🧬 Category

q-bio

4605 papers

🧬 biology

GRP: A Representation-Aware Effective Geometry of Protein State Space

Dit artikel introduceert GRP, een door de algemene relativiteitstheorie geïnspireerd raamwerk dat eiwittoestandsruimten modelleert als coördinaatbewuste geometrische manifolds om stabiele invarianten te identificeren die AI-representaties koppelen aan biologische beperkingen, waarbij wordt aangetoond dat enkele dominante modi het grootste deel van de conformationele variantie vastleggen en dat gestructureerde biologische paden andere transporteigenschappen vertonen dan nulmodellen.

Chuanyang Liu2026-09-01
🧬 biology

Chromosome-level genome of the white jade snail reveals conserved genomic architecture and functional divergence from wild Achatina fulica

Deze studie presenteert de eerste genoomassemblage op chromosoomniveau van de gekweekte witte jade-slak, die de nauwe fylogenetische relatie en geconserveerde syntenie met de wilde Afrikaanse reuzeslak (*Achatina fulica* respectievelijk) onthult, terwijl het functionele divergenties in metabole en stressrespons-paden benadrukt die geassocieerd zijn met domesticatie.

Hai Liu2026-09-01
🧬 biology

Illiosentis furcatus (Acanthocephala: Leptorhynchoididae): Morphological study, molecular characterization, and phylogenetic analysis justify reinstatement of Tegorhynchus cetratus

Deze studie combineert morfologische examinatie en moleculaire fylogenetische analyse om aan te tonen dat *Illiosentis cetratus* genetisch onderscheidend is van andere *Illiosentis*-soorten, waarmee de herinstelling van het genus *Tegorhynchus* voor deze soort wordt gerechtvaardigd.

Kaitlynn M. Stewart, Kristina M. Hill-Spanik, Eric J. McElroy, Isaure de Buron2026-09-01
🧬 biology

Dopaminergic Degeneration and GBA Mutation Status Predict Prior–Sensory Arbitration Disruption in Parkinson's Disease: A Multimodal Computational Framework

Deze multimodale computationele studie van de PPMI-dataset suggereert dat hallucinaties bij de ziekte van Parkinson voortkomen uit een progressieve verstoring in de arbitrage tussen sensorische bewijslast en voorafgaande verwachtingen, gekenmerkt door een verminderde sensorische gevoeligheid en een toename van door ruis gedreven vals alarm die sterk worden voorspeld door dopaminerge degeneratie en GBA-mutatiestatus, ondanks significante beperkingen in het nauwkeurig schatten van de kernparameter van de arbitrage vanuit gedragsgegevens van een enkel bezoek.

Khanh-Dung Tran2026-09-01
🧬 biology

Intracavity Nuclear Elastography

Dit artikel introduceert intracavitaire nucleaire elastografie, een niet-lineair detectieplatform dat levende cellen integreert in een microcaviteitslaser om minuscule door ultrasone golven geïnduceerde nucleaire deformaties te versterken via bifurcatiedynamica, waarbij een meer dan 120 keer hogere gevoeligheid wordt bereikt dan conventionele methoden voor kwantitatieve, niet-invasieve mapping van nucleaire mechanica en multidimensionale cellulaire fenotypering.

Chaoyang Gong, Zhonghao Li, Zhihan Cai, Guifeng Li, Guoquan Wang, Yue Zhao, Xi Yang, Yuan Gong, Hong Zhang, Yang Luo, Ta (…)2026-09-01
🧬 biology

An epigenetically stabilized regulatory state underlies stable glioblastoma invasion

Deze studie toont aan dat glioblastoominvasie kan worden gehandhaafd als een stabiele, celintrinsieke regulatoire staat die wordt gedreven door gecoördineerde epigenetische remodellering en transcriptiefactorennetwerken (specifiek ATF4 en MYC/MAX), wat de overleving van patiënten significant stratificeert en potentiële therapeutische doelwitten biedt.

Ann-Christin Hau, Tanja Buhlmann, Sophie Schreiner, Camille Cialini, Vera Laub, Petr Nazarov, Arnaud Muller, Kimia Kafi (…)2026-09-01
🧬 biology

Gut Microbiome Composition of Wild and Captive Black Capuchin Monkeys (Sapajus nigritus)

Deze studie toont aan dat de samenstelling van het darmmicrobioom en het voorspelde functionele potentieel van wilde en in gevangenschap gehouden zwarte kapucijnapen significant verschillen, waarbij individuen in gevangenschap een grotere microbiële rijkdom en afwijkende taxonomische en metabole profielen vertonen, waarschijnlijk gedreven door verschillen in dieet, omgeving en huisvestingsomstandigheden.

Tiela Trapp Grassotti, Cecile Jacry, Manuela Gamarra Cassol, Michele Bertoni Mann, Aline Alves Scarpellini Campos, Jever (…)2026-09-01
🧬 biology

Integrated Exon and Intron Splicing Analysis Identifies Novel GAS5 and PVT1 Regulatory Junctions in Esophageal Adenocarcinoma

Deze studie maakt gebruik van een reproduceerbare geïntegreerde splicing-analysepipeline op RNA-seq-data van esofagusadenocarcinoom om nieuwe, ondergerapporteerde regulatoire splicing-junctions in de niet-coderende RNA's GAS5 en PVT1 te identificeren die afwezig zijn in bestaande TCGA- en GTEx-catalogi, waardoor een nieuw kader wordt geboden voor het onderzoeken van niet-coderende splicing-alteraties bij deze ziekte.

John Mathew Manipadam2026-09-01
🧬 biology

ML-Assisted Cognitive Characterization of Human Problem Solving Behaviors through Visuo-Spatial Game

Deze studie maakte gebruik van een ensemble-gebaseerde Random Forest-classificator en -regressor op oogbewegingsdata van een visuo-spatiële game om spelers succesvol te categoriseren in onderscheidende gedragsgroepen, waarbij zij onderscheid maakten tussen oplossers (experts en volhardende spelers) en niet-oplossers (probers en stoppers) op basis van hun blik- en gameplaypatronen.

Dipshikha Podder, Sonali Aatrai, Aritra Hazra, Rajlakshmi Guha, Partha Pratim Chakrabarti2026-09-01