613 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze studie introduceert IBPC-Kd, een uitgebreide dataset van 1.785 experimenteel gekarakteriseerde IDR-complexen, en IDRBindNet, een machine-learningmodel dat op basis van deze data de bindingsaffiniteit van intrinsiek ongeordende eiwitten nauwkeurig voorspelt door integratie van structurele en chemische context.
Dit artikel introduceert een gestandaardiseerd, kwantitatief raamwerk voor het bepalen van de opbrengst bij de herassemblage van MS2-virusachtige deeltjes rond nucleïnezuur-cargo, waarbij een statistisch model de invloed van kritische parameters zoals eiwitconcentratie en ionische sterkte kwantificeert en praktische richtlijnen biedt voor reproduceerbaarheid.
Dit onderzoek toont aan dat celtoestandsveranderingen worden gekenmerkt door 'sloppiness', waarbij de dynamiek grotendeels wordt bepaald door een paar 'stijve' parameters die een pad van minste actie volgen, terwijl talloze 'slordige' parameters weinig invloed hebben.
Dit artikel toont aan dat het hybride fotone-entropy-computersysteem Dirac-3, in vergelijking met klassieke exacte methoden, zeer effectief is voor het oplossen van complexe vaste-ruggengraat eiwitontwerpproblemen door oplossingen te vinden die dicht bij het optimum liggen met een veel gunstigere schaalbaarheid voor grotere instanties.
Deze studie introduceert Tensile Expansion Microscopy (TExM), een techniek die mechanische trekkrachten gebruikt om zowel gefixeerde als levende cellulaire monsters in een hydrogel te rekken, waardoor super-resolutie beeldvorming mogelijk wordt met betere controle, reproduceerbaarheid en de mogelijkheid om dynamische processen in real-time te volgen.
Dit onderzoek toont aan dat *Bacillus subtilis*-biofilms door de wisselwerking tussen waterabsorberende poly-γ-glutamaat en kruisverbindingen vormende exopolysacchariden een zwellend gel vormen, wat leidt tot een fase-overgang en de ontwikkeling van macroscopische rimpelingen.
Deze paper introduceert het concept van 'density misfit barrier traps' als een nieuwe klasse van lokale minima die de nauwkeurigheid van macromoleculaire ensemble-modellen beperken, en beschrijft de 'Untangle Challenge' die is opgezet om algoritmen te ontwikkelen die uit deze valkuilen kunnen ontsnappen voor betere structuurverfijning.
Dit artikel beschrijft de ontdekking van MA48, de eerste kleine molecuulremmer die specifiek de interactie tussen de eiwitten CAPON en nNOS verstoort, wat een veelbelovende therapeutische route opent voor neurodegeneratieve ziekten.
Dit onderzoek onthult voor het eerst een richtinggevoelig zwaartekrachtsresponsmechanisme in de prokaryote cyanobacterie *Synechococcus* sp. PCC 7002, waarbij de verdeling van pigmenten wordt gecoördineerd door een interactie tussen licht, zwaartekracht en polyfosfaatlichaampjes.
Deze studie identificeert en corrigeert een kritieke 'sampling mismatch' in ptychografische single-particle analyse die de resolutie beperkt, waarbij de toepassing van een correctiestrategie op datasets van T. Acidophilum 20S-proteasoom en apoferritine leidt tot een verbeterde resolutie van ongeveer 1,5 Å.