📄 other

Establishing Lethal and Growth Reduction Doses of Fast Neutron Irradiated Cowpea [Vigna Unguiculata (L.) Walp.]

Deze studie bepaalde de mediaan dodelijke (LD₅₀) en groeireductie (GR₅₀) doses van snelle neutronenbestraling voor twee cowpeavariëteiten, waarbij werd vastgesteld dat SAMPEA 21 radiosensitiever is dan SAMPEA 20T en essentiële genotype-specifieke benchmarks biedt om mutatiekweekprotocollen te optimaliseren.

Ibrahim Ashiru, Umar U. Uwais, Ibrahim Halima, Almustapha Zakari, Abdullahi A. Dabo, Aminu Isyaku2026-07-24
📄 other

Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Dit artikel toont empirisch aan dat de statische gen-token embeddingruimte van het scGPT-fundamentiemodel detecteerbare, zij het matige, informatie over bekende fysieke eiwit-eiwitinteracties codeert, zoals blijkt uit significant hogere cosinusovereenkomsten en interactievoorspellingsmetrieken voor interagerende genparen vergeleken met niet-interagerende controles.

Liu Chen2026-07-24
📄 other

What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation

Een empirische analyse van menselijke pancreas single-cell RNA-sequencingdata demonstreert dat voor overvloedige, canonieke celtypen, celtype-annotatiemodellen robuust generaliseren over donoren met slechts bescheiden prestatieverliezen wanneer geëvalueerd via leave-one-donor-out vergeleken met willekeurige splitsing, wat de noodzaak onderstreept om expliciet de populatie en de technische reikwijdte te vermelden bij het claimen van kennis geëxtraheerd uit single-cell data.

Liu Chen2026-07-24
📄 other

When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization

Deze simulatiegebaseerde studie toont aan dat single-cell foundation models aanzienlijk beter presteren dan klassieke PCA-pipelines in taken met een schaarste aan labels (1–5 gelabelde cellen per klasse), maar weinig tot geen voordeel bieden ten opzichte van eenvoudige lineaire baselines wanneer er voldoende labels beschikbaar zijn of bij het voorspellen van reacties op nieuwe perturbaties.

Liu Chen2026-07-24
📄 other

Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology

Deze empirische analyse toont aan dat het beperken van kandidaatruimtes in benchmarks voor genregulatoire netwerken de rangschikking van methoden over verschillende weefsels aanzienlijk destabiliseert, wat aangeeft dat keuzes in de definitie van kandidaten de vergelijkende conclusies kunnen veranderen en gerapporteerd moeten worden naast de resultaten in plaats van als neutraal te worden beschouwd.

Liu Chen2026-07-24
📄 other

Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation

Deze studie onthult dat *Geobacter sulfurreducens* een sequentiële, tweefasige strategie voor extracellulaire elektronenoverdracht gebruikt waarbij het porine-cytochroomcomplex Om(abc)B eerst de energie-intensieve synthese van OmcS-nanowires mogelijk maakt, waardoor cellen kunnen overschakelen van een draadloze naar een bedrade modus die hun toegang tot Fe(III) voor replicatie drastisch uitbreidt.

Nikhil Malvankar, Joseph Erwin, Kejue Jia, Cong Shen, Vanessa Saldivar, Aldo Salazar Morales, Vasilije Pentalic, Fadel S (…)2026-07-24
📄 other

Efficiency of timber harvesting with a harvester in fir stands with designated and undesignated thinning

Dit onderzoek vond dat hoewel het oogsten van sparrenbestanden met niet-gespecificeerde uitdunning ongeveer 12% langer duurt dan met gespecificeerde uitdunning vanwege uitgebreidere machinebewegingen en zaagplanning, de mentale werkbelasting en concentratieniveaus van de operator in beide scenario's vergelijkbaar blijven.

Grzegorz Szewczyk, Paweł Tylek, Rafał Dyjach, Damian Najman, Tomasz Repak2026-07-24
📄 other

WITHDRAWN: Milk Quality and Associated Safety Risk Factors along the Fresh Milk Value Chain in Pastoral Communities of Yabello Town, Borana Zone, Southern Ethiopia

Dit artikel, dat oorspronkelijk de kwaliteit van melk en de veiligheidsrisico's in de pastorale gemeenschappen van Yabello Town, Ethiopië, onderzocht, is door de auteurs ingetrokken om te voldoen aan de regels voor preprints van instellingen en dient niet geciteerd te worden.

Hailu Lemma, Tadicha Bute, Lechisa Asefa, Israel Melaku, Assefa Asnakew, Girma Berhanu, Degefa Dhengesu, Habtamu Roba2026-07-24