🧬 biology

PLD4, CD247, and TREM2 as Phagocytosis-Related Biomarkers in Traumatic Brain Injury Identified by Integrated Transcriptomics and Single-Cell Sequencing

Door middel van geïntegreerde transcriptomica, single-cell sequencing en experimentele validatie identificeert deze studie TREM2, PLD4 en CD247 als belangrijke fagocytose-gerelateerde biomarkers bij traumatisch hersenletsel, waarbij een nieuwe rol voor PLD4+ NKT-cellen in post-letsel immunometabole herprogrammering wordt benadrukt.

Hongling Wen, Rui Zhang, Fang Zhou, Xiaodi Tan, Shengjiao Lan, Longjiu Zhang, Jiangquan Fu2026-08-31
🧬 biology

Genetic diversity, phylogeny, and population structure of Leishmania isolates from cutaneous leishmaniasis patients in Ethiopia

Deze studie onthult dat cutane leishmaniasis in Ethiopië wordt gedreven door een complexe, multispecies etiologie die gedomineerd wordt door genetisch diverse *Leishmania aethiopica* met tekenen van recente demografische expansie, naast een significante minderheid van *L. donovani*-complex en *L. tropica*-isolaten, wat de noodzaak voor verbeterde moleculaire surveillance onderstreept om het klinisch beheer te sturen.

Girma Shumie, Jose Carlos Solana, Nigatu Negash, Arantxa Marco, Eshetu Molla, Galana Mamo Ayana, Adisu Asefa, Amanuel Al (…)2026-08-31
🧬 biology

Splicing-derived dual-class MHC neoantigens as candidate biomarkers in melanoma anti-PD-1 response: a pre-registered three-cohort analysis

Deze vooraf geregistreerde drie-cohort analyse toont aan dat splicing-afgeleide neoantigenen die in staat zijn om zowel MHC-klasse I als II moleculen te binden, een afzonderlijke, TMB-orthogonale biomarker-as vormen die de overlevingsuitkomsten voorspelt bij melanoma-patiënten die behandeld worden met anti-PD-1 therapie, hetgeen prospectieve validatie rechtvaardigt.

Zulkarnain Sajid2026-08-31
🧬 biology

Global genomic analysis reveals structured redundancy and complementarity in ex situ barley conservation

Door genomische gegevens van meer dan 36.000 gerstaccessies uit 14 genbanken te integreren, onthult deze studie dat de wereldwijde ex situ conservering een onderling verbonden systeem vormt dat wordt gekenmerkt door wijdverspreide, gestructureerde redundantie en een lage differentiatie tussen instellingen, wat wijst op afnemende meeropbrengsten bij aanvullende bemonstering van vergelijkbare genotypes.

Martin Mascher, Max Haupt, Paulina Bolc, Matilda Ciucă, Daniel Cristina, Gouripriya Davuluri, Anne Fiebig, Mika Hamaoka (…)2026-08-31
🧬 biology

Downregulation of Acetyl-CoA Synthetase gene Triggers an Energy Crisis in Monascus fuliginosus M1: Impaired Hyphal Growth Coupled with Adaptive Sporulation Surge via Oxidative Phosphorylation Suppression

De downregulatie van het acetyl-CoA-synthetase (ACS)-gen in *Monascus fuliginosus* veroorzaakt een energiecrisis door de oxidatieve fosforylering te onderdrukken, wat de myceliale groei remt terwijl het tegelijkertijd sporulatie bevordert als een adaptieve overlevingsstrategie.

Lin Lin, Na Zhang, Yuxuan Tian, Lingyu Zhao, Jie Bai2026-08-31
🧬 biology

A Hybrid Computer Vision and AI Framework for Wildlife Hospital Patient Identification Systems: Kangaroo Facial Recognition as a Case Study

Deze studie stelt een door AI gedreven framework voor en evalueert de integratie van computer vision en deep metric learning om de identificatie van oostelijke grijze kangoeroes in wildopvangziekenhuizen te automatiseren, waarmee een schaalbare en niet-invasieve oplossing wordt geboden om de beperkingen van huidige handmatige identificatiemethoden te overwinnen.

Xin Yiing Loo, Xiaodan Dong, Steve Garlick2026-08-31
🧬 biology

PRRI: Plasmid Resistance Risk Index Prioritizing Clinically Relevant Plasmid-Associated Antimicrobial Resistant Genes in the Human Gut

De studie introduceert de Plasmid Resistance Risk Index (PRRI), een raamwerk dat klinisch relevante, door plasmiden geassocieerde antimicrobiële resistentiegenen in het menselijke darmmicrobioom prioriteert door ze te scoren op ernst en zeldzaamheid, waarbij wordt onthuld dat een kleine subset van hoog-impactvolle, zeldzame genen een aanzienlijk overdraagbaar risico vormt ondanks een lage algehele abundantie.

Ankish Arya, Sankalp Patil, Prabhat Tripathi, Nidhi Dubey, Pritish Kumar Varadwaj2026-08-31
🧬 biology

Phenotypic and Molecular Characterization of a Novel blaKPC-202 Variant, Capable of Reverting to blaKPC-2 In Vitro in a Clinical Klebsiella pneumoniae Isolate

Deze studie karakteriseert een nieuwe *Klebsiella pneumoniae*-isolaat die de *bla*KPC-20 variant herbergt, welke resistentie tegen ceftazidim–avibactam en meropenem-heteroresistentie verleent door middel van een unieke 30-bp tandeminsertie die in vitro spontaan kan terugkeren naar het *bla*KPC-2 genotype, wat de evolutionaire plasticiteit van KPC-enzymen en de noodzaak voor verbeterde surveillance onderstreept.

Qing Chen, Kang Xu, Linlin Xu, Lianyan Xie, Shuzhen Xiao, Jingyong Sun2026-08-31
🧬 biology

