🧬 Category

q-bio

4413 papers

🧬 biology

Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis Reveals the Biological Characteristics and Regulatory Mechanisms of Atypical Epithelium in Solid-Type Adenoid Cystic Carcinoma

Deze studie integreert single-cell en ruimtelijke transcriptomica om KRT81-positieve niet-klassieke epitheliale cellen te identificeren als een belangrijke maligne subpopulatie in solide type adenoid cystisch carcinoom die tumorprogressie aanstuurt via de MESP1/MACC1-as en immuunontwijking via de MIF-as.

Xiaotian Yuan, Lai Meng, Linwei Wu, Yan Fang, Dongge Li, Zirong Chen, Benjian Zhang, Yunqing Liu, Yaxuan Wang, Yongzhen (…)2026-09-09
🧬 biology

Glucose Metabolism-Related Crosstalk Genes Between Osteoporosis and Frozen Shoulder Identified by Integrated Bioinformatics and Machine Learning Reveal Shared Diagnostic Biomarkers and Immune Microenvironment Characteristics

Deze studie integreert bio-informatica en machine learning om vier glucosemetabolisme-gerelateerde crosstalk-genen (MARCKS, MAP3K1, LTF en ZMIZ1) te identificeren als gedeelde diagnostische biomarkers voor osteoporose en frozen shoulder, waarbij hun associatie met afzonderlijke immuunmicro-omgevingen en potentiële therapeutische doelwitten wordt onthuld.

Wei Hao, Long Fang, Baolong Wang, Ziwei Hou, Lizhong Jing, Jiushan Yang2026-09-09
🧬 biology

LINE-1 rewires GPR52 regulation in the rapid evolution of canine tameness

Deze studie identificeert een specifieke LINE-1 transponeerbaar element-insertie stroomopwaarts van het GPR52-gen als een cruciale regulatoire drijfveer die de snelle evolutie van tamheid bij honden heeft gefaciliteerd door de expressie van GPR52 te verhogen, waardoor de dreigingsrespons werd afgetemperd zonder brede gedragsverstoring te veroorzaken.

Hua Chen, Shilei Zhao, Yang Yang, Yanhu Liu, Yuedong Zhang, Suiyuan Yang, Zhong-Yin Zhou, Yun Yu, Bo-Wen Zhou, Lan Gao (…)2026-09-09
🧬 biology

Dynamic interaction balance control of relative abundances buffers community instability

Door empirische dynamische modellering toe te passen op langdurige aquatische microbiële gegevens, onthult deze studie dat gemeenschappen een dynamische stabiliteit behouden via een emergent mechanisme genaamd interactiebalanscontrole, waarbij subdominante soorten netto positieve interacties ervaren en dominante soorten netto negatieve interacties ervaren om abundantieschommelingen te bufferen.

Carmen García-Comas, Chun-Wei Chang, Judith Traver-Azuara, Caterina Giner, Ramiro Logares, Chih-hao Hsieh, Pedro Cermeño2026-09-09
🧬 biology

Structural insights into ligand-induced CARD assembly in inflammatory caspases

Deze studie identificeert het minimale peptide CBM7 als een chemisch gedefinieerde probe die een nieuwe flexibele filamentachtige CARD-assemblage induceert in inflammatoire caspasen, wat de gedeelde structurele mechanismen tussen peptide- en LPS-binding onthult die caspase-activatie en inflammatoire responsen aansturen.

Jae Jung, Zhongyi Jiang, Junbae Park, Youn Jung Choi, Stephanie Kim, Masaru Miyagi, Stephanie Leon Quinonez2026-09-09
🧬 biology

Bioactive Compounds in Persea americana var. Quintal Byproducts: Exploring Their Antioxidant Potential and Inhibitory Effects on LDL Oxidation, Lipid Peroxidation, and Nitric Oxide Production

Deze studie toont aan dat ethanolische extracten en organische fracties van bijproducten (schil en zaad) van *Persea americana* var. Quintal rijk zijn aan bioactieve verbindingen zoals procyanidinen en quercetine, die significante antioxidant-, anti-lipoperoxidatie- en stikstofoxide-inhiberende activiteiten vertonen zonder cytotoxiciteit, waardoor hun potentieel als natuurlijke therapeutische middelen voor oxidatieve stress-gerelateerde ziekten wordt benadrukt.

