🦠 Category

microbiology

726 papers

De microbiologie is de fascinerende wereld van het onzichtbare leven, waar we de microscopische organismen bestuderen die overal om ons heen aanwezig zijn. Van bacteriën en virussen tot schimmels en protozoa, deze kleine levensvormen spelen een cruciale rol in onze gezondheid, het milieu en zelfs de productie van voedsel. Op Gist.Science maken we de nieuwste inzichten uit dit dynamische veld toegankelijk voor iedereen, zonder dat je een doctoraat nodig hebt om de complexiteit te doorgronden.

Elke nieuwe preprint die op bioRxiv verschijnt binnen de microbiologie, wordt door ons team direct verwerkt. Wij bieden voor elk artikel zowel een begrijpelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische uitleg, zodat je zelf kunt kiezen hoe diep je wilt duiken in de wetenschap. Hieronder vind je de meest recente onderzoeken uit de microbiologie, direct uit de bron van bioRxiv.

🦠 microbiologie

MetagenomicsBench: A Verifiable Benchmark for Agentic Metagenomics Analysis

Het artikel introduceert MetagenomicsBench, een verifieerbare benchmark bestaande uit 100 evaluaties over diverse metagenomische domeinen om de capaciteiten van AI-agenten bij het analyseren van real-world microbioomdata te beoordelen, waarbij wordt onthuld dat hoewel de sterkste configuraties een slagingspercentage van 60% bereiken, agenten vaak worstelen met probleeminterpretatie, statistische redenering en biologische interpretatie ondanks technische bekwaamheid.

Yang, Z., Connolly, J., Banerjee, A., Madad, S.2026-10-06
🦠 microbiologie

A Seed-Derived Multi-Kingdom Synthetic Community Enhances Radish Seedling Protection Against Alternaria brassicicola Abra43

Deze studie toont aan dat een synthetische microbiële gemeenschap uit meerdere rijken, afgeleid van radijstjes, in het bijzonder een combinatie van bacteriën, filamenteuze schimmels en gisten, zaailingen effectief beschermt tegen de schimmelpathogeen *Alternaria brassicicola* door de ziekte-incidentie te verminderen, groei te herstellen en pathogene kolonisatie te onderdrukken via complementaire ecologische functies.

GUSCHINSKAYA, N., Le Ruyet, A., Colou, J., Arnault, G., Guerrero Zepeda, I., Marais, C., Marchi, M., Suteau, L., Simonea (…)2026-10-03
🦠 microbiologie

Structure-Informed Stress-Testing of the Standard Numbering Scheme for Class B β-Lactamases Using AlphaFold2

Deze studie valideert de robuustheid van het Galleni-Garau standaard nummeringsschema (BBL) voor klasse B β\beta-lactamasen over 87 nieuw gemodelleerde families met behulp van AlphaFold2, waarbij de algemene toepasbaarheid wordt bevestigd terwijl een kleine subset van varianten met structurele divergenties wordt geïdentificeerd die experimentele opvolging rechtvaardigen.

Khan Niazi, M. M., Khan, H. A.2026-10-03
🦠 microbiologie

Comparative functional genomics of six Pectobacterium species reveals core and unique fitness determinants in potato tubers

Deze studie maakt gebruik van RB-TnSeq om conditioneel essentiële genen in zes Pectobacterium-soorten tijdens infectie van aardappelknollen te karakteriseren, waarbij zowel geconserveerde metabole vereisten als soortspecifieke fitnessdeterminanten worden onthuld die bijdragen aan de pathogeniteit van zachte rot.

Helmann, T. C., Karp, M. A., Daughtrey, M. L., Reid, L. E., Stodghill, P. V., Filiatrault, M. J.2026-10-03
🦠 microbiologie

Hiding in plain sight: rare Bacillus cereus group species are present among unassembled metagenomic samples in public databases

Deze studie onthult dat zeldzame soorten uit de *Bacillus cereus*-groep, die voorheen alleen bekend waren van enkele typestammen, geografisch meer verspreid zijn dan gedacht door het identificeren en assembleren van nieuwe metagenoom-geassembleerde genomen uit publieke databases, waardoor voor het eerst een beoordeling op stamniveau van hun functionele potentieel en evolutie mogelijk wordt gemaakt.

Ramnath, V., Raghuram, V., Carroll, L. M.2026-10-03
🦠 microbiologie

Evidence of active phage replication during vegetable fermentation and implications for the dynamics of bacterial communities

Deze studie toont aan dat hoewel actieve faagreplicatie de bacteriële successie tijdens groentefermentatie aanstuurt, het algehele fermentatieproces en de metabolietproductie veerkrachtig en stabiel blijven ondanks deze virale-bacteriële interacties.

Cantuti Gendre, J., Renault, M., Leforestier, A.-C., Marquet, G., Irlinger, F., Fouchard, N., Landaud, S., Le Marrec, C. (…)2026-10-03
🦠 microbiologie

A streamlined and abundant Nitrosopumilus population retains vitamin biosynthesis under high purifying selection in the Baltic Sea

Deze studie onthult dat een sterk gestroomlijnde *Nitrosopumilus*-populatie in de Oostzee aanzienlijke capaciteiten voor vitaminebiosynthese behoudt onder sterke zuiverende selectie, wat suggereert dat deze behouden paden evolutionair geconserveerd en ecologisch significant zijn voor zowel de producent als de bredere microbiële gemeenschap.

Pacheco-Valenciana, A., Speth, D. R., Wienhausen, G., Bruns, S., Wilkes, H., Andersson, A. F., Eren, A. M., Garcia, S. L (…)2026-10-03
🦠 microbiologie

A dichotomous family of Cache domain proteins evolved through c-type heme acquisition

Deze studie identificeert en karakteriseert een onderscheidende familie van Cache-domeineiwitten die is geëvolueerd door de verwerving van covalent gebonden c-type heem, waarmee een nieuw mechanisme voor de evolutie van bacteriële sensorische systemen wordt onthuld waarbij deze domeinen functioneren als stikstofoxide-sensoren of redoxregulatoren.

Deshpande, M., Xing, J., Gumerov, V. M., Dunleavy, R., Castillo, H., Crane, B. R., Zhulin, I. B.2026-10-01
🦠 microbiologie

Single-cell transcriptomics reveals life cycle and cell cycle gene expression dynamics during in vitro growth of two Leishmania species

Deze studie maakt gebruik van single-cell transcriptomics om de levenscyclus en de dynamiek van genexpressie tijdens de celcyclus van in vitro gekweekte *Leishmania major* en *L. mexicana* in kaart te brengen, waarbij soortspecifieke ontwikkelingsbanen worden onthuld en geconserveerde, door de celcyclus gereguleerde genen worden geïdentificeerd die ontwikkelingsovergangen koppelen aan specifieke fasen van de celcyclus.

Marques, C. A., Laidlaw, R. F., Warren, F., da Silva, G. L. A., Young, M., Crouch, K., Burchmore, R., Otto, T. D., Llewe (…)2026-09-30