613 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit artikel introduceert DIVINE, een deterministisch en schaalbaar top-down clusteringframework voor moleculaire dynamica-trajecten dat reproduceerbare en structureel betekenisvolle partities biedt zonder de noodzaak van kwadratische afstandsmatrices, terwijl het presteert op of boven het niveau van bisecterende k-means met een aanzienlijk kortere runtime.
Dit paper introduceert de 'Kinetic Intron Hypothesis', een nieuw model dat de overvloedige lengte van introns in eukaryote genomen verklaart door hun potentiële rol in mitose en NTP-resourcebeheer via synthese- en afbraakdynamiek.
Dit artikel introduceert DNAsight, een modulair en automatisch framework dat machine learning combineert met kwantitatieve analyse om AFM-beelden van chromatinestructuur om te zetten in reproduceerbare biologische inzichten over DNA-organisatie en eiwitinteracties.
Dit onderzoek onthult dat de kinetische hiërarchie van de vorming van Kai-eiwitcomplexen, gekenmerkt door snelle en geleidelijke AC-uitwisseling, een schakelachtige en trage BC-vorming, en snelle herverdeling van KaiA, de mechanistische basis vormt voor de dynamische regulatie van de circadiane oscillator bij cyanobacteriën.
Dit onderzoek toont aan dat bij het GlyQS T-box riboswitch de directionele co-transcriptionele vouwing en transcriptie-pauzes samenwerken als kinetische checkpoints die de selectieve binding van tRNA en de daaropvolgende genregulatie mogelijk maken.
Dit artikel onthult via cryo-EM de moleculaire structuur van het Gβγ-prefusie SNARE-complex en onthult hoe Gβγ de vesikelversmelting remt door te binden aan het C-terminale deel van SNAP-25, waardoor de volledige vorming van het SNARE-helical bundle wordt geblokkeerd.
Deze studie toont aan dat het UT3-domein van Ufd1 een Lys48-gebonden ubiquitineketen ATP-onafhankelijk ontvouwt, waardoor de initiële stap voor Cdc48/p97-gemedieerde substraatverwerking en proteasomale degradatie wordt gezet.
Dit onderzoek onthult met cryo-EM en moleculaire dynamica hoe de chemokine CCL19 en CCL21 via verschillende bindingsposities en intracellulaire dynamiek, met name de flexibiliteit van helix 8, de selectieve rekrutering van β-arrestine versus G-eiwitten bij de CCR7-receptor bepalen, wat een structurele basis biedt voor het ontwerp van pathway-selectieve immunomodulatoren.
Dit artikel biedt een uitgebreide review van biomoleculaire bindingskinetiek, waarbij het de theoretische grondbeginselen van Brownse dynamica-simulaties belicht en hun rol als brug naar data-gedreven machine learning-methoden voor het voorspellen van kinetische processen in complexe celomgevingen onderzoekt.
Dit onderzoek toont aan dat vloeibaar-vloeibaar fase-scheiding van het intrinsiek ongeordende eiwit tau via een conformatierelay de binding van de chaperonne BRICHOS bevordert, waardoor deze in staat is om te concurreren met tubuline en zo de microtubulusassemblage te moduleren.