De microbiologie is de fascinerende wereld van het onzichtbare leven, waar we de microscopische organismen bestuderen die overal om ons heen aanwezig zijn. Van bacteriën en virussen tot schimmels en protozoa, deze kleine levensvormen spelen een cruciale rol in onze gezondheid, het milieu en zelfs de productie van voedsel. Op Gist.Science maken we de nieuwste inzichten uit dit dynamische veld toegankelijk voor iedereen, zonder dat je een doctoraat nodig hebt om de complexiteit te doorgronden.

Elke nieuwe preprint die op bioRxiv verschijnt binnen de microbiologie, wordt door ons team direct verwerkt. Wij bieden voor elk artikel zowel een begrijpelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische uitleg, zodat je zelf kunt kiezen hoe diep je wilt duiken in de wetenschap. Hieronder vind je de meest recente onderzoeken uit de microbiologie, direct uit de bron van bioRxiv.

A fungal pathogen effector that shapes host plant microbiota kills bacteria through lipoteichoic acid binding and membrane disruption

Deze studie onthult dat de schimmelpathogeen *Verticillium dahliae* het effectoreiwit VdAve1 gebruikt om bacteriën te doden door te binden aan lipoteichoïnezuur en het plasmamembraan te verstoren, waardoor de microbiota van de gastheer wordt gevormd om kolonisatie te vergemakkelijken.

Petti, G., Snelders, N., Rout, A., Wang, B., Koenig, K., Siersma, T., Biboy, J., Vollmer, W., Hamoen, L. W., Mesters, J., Friedrich, D., Mallagaray, A., Thomma, B.2026-05-26🦠 microbiology

Novel compounds derived from AR-12 that demonstrate host-directed clearance of intracellular Salmonella enterica Serovar Typhimurium

Door middel van een medicinale chemiecampagne die het AR-12-skelet optimaliseerde, ontwikkelden onderzoekers nieuwe analogen die de door de gastheer gemedieerde klaring van intracellulaire multiresistente *Salmonella* aanzienlijk verbeteren door de exploitatie van door de gastheer gemedieerde vesikeltransportsystemen door het pathogeen te verstoren, in plaats van te vertrouwen op directe antibacteriële activiteit.

Graham-Gurysh, E. G., Zahid, M. S. H., Varma, D. M., Landavazo, A., Namjoshi, O. A., Wilson, J. W., Johnson, M. M., Woodring, R. N., Hendricksen, A. T., Vath, J., Pino, E. N., Bachelder, E. M., Blough (…)2026-05-22🦠 microbiology

Eukaryotic domestication of a bacterial immune protein following horizontal transfer

Deze studie onthult hoe *Dictyostelium*-amoeven recentelijk het bacteriële immuunproteïne TIR-STING via horizontale overdracht hebben verworven en de krachtige NADase-activiteit ervan hebben gedomesticeerd tot een gereguleerd eukaryotisch celdoodmechanisme, waarmee een zeldzame inkijk wordt geboden in de evolutionaire overgang van bacteriële immuniteit naar eukaryotische fysiologie.

Culbertson, E. M., Cruz-Lorenzo, E., Leon Padilla, J., Halfmann, M., Drurey, J. R., Lange, J. J., Li, Y., Garlapati, N., Gompa, H., Morehouse, B. R., Halfmann, R., Levin, T. C.2026-05-22🦠 microbiology

The HOG MAPK - Transcription Factor CsAtf1 - CsErg5B Regulatory Module Mediates Conidial Germination and Fludioxonil Sensitivity in Colletotrichum siamense

Deze studie identificeert een nieuw HOG MAPK–CsAtf1–CsErg5B-regulerend as in *Colletotrichum siamense* dat hoge-osmolariteitssignalering koppelt aan ergosterol-homeostase, waardoor de kieming van conidiën en de gevoeligheid voor fludioxonil worden gereguleerd.

