingsblokken of anatomische grenzen expliciet detecteert en verwerkt, waardoor valse detecties worden geëlimineerd en een betrouwbaardere, fysiologisch consistente karakterisering van rotationele drivers bij cardiale aritmieën wordt geboden over gesimuleerde, experimentele en klinische datasets.

Verstraeten, B., Lootens, S., Van Den Abeele, R., Van Nieuwenhuize, V., Okenov, A., Hendrickx, S., Santos bezzera, A., N (…)2026-02-04
⚛️ biophysics

The monomeric conformational ensembles of Aβ40 and Aβ42 encode their differential amyloid aggregation propensity

Door middel van uitgebreide simulaties en geavanceerde analyse toont deze studie aan dat de afwijkende aggregatiegevoeligheid van Aβ42 vergeleken met Aβ40 op monomeerniveau wordt gecodeerd door de hogere β-structuurpropensiteit, meer uitgestrekte conformaties en grotere hydrofobe blootstelling van Aβ42, met name in de C-terminale regio.

Cadenelli, I., Ciccolo, A., Tagliabue, A., Rossi, G., Conti Nibali, V., Bochicchio, D.2026-02-02
⚛️ biophysics

Lipid droplet isolation as a novel platform for spectroscopic investigation of cargo modifications

Deze studie maakt gebruik van labelvrije Raman-spectroscopie van geïsoleerde lipidendruppels om onderscheidende, behandelspecifieke metabole hermodellering en lipideheterogeniteit in normale Schwann-cellen versus maligne MPNST-cellen te onthullen na behandeling met cannabidiol, ioniserende straling en hun combinatie, waardoor een nieuw platform wordt gevestigd voor het onderzoeken van lipide-gemedieerde radiosensibiliseringsmechanismen.

Chrabaszcz, K., Panek, A., Pogoda, K.2026-02-02