Maria Sol Peña Carrillo, Romário Divino Vilarinho Galvão, Ana Luiza Silva Borges, Vinícius Prado Bittar, Iasmin Aparecid (…)2026-09-09
🧬 biology

Investigation of Stress Granule-Associated Biomarkers (IGF1 and CDK2) and Their Regulatory Mechanisms in Alzheimer’s Disease: A Combined Transcriptomic, Bioinformatic and Experimental Study

Deze studie integreert transcriptomische analyse, machine learning en experimentele validatie om IGF1 en CDK2 te identificeren als potentiële biomarkers voor de ziekte van Alzheimer, waarbij een sterke diagnostische prestatie wordt aangetoond via een neuraal netwerkmodel en hun regulatoire mechanismen worden verduidelijkt door middel van miRNA-interacties en moleculaire docking, ondanks gedeeltelijke discrepanties in de validatie bij klinische monsters.

Milisha Wusiyin, Xinxue Wei, Xiaobei Liu, Aersi Aheizan, Abuduxukuer Maituzi, Rong Huang2026-09-09
🧬 biology

Phage-originated peptidoglycan hydrolase from Gammaproteobacterium bacterium: Does the guest serve the host?

Dit artikel karakteriseert GammaM15, een nieuwe fage-afgeleide peptidoglycaanhydrolase uit een mariene Gammaproteobacterie die zowel zink- als calciumionen vereist voor een juiste vouwing en lytische activiteit, en bespreekt de potentiële rol ervan in de levenscyclus van de gastheerbacterie.

Galina V. Mikoulinskaia, Sergei V. Chernyshov, Bogdan S. Melnik, Dmitry A. Prokhorov, Vladimir N. Uversky2026-09-09
🧬 biology

Genome-wide Identification and Characterization of the 3- Dehydroquinate Dehydratase/Shikimate Dehydrogenase Gene Family in Rubus chingii Hu

Deze studie heeft systematisch de vierledige RcDHD/SDH-genfamilie in *Rubus chingii* geïdentificeerd en gekarakteriseerd, waarbij de structurele kenmerken, weefselspecifieke expressiepatronen en een sterke correlatie tussen hun expressie tijdens de vroege vruchtontwikkeling en de accumulatie van gallus- en ellagzuur werden onthuld.

Xueli An, Yuezhen Li, Yating Gong, Nana Feng, Bowei He, Dongfeng Yang, Hongfa Li, Jianhong Chen, Zhuoni Hou, Zongsuo Lia (…)2026-09-09
🧬 biology

Digestion and Gut-Modulating Functions of Six Dietary Oils: A Multi-Omics- Based Investigation into Oxidative Stability, Gas Production Profiles, and Microbiota Shifts

Deze multi-omics studie maakt gebruik van een in vitro digestiemodel om aan te tonen dat de oxidatieve stabiliteit, de profielen van gasproductie in de dikdarm en de verschuivingen in de darmmicrobiota van zes dieetoliën onderscheidend worden bepaald door hun vetzuursamenstelling, waarbij wordt onthuld dat meervoudig onverzadigde oliën zoals vis- en ARA-olie leiden tot een hogere gasproductie en specifieke bacteriële proliferatie vergeleken met de mildere fermentatie-effecten van olijf- en camelioliën.

Yating Wang, Shuya Chen, Jintian Chen, Xixian Lv, Yin Yin, Wenxuan Yan, Zepeng Chang, Minjie Gao, Shiwei Song, Zhitao Li (…)2026-09-09