Understanding the temperature response of biological systems: Part I -- Phenomenological descriptions and microscopic models

Dit artikel, het eerste deel van een tweedelige review, biedt een overzicht van fenomenologische modellen en microscopische theorieën die worden gebruikt om de afwijkingen van biologische reactiesnelheden van het eenvoudige Arrhenius-gedrag bij temperatuurveranderingen te beschrijven.

Simen Jacobs, Julian Voits, Nikita Frolov, Ulrich S. Schwarz, Lendert GelensWed, 11 Ma🧬 q-bio

Exploring Strategies for Personalized Radiation Therapy Part IV: An Interaction-Picture Approach to Quantifying the Abscopal Effect

Dit voorlopig onderzoek introduceert een interactiebeeld-methode, ontleend aan de kwantummechanica, om het abscopale effect bij gepersonaliseerde stralingstherapie (PULSAR) te kwantificeren als een continue, stochastische interactie tussen tumoren in plaats van een binaire respons, wat nieuwe inzichten biedt voor de optimalisatie van combinatietherapieën met immunotherapie.

Hao Peng, Laurentiu Pop, Kai Jiang, Faya Zhang, Debabrata Saha, Raquibul Hannan, Robert TimmermanWed, 11 Ma🧬 q-bio

Association of Radiologic PPFE Change with Mortality in Lung Cancer Screening Cohorts

De studie toont aan dat een progressieve toename van radiologisch vastgestelde pleuroparenchymale fibroelastose (PPFE) in twee grote longkankerscreeningscohorten onafhankelijk geassocieerd is met een verhoogde sterfte en nadelige klinische uitkomsten.

Shahab Aslani, Mehran Azimbagirad, Daryl Cheng, Daisuke Yamada, Ryoko Egashira, Adam Szmul, Justine Chan-Fook, Robert Chapman, Alfred Chung Pui So, Shanshan Wang, John McCabe, Tianqi Yang, Jose M Brenes, Eyjolfur Gudmundsson, The SUMMIT Consortium, Susan M. Astley, Daniel C. Alexander, Sam M. Janes, Joseph JacobWed, 11 Ma🧬 q-bio

Double projection for reconstructing dynamical systems: between stochastic and deterministic regimes

Deze paper introduceert een nieuwe 'double projection'-methode binnen dynamische variatie-automatische coderers om zowel systeemtrajecten als ruisreeksen te schatten uit data, wat leidt tot effectieve meervoudige-stapvoorspellingen en het leren van modellen met een lage-dimensionale toestandsruimte voor zowel stochastische als deterministische dynamische systemen.

Viktor Sip, Martin Breyton, Spase Petkoski, Viktor JirsaTue, 10 Ma🤖 cs.LG

Three-Dimensional Volumetric Reconstruction of Native Chilean Pollen via Lens-Free Digital In-line Holographic Microscopy

Deze studie presenteert een robuuste methode voor de driedimensionale volumetrische reconstructie en morfologische karakterisering van inheemse Chileense pollenkorrels met behulp van lenzeloze digitale inline holografische microscopie, waardoor nauwkeurige biophysieke parameters en digitale vingerafdrukken worden verkregen voor geautomatiseerde melissopalynologie.

J. Staforelli-Vivanco, V. Salamanca-Levi, R. Jofré-Cerda, M. Rondanelli-Reyes, I. LamasTue, 10 Ma🔬 physics.optics

HarmonyCell: Automating Single-Cell Perturbation Modeling under Semantic and Distribution Shifts

HarmonyCell is een end-to-end agentframework dat single-cell perturbatiestudies automatiseert door semantische heterogeniteit op te lossen met een door LLM-aangedreven semantic unifier en statistische heterogeniteit aan te pakken met een adaptieve Monte Carlo Tree Search-engine, waardoor schaalbaar virtueel celmodelleren mogelijk wordt zonder dataset-specifieke engineering.

Wenxuan Huang, Mingyu Tsoi, Yanhao Huang, Xinjie Mao, Xue Xia, Hao Wu, Jiaqi Wei, Yuejin Yang, Lang Yu, Cheng Tan, Xiang Zhang, Zhangyang Gao, Siqi SunTue, 10 Ma💻 cs

Distilling and Adapting: A Topology-Aware Framework for Zero-Shot Interaction Prediction in Multiplex Biological Networks

Deze paper introduceert een nieuw topology-bewust kader dat kennisdistillatie en contextbewuste representatielering combineert om zero-shot interactievoorspelling in multiplex biologische netwerken te verbeteren, waardoor de beperkingen van bestaande methoden worden overwonnen en de ontdekking van nieuwe biologische interacties voor gepersonaliseerde therapieën wordt bevorderd.

Alana Deng, Sugitha Janarthanan, Yan Sun, Zihao Jing, Pingzhao HuTue, 10 Ma🤖 cs.LG

Hydrodynamic origins of symmetric swimming strategies

Dit artikel toont aan dat ruimtelijke symmetrie een emergent organisatieprincipe is voor efficiënt zwemmen in viskeuze vloeistoffen, waarbij symmetrische en anti-symmetrische bewegingen hydrodynamisch equivalent zijn en optimale snelheden en efficiëntie bieden, wat de wijdverspreide aanwezigheid van symmetrische voortbewegingsstrategieën in de natuur verklaart als een fysisch optimaliteitsprincipe.

Takahiro Kanazawa, Kenta Ishimoto, Kyogo KawaguchiTue, 10 Ma🔬 physics

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

Dit artikel presenteert een datagedreven risicoframework dat de kans op overdracht van hoogpathogeen aviair influenza (HPAI) van wilde vogels naar rundvee in Denemarken kwantificeert, waarbij de hoogste risico's worden gelokaliseerd langs de kust en nabij de Duitse grens tijdens de wintermaanden.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio

Multi-factor modeling of chlorophyll-a in South China's subtropical reservoirs using long-term monitoring data for quantitative analysis

Deze studie analyseert langdurige monitoringgegevens uit drie reservoirs in Guangdong, China, om een dynamisch hydro-ecologisch model te ontwikkelen dat de niet-lineaire interacties tussen temperatuur, nutriënten en chlorofyl-a kwantificeert en aantoont dat stikstof een sterkere drijvende kracht is dan fosfor voor algenbloei in deze subtropische systemen.

Haizhao Guan, Yiyuan Niu, Chuanjin Zu, Ju KangThu, 12 Ma🧬 q-bio