792 papers
Onderzoek toont aan dat extracellulaire vesikels van polymicrobiële gemeenschappen, zoals die vaak voorkomen bij cystische fibrose, de aangeboren immuunrespons van longepitheelcellen verstoren en ontstekingen verergeren, zelfs bij patiënten die behandeld worden met de modulatorterapie Trikafta.
Dit artikel introduceert PALM, een snelle en betrouwbare quasi-Poisson-regressieframework dat de ontdekking van microbioom-associaties in grootschalige studies en meta-analyses verbetert door de valse ontdekkingen te beheersen, de statistische power te vergroten en de computationele efficiëntie te optimaliseren.
Dit onderzoek bevestigt dat de schimmel *Pleurotus ostreatus*, gekweekt op diverse agro-afvalsubstraten in Nigeria, een veelbelovende bron is van nieuwe antifungale en bioactieve verbindingen, waarbij het type substraat de bioactiviteit aanzienlijk beïnvloedt.
Dit onderzoek toont aan dat polyfosfaat in cyanobacteriën fungeert als een architecturale regulator die de nucleoïde-structuur, de ruimtelijke organisatie van carboxysomen en de fotosynthetische efficiëntie koppelt.
Dit artikel introduceert Termini, een modificatiebewust AI-framework dat N- en C-terminale wijzigingen integreert om potentieel antimicrobiële peptiden te ontwerpen, wat resulteerde in een opmerkelijk hoog succespercentage van 92,5% bij in vitro-tests en bevestigde therapeutische werking in vivo.
Deze studie toont aan dat biologisch gesynthetiseerde zilvernanodeeltjes met een extract van Azadirachta indica-bladeren effectief zijn tegen multiresistente en ESBL-producerende E. coli-bacteriën, terwijl ze een lage toxiciteit vertonen voor menselijke niercellen.
Dit onderzoek onder 1.400 oudere volwassenen uit diverse etnische groepen toont aan dat de darmmicrobiota een cruciale rol speelt bij het verband tussen een hoge dieetkwaliteit (MIND-dieet) en verminderde ectopische vetophoping, waarbij specifieke bacteriële geslachten zoals *Lachnospiraceae* en *Lachnoclostridium* een significant deel van dit beschermende effect bemiddelen.
Dit onderzoek toont aan dat de IL-1-familie een cruciale rol speelt bij het initiëren van mucosale immuniteit tegen *Candida albicans* door antimicrobiële peptiden en neutrofielen te activeren, waardoor mucosale infecties worden beheerst en levensbedreigende systemische verspreiding, vooral bij neutropenische patiënten, wordt voorkomen.
Dit artikel introduceert LGTM, een probabilistisch model dat longitudinale microbiome-data analyseert door coherente microbiele ondergemeenschappen te ontdekken en hun dynamiek in de tijd en in relatie tot covariaten te modelleren, wat leidt tot betere interpretatie en voorspelling.
Uit een meerjarige experimentele studie in een mediterraan grasland blijkt dat verminderde neerslag de beweging van wortelafgeleid koolstof in de bodem beperkt en de microbiële gemeenschap concentreert, waardoor er meer microben actief koolstof opnemen en intensievere ecologische interacties ontstaan, wat een tot nu toe over het hoofd gezien mechanisme vormt dat de stabiliteit van organische bodemkoolstof beïnvloedt.
Deze studie toont aan dat een geconserveerde M16-peptidase in het darmbacterie *Bacteroides* de glucoseafhankelijke remming van de transcriptieregulator Cur bemiddelt via het opsporen van insuline en de regulatie van glycolytische enzymen, waardoor de bacterie's aanpassing aan een glucoserijk dieet en de interactie met de gastheer worden beïnvloed.
Deze studie presenteert een door structuur geleide pipeline die peptide-remmers ontwerpt die de virulentie en resistentie van de schimmel *Cryptococcus neoformans* onschadelijk maken door specifieke peptidases te blokkeren, waardoor de immuunafweer de infectie effectiever kan oplossen zonder de gastheercellen te beschadigen.
Deze studie onthult dat zandstranden een onderscheiden, continentale microbiële en virale biome vormen die voornamelijk wordt gestructureerd door getijdenzonatie, met een opmerkelijke hoge mate van genomische nieuwheid en metabolische diversiteit die essentieel zijn voor kustecosystemen.
In deze studie werd bewezen dat legumbaseerde media, afgeleid van sojabonen en erwten, een betrouwbaardere en effectievere methode bieden dan standaard kunstmatige media voor het induceren van sporulatie bij Cercospora-soorten die geassocieerd zijn met sojabonen.
Deze studie introduceert een gepoolde screeningsmethode die de identificatie van een nieuwe klasse chemoreceptoren in Pseudomonas-soorten mogelijk maakt, die specifiek korte C3-carboxylzuren waarnemen door middel van een vergrote bindingszak en veranderde flexibiliteit ten opzichte van formiaatreceptoren.
Dit onderzoek biedt een geünificeerd taxonomisch raamwerk voor het *Gardnerella*-genus door 312 genomen te analyseren, waarbij nieuwe soorten en ondersoorten worden gedefinieerd, evenals lineagespecifieke virulentie- en metabole factoren, nieuwe cryptische plasmiden en bacteriofagen worden ontdekt, en een basis wordt gelegd voor gerichte diagnostiek en therapieën bij bacteriële vaginose.
Deze studie toont aan dat de combinatie van *Azospirillum brasilense* Sp7 met cytidine of tomatenexsudaten de ziektegraad van tomaten veroorzaakt door *Pseudomonas syringae* aanzienlijk vermindert en de microbiële samenstelling in zowel de rhizosfeer als de fyllosfeer beïnvloedt, zonder dat dit gepaard gaat met een afname van het pathogeen in het bladweefsel.
Deze pilotstudie toont aan dat na een volledige uitwisseling van maaginhoud tussen Nederlandse Roodvee-koeien met lage en hoge methaanuitstoot, de lage-uitstoters hun oorspronkelijke microbioom herstellen terwijl de hoge-uitstoters het donor-microbioom behouden, wat suggereert dat gastheerfactoren de methaanproductie en microbiële reconstitutie beïnvloeden.
Deze studie toont aan dat het verrijken van probiotische yoghurt met *Lactobacillus plantarum* en *Stevia rebaudiana*-extract resulteert in een synbiotisch product met verbeterde antioxidatieve eigenschappen, een hogere eiwitwaarde en superieure sensorische kwaliteit.
Dit onderzoek schetst een compleet beeld van de functionele diversificatie en behoud binnen de QueC-eiwitfamilie (PF06508) door middel van sequentie- en genomische analyses, waarbij wordt aangetoond hoe dit evolutionaire skelet is hergebruikt voor uiteenlopende biologische rollen, variërend van tRNA-modificatie en cofactorbiosynthese tot anti-faagverdediging.