Lin, Y., Wang, K., Guan, X., Song, M., Han, Z., Liu, W., Wu, W., Zhang, Y., Miao, W., Lin, C.2026-05-22🦠 microbiology

Colonic epithelial regeneration shapes susceptibility to Clostridioides difficile infection

Deze studie onthult dat de vatbaarheid voor *Clostridioides difficile*-infectie wordt gedreven door een inductieve, M-achtige epitheelcelpopulatie die ontstaat tijdens colonaire regeneratie en ontsteking, en niet door ontsteking alleen, aangezien deze cellen cruciale genen voor toxine-interactie tot expressie brengen en fungeren als een herstelgerelateerde niche voor de pathogeen.

Gladden, A. D., Zucchi, P., Tai, A., Batorsky, R., Kumamoto, C. A.2026-05-22🦠 microbiology

A Field-Based Study of Phyllosphere Mycobiomes in Apple Orchards Under Varying Agricultural Management Strategies

Deze veldstudie toont aan dat landbouwbeheerstrategieën (conventioneel versus biologisch) de temporele dynamiek en samenstelling van schimmelgemeenschappen in de fylospheer van appels aanzienlijk beïnvloeden, waarbij duidelijke associaties met pathogenen en tegenstrijdige diversiteitstrends worden onthuld die de ecologische impact van boomgaardbeheer op plantgezondheid onderstrepen.

Boutin, S., Rondeau-Leclaire, J., Roy, A., Laforest-Lapointe, I.2026-05-21🦠 microbiology

CUPID-seq enables highly multiplexed amplicon sequencing via combinatorial in-line dual indexing

CUPID-seq is een sterk gemultiplexte amplicon-sequencingstrategie die combinatorische, gefaseerde, in-line dubbelindexering over twee PCR-rondes gebruikt om de kosten aanzienlijk te verlagen en de steekproefdoorvoer op sequentierplatforms met hoge capaciteit te verhogen, terwijl unieke steekproefidentificatie wordt behouden.

Fu, B., Porter, R. L., Shi, H., Ea, A. C., Espeleta, A. M., Ambat, A., Relman, D. A., Huang, K. C., Xue, K. S.2026-05-21🦠 microbiology

Rapid and Specific Identification of Emerging Trichophyton mentagrophytes Genotype VII Using an In-House Developed and Validated Real-Time PCR Assay

Deze studie presenteert een snelle, uiterst gevoelige en specifieke in-house TaqMan-gebaseerde real-time PCR-assay die het opkomende seksueel overdraagbare Trichophyton mentagrophytes-genotype VII succesvol onderscheidt van andere verwante schimmelpathogenen, en die een aanzienlijk sneller alternatief biedt voor traditionele sequentiemethoden voor verbeterde patiëntenzorg en infectiebestrijding.

Zhao, J., Todd, G., Zhu, Y. C., Chaturvedi, S.2026-05-21🦠 microbiology

Widespread circulation of West Nile and Usutu viruses in sedentary and migratory avifauna: A Two-Year Study (2024-2025) of active surveillance in South of France

Deze tweejarige studie (2024–2025) in Zuid-Frankrijk onthult een wijdverspreide circulatie van West-Nijl- en Usutu-virussen onder meer dan 2.500 stand- en trekvogels, waarbij de prevalentie van Usutu die van West-Nijl overtreft en de totale infectiepercentages in 2024 hoger waren, wat de kritieke rol van gemengde vogelgemeenschappen in het in stand houden van lokale enzootische cycli en de noodzaak van geïntegreerde, het hele jaar door lopende surveillance om zoönotische risico's te beperken, onderstreept.

Beaubaton, R., Revel, J., Pigeyre, L., Lepeule, A., Joly, J., de Franceschi, C., Charmantier, A., Vollot, B., Simonin, Y.2026-05-21🦠 microbiology

Prophage Abundance Differentiates Clinical and Environmental Isolates of Pseudomonas aeruginosa

Deze studie toont aan dat klinische isolaten van *Pseudomonas aeruginosa* worden gekenmerkt door kleinere genomen met een hoger GC-gehalte en een verminderde abundantie van intacte profagen in vergelijking met milieu-isolaten, wat suggereert dat deze genomische kenmerken handtekeningen zijn van specialisatie op de menselijke gastheer.

Targ, R. W., Blankenberg, P. M., Flamholz, Z., Pourtois, J. D., Burgener, E. B., Milla, C. E., Bollyky, P. L.2026-05-20🦠 microbiology