🦠 Category

microbiology

579 papers

De microbiologie is de fascinerende wereld van het onzichtbare leven, waar we de microscopische organismen bestuderen die overal om ons heen aanwezig zijn. Van bacteriën en virussen tot schimmels en protozoa, deze kleine levensvormen spelen een cruciale rol in onze gezondheid, het milieu en zelfs de productie van voedsel. Op Gist.Science maken we de nieuwste inzichten uit dit dynamische veld toegankelijk voor iedereen, zonder dat je een doctoraat nodig hebt om de complexiteit te doorgronden.

Elke nieuwe preprint die op bioRxiv verschijnt binnen de microbiologie, wordt door ons team direct verwerkt. Wij bieden voor elk artikel zowel een begrijpelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische uitleg, zodat je zelf kunt kiezen hoe diep je wilt duiken in de wetenschap. Hieronder vind je de meest recente onderzoeken uit de microbiologie, direct uit de bron van bioRxiv.

🦠 microbiology

Direct Virus-Bacteria Binding Enhances Streptococcus equi subsp. zooepidemicus Colonisation and Bacterial-Driven Immune Activation During H3N8 Equine Influenza A Virus Co-Infection

Deze studie toont aan dat directe fysieke binding tussen het H3N8 paardeninfluenza A-virus en *Streptococcus equi* subsp. *zooepidemicus* de bacteriële kolonisatie celtype-specifiek versterkt en bacterie-gemedieerde immuunactivatie aandrijft, gekenmerkt door verhoogde pro-inflammatoire cytokinen maar verminderde expressie van interferon-beta tijdens co-infectie.

Alshammari, A. K., Maina, M., Alsuwat, M. A., Blanchard, A. M., Daly, J. M., Dunham, S. P.2026-05-19
🦠 microbiology

Rate of osmotic pressure change in drying saliva microdroplets drives inactivation of surrogate respiratory bacteria

Deze studie toont aan dat de snelheid van de verandering in osmotische druk tijdens de efflorescentie van drogende speekselmicrodruppels fungeert als een kwantitatieve, medium-onafhankelijke voorspeller van bacteriële inactivatie, waarbij snellere vochtigheidsdalingen leiden tot ernstigere osmotische schokken en een groter verlies aan levensvatbaarheid bij respiratoire pathogenen.

Medina, T., Luo, B., Peter, T., Wynn, H. K., Kohn, T.2026-05-19
🦠 microbiology

Evaluation of Oxford Nanopore Sequencing for Antimicrobial Resistance Surveillance in Salmonella: Comparison with Phenotypic Antimicrobial Susceptibility in a Large-Scale Study

Deze grootschalige studie die Oxford Nanopore-sequencing evalueerde op 1.490 *Salmonella*-isolaten uit Taiwan, toont aan dat hoewel genotypische resistentie over het algemeen correleert met fenotypische resultaten, specifieke discrepanties die worden veroorzaakt door afkapwaarde-definities, genexpressie en onbekende determinanten de noodzaak benadrukken van zorgvuldige interpretatie om whole-genome sequencing te benutten als een superieur alternatief voor conventionele antimicrobiële gevoeligheidstesten voor surveillance en behandelingsrichtlijnen.

Hong, Y.-P., Liao, Y.-S., Wan, Y.-W., Kuo, S.-C., Teng, R.-H., Liang, S.-Y., Chang, J.-H., Wei, H.-L., Chiou, C.-S.2026-05-19
🦠 microbiology

A complete-genome view of phylum Nanobdellota and recurrent Form III RuBisCO transfer between archaea and Patescibacteriota

Deze studie vergroot de genomische representatie van het archaeale phylum Nanobdellota met een factor 52 door 208 nieuwe complete genomen uit metagenomen van de Oostzee en grondwater, vestigt een nieuwe SeqCode-nomenclatuur voor een dominante orde en levert bewijs voor recurrente overdrachten van Form III RuBisCO van Archaea naar Patescibacteriota.

Nielsen, T. N., Lui, L. M.2026-05-18
🦠 microbiology

Repurposing antiviral drugs as a new avenue for Klebsiella pneumoniae decolonization

Deze studie toont aan dat het herbestemmen van antivirale geneesmiddelen een veelbelovende nieuwe weg biedt voor het dekoloniseren van het gastro-intestinale tractus van antibiotica-resistente *Klebsiella pneumoniae*, aangezien zes geïdentificeerde verbindingen stam-specifieke en context-afhankelijke antibacteriële activiteit vertoonden die relevant is voor de menselijke darmomgeving.

Anderson, N., Todd, K., Casiano, M., Maheswaran, N., Blankenberger, A., Singh, A., Relich, R. F., Tilston-Lunel, N. L. (…)2026-05-17
🦠 microbiology

Apparent generalism in Pseudomonas aeruginosa is underpinned by Convergent, Cryptic Specialization

Deze studie toont aan dat de schijnbare ecologische generaliteit van *Pseudomonas aeruginosa* in werkelijkheid wordt gedreven door convergente, cryptische specialisatie, waarbij distincte genomische aanpassingen aan specifieke omgevingen zich herhaaldelijk over de fylogenie ontwikkelen in plaats van beperkt te blijven tot diepe lijnen.

Mehlferber, E. C., Irby, I., Yarter, M., Lowery, N., Lowhorn, R., Appaji, Y., Eum, J., Song, H., Stone, B., Brown, S. P.2026-05-16
🦠 microbiology

Combined lactate- and phosphate-dependent cytoplasmic acidification drives Mycobacterium tuberculosis growth arrest at acidic pH

Deze studie toont aan dat de groeiarrestatie van *Mycobacterium tuberculosis* bij een zure pH op lactaat wordt aangedreven door fosfaat-afhankelijke cytoplasmatische verzuring en dissipatie van de protonenmotivekracht, wat kan worden onderdrukt door mutaties in fosfaattransporters die het SenX3/RegX3-regulon omhoogreguleren om de groei te herstellen.

Kibiloski, A. P., Dechow, S. J., Abdalla, B. J., Murdoch, H. M., Tischler, A. D., Abramovitch, R. B.2026-05-16
🦠 microbiology

Disentangling Production and Persistence of Extracellular Virions in Grassland Soils with SIP-Viromics

Door een op het genoom opgeloste stabiele-isotoopprobing-viromiekbenadering toe te passen op herbevochtigde graslandgronden, toont deze studie aan dat, hoewel slechts een klein deel van de extracellulaire virionen tijdens de eerste week actief wordt geproduceerd, het merendeel persisteert als een stabiele "virale zaadbank" die zich richt op snel heractiverende bacteriële gastheren, en aldus fungeert als een cruciaal genetisch reservoir voor microbiële omzetting en biogeochemische cycling na een verstoring van het milieu.

Trubl, G., Roux, S., Kellom, M., Vyshenska, D., Tomatsu, A., Singh, K., Kimbrel, J., Eloe-Fadrosh, E. A., Malmstrom, R. (…)2026-05-15
🦠 microbiology

A Bioinformatic Pipeline for Consensus Taxonomic Classification of Long-Read Amplicons

Het artikel introduceert de Amplicon Consensus Taxonomy (ACT)-pijplijn en de bijbehorende ACT-DB-referentiedatabase, een robuuste workflow die meerdere classificatietools integreert om een superieure taxonomische resolutie te bereiken voor Oxford Nanopore long-read amplicons door effectief nieuwe en laag-abundante taxa te identificeren en tegelijkertijd overclassificatie te minimaliseren.

Paulsen, A. A., LaSarre, B., Delp, D., Beattie, G. A., Halverson, L. J.2026-05-15