🧬 Category

q-bio

1504 papers

🧬 biology

Integrated Multi-Omics Analysis of Lung Adenocarcinoma (TCGA-LUAD): A Comprehensive Study of Genomic, Epigenomic, Copy Number Variations, and Transcriptomic Alterations

Deze studie maakt gebruik van een geïntegreerde multi-omics analyse van TCGA-LUAD data gecombineerd met machine learning en netwerkanalyse om vijf prognostische biomarkers (BIRC3, PSMB1, PSMA4, PSMC4 en TNFRSF12A) te identificeren en te valideren die significant geassocieerd zijn met een slechte algehele overleving bij longadenocarcinoom, ondanks dat zij een beperkte diagnostische bruikbaarheid vertonen.

Gautham Pasupuleti, Jeevan V S, Varsha Pandit, Srimathi Bai, Aryanil Dey, Subhuam Tangar, Sharon George2026-06-25
🧬 biology

Frequency-Dependent Impact of Arterial Wall Compliance on Hemodynamic Predictions: A Fluid–Structure Interaction Study

Deze studie toont aan dat het verwaarlozen van de compliantie van de arteriële wand in cardiovasculaire simulaties frequentieafhankelijke fouten introduceert die progressief toenemen met de hartslag, aangezien rigide wandmodellen er niet in slagen de door compliantie gedreven opslag- en dempingsmechanismen te vatten die essentieel zijn voor nauwkeurige hemodynamische voorspellingen.

Jan Šimkovský, Hana Schmirlerová, Lukáš Horný2026-06-25
🧬 biology

Riemannian geometry meets fMRI: the advantages of modeling correlation manifolds and eigenvector subspaces

Dit artikel introduceert een schaalbaar geometrisch raamwerk dat gebruikmaakt van de Off–log metriek voor correlatiematrices en Grassmanniaanse subruimte-discriminatie voor eigenvectoranalyse om de sensitiviteit en voorspellende prestaties van op fMRI gebaseerde hersennetwerkmodellering te verbeteren, terwijl de compatibiliteit met standaard machine learning-workflows behouden blijft.

Mario Severino, Manuela Moretto, Robert McCutcheon, Mattia Veronese2026-06-25
🧬 biology

AI-Driven Lumped-Element Modeling of Human Respiratory System for Studying Voice Mechanics

Dit artikel presenteert een nieuw AI-gestuurd, natuurkundig gebaseerd lumped-element-model dat met deep learning geëxtraheerde stembanddynamiek integreert met een veer-demper-massa-representatie van het respiratoire systeem om stemproductie te simuleren en niet-invasief meetbare parameters zoals subglottale druk en energiemegentransportmechanismen te voorspellen.

Maruf Md Ik, Maryam Naghibolhosseini, Mohsen Zayernouri2026-06-25
🧬 biology

PltScanner: A Lightweight Classifier for Accurate Platelet Annotation and Heterogeneity Discovery in scRNA-seq Data

Het artikel introduceert PltScanner, een lichtgewicht ensemble-classifier die nauwkeurig misannotaties van bloedplaatjes in scRNA-seq-data identificeert en corrigeert, terwijl het hun functionele heterogeniteit en interacties binnen complexe weefselmicro-omgevingen onthult.

Huaichao Luo, Ziru Huang, Zixuan Zhang, Gui-Yan Xie, Ruiling Zu, Sisi Yu, Lubei Rao, Dongsheng Wang2026-06-25
🧬 biology

Disentangling conformational and compositional heterogeneity for cryo-EM reconstruction via decoupled Gaussian mixture models

Het artikel introduceert CryoDCOV, een deep-learningframework dat ontkoppelde Gaussian mixture-modellen gebruikt om conformationele en compositionele heterogeniteit in cryo-EM-data effectief te scheiden en te reconstrueren, waardoor de generatie van hoogwaardige, interpreteerbare 3D-structuren van dynamische macromoleculaire ensembles mogelijk wordt gemaakt.

Manhua Liu, Yue Huang2026-06-25
🧬 biology

Integrating genomic tools into ex situ conservation management of caribou (Rangifer tarandus) in Canada

Deze studie demonstreert de succesvolle toepassing van een 63K SNP-array om 49 kariboes in Canadese zoologische instellingen te genotyperen, wat de eerste moleculaire karakterisering biedt van deze beheerde populatie om fokstrategieën te optimaliseren, genetische diversiteit te behouden en toekomstige herintroductie in het wild te ondersteunen.

Vanessa E. Luzuriaga-Aveiga, Julien Prunier, Claude Robert, Paula Mackie, Gabriela F. Mastromonaco2026-06-25
🧬 biology

Population genetics and infection dynamics of Phocanema krabbei and P. decipiens (Nematoda: Anisakidae) in commercially exploited fish from the Northeast Atlantic

Deze studie biedt de eerste uitgebreide beoordeling van *Phocanema krabbei*- en *P. decipiens*-infecties in vis uit de Noordoost-Atlantische Oceaan, waarbij wordt onthuld dat *P. krabbei* de regio domineert met een enkele panmictische populatie, voornamelijk *Lophius*-soorten infecteert en een voorkeur heeft voor spierweefsel, terwijl het belangrijke implicaties voor de volksgezondheid en de economie voor de visindustrie benadrukt.

Andrea Ramilo, Helena Rodríguez, Santiago Pascual, Elvira Abollo2026-06-25
🧬 biology

Gelsolin: A Potential Prognostic Biomarker Linked to Immune Infiltration in Colon Adenocarcino

Deze studie identificeert Gelsoline (GSN) als een downgereguleerde prognostische biomarker bij colonadenocarcinoom, waarbij wordt aangetoond dat de verminderde expressie ervan correleert met een slechtere overleving van patiënten, significante immuuncelinfiltratie en verlaagde serumspiegels, wat ervan suggereert dat het potentieel nuttig is als diagnostische marker en neoantigeen voor gerichte therapie.

ZHUOYU CHEN, shunwang cao, fanyi huang, yuanqi li, jiawen tian, minjuan liu, shuyu chen, lingfan yin2026-06-25