🧬 Category

q-bio

4413 papers

🧬 biology

Multi-Omics Analysis of Global Transcriptomic, Proteomic, and Metabolomic Dysregulation Induced by Berberine in Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus

Deze studie maakt gebruik van een multi-omics benadering gecombineerd met moleculaire docking en in vivo modellen om te verduidelijken hoe berberine een synergetische anti-MRSA activiteit uitoefent door gelijktijdig de celwandsynthese te verstoren, het energiemetabolisme uit te putten en virulentie te verminderen door gericht te zijn op ScrR2, ATL en PBP4.

Xuemei Gu, Fangfang Zhou, Pengyuan Yang, Mingming Jiang, ming lin, Zhongbo Xiong, ying wang, Lei Wang2026-09-10
🧬 biology

A bibliometric analysis of artificial intelligence and machine learning in preclinical mesenchymal stem cell therapy and manufacturing from 2009 to 2025

Deze bibliometrische analyse van 144 documenten van 2009 tot 2025 onthult dat de toepassingen van kunstmatige intelligentie in mesenchymale stamceltherapie snel groeien maar overwegend preklinisch blijven, met een focus op karakterisering in plaats van op kwaliteitscontrole bij de productie of klinische vertaling, waardoor een kritiek gat wordt benadrukt in de potentie-voorspellende modellen die nodig zijn om het vakgebied richting de kliniek te brengen.

Aisha Al-Khinji, Dhafer Malouche2026-09-10
🧬 biology

Identifying Lipid Metabolites Influenced by Brefeldin A in Hepatocellular Carcinoma Cells Using Targeted Lipidomics

Deze studie maakte gebruik van gerichte lipidomica om aan te tonen dat behandeling met Brefeldine A het lipidenprofiel van HepG2 hepatocellulair carcinoomcellen significant verandert, met name door de niveaus van lysofosfatidylcholine en glycosylceramiden te verhogen, wat kan bijdragen aan de antitumorale activiteit ervan.

Yifan Zhao, Jinzhi Song, Ying Yang, Mengyi Duan, Yang Chen, Minfei Hou, Yuchao Hao, Xiaotong Ji, Jianying Bai2026-09-10
🧬 biology

Identifying Internally Reproducible Neural Biomarkers of Emotional Adaptability Through Quantitative EEG and Explainable Machine Learning

Deze studie toont aan dat kwantitatieve EEG gecombineerd met uitlegbare machine learning robuuste, intern reproduceerbare neurale biomarkers van emotionele adaptiviteit bij gezonde volwassenen kan identificeren, waarbij wordt onthuld dat het vermogen tot flexibele emotieregulatie wordt ondersteund door gecoördineerde oscillatoire dynamiek en frontopariëtale netwerkintegratie.

Amin Amini, Sahar Avazpour2026-09-10✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

Temporal Dynamics of Extracellular Oxidoreductase and Hydrolase Activities in a Microbial Consortium Exposed to Petroleum Hydrocarbons

Deze studie toont aan dat een gemengd microbieel consortium blootgesteld aan petroleum en diesel een meetbare, tijdsafhankelijke extracellulaire enzymatische respons vertoont die specifieke oxidoreductases en hydrolases omvat, wat het potentieel voor koolwaterstofbioremediatie bevestigt.

Vanessa Sales Ferreira, Izabella Maria Barros Bigi, Lucio Antonio Rocha Lima, Emily Jesus Araújo Santos, Antonio Fernand (…)2026-09-10
🧬 biology

Recognition of BCL-2-interacting killer by GRP78; in silico perspective

Deze studie maakt gebruik van een multi-level computationeel framework om te onthullen dat de uitgebreide R2-regio van BIK, gestabiliseerd door een kritieke zoutbrug met ARG439 op GRP78, dient als de primaire bindingsdeterminant in een dual-anchor mechanisme dat apoptose remt, wat suggereert dat ARG439 een veelbelovend therapeutisch doelwit is om celdood in borstkanker te herstellen.

Nada R. Abd Alhadiy, Yasser Y. Ebaid, Y. Mohammed, Abdo A. Elfiky2026-09-10
🧬 biology

Disentangling Loss Design and Ontology-Aware Architecture in GNN-Based Protein Function Prediction A Controlled Ablation Study

Deze gecontroleerde ablatiestudie onthult dat in GNN-gebaseerde eiwitfunctievoorspelling de voorgestelde Information Accretion-bewuste verliesfunctie contraproductief is, terwijl de optimale prestatie wordt bereikt door een GCN-architectuur te combineren met cross-ontologie aandacht en standaard binaire cross-entropieverlies.

Yongjin Chen, Xiyuan Wang, Yiman Gao, Songze Zhu2026-09-10
🧬 biology

H18 haemagglutinin binds MHC class II at a site distant from the canonical sialic-acid binding site

Deze studie onthult dat het aan vleermuizen afgeleide influenza H18 hemagglutinineine bindt aan MHC-klasse II-moleculen op een nieuwe plaats die verschilt van de canonieke sialinezuurzak, wat conformationele veranderingen induceert die virale fusie voorbereiden en de structurele adaptiviteit van het eiwit aantoont om eiwitreceptoren te gebruiken voor gastheerintreding.

Antoni Wrobel, Jonathan Robert, Maria Osman, Valeria Calvaresi, Benjamin Bouzabia, Selene Franchini, Sophie Focks, Liubo (…)2026-09-10
🧬 biology

Evaluating porcine antisense oligonucleotide RNA-seq for cross- species virtual-knockout benchmarking

Deze studie evalueert porciene antisense oligonucleotide RNA-seq data om de levensvatbaarheid van cross-species virtuele knockout-benchmarking te bepalen, waarbij wordt geconcludeerd dat hoewel whole-transcriptome scoring onbetrouwbaar is vanwege discrepanties in de estimator, leading-gene rank scoring reproduceerbaar is en een verdedigbaar doelwit biedt voor het uitbreiden van menselijke afgeleide perturbatiemodellen naar vee.

Xiaotong Zhao, Hua Chang, Zhuoyu Zhao, Xun Xiang2026-09-10
🧬 biology

Geographic Variation in the Urinary Microbiota of Patients with Urolithiasis

Deze grensoverschrijdende studie onthult dat hoewel de microbiële rijkdom in de urine vergelijkbaar is, de algehele gemeenschapscompositie en specifieke taxonomische abundanties bij patiënten met urolithiasis significant verschillen tussen Taiwan en Zuid-Korea, wat suggereert dat geografische en omgevingsfactoren onderscheidende urinaire microbiota-profielen vormen die geassocieerd zijn met steenziekte.

Hsiang Ying Lee, Chun Kai Chang, Wen-Jeng Wu, Deng‐Chyang Wu, Sung Yong Cho2026-09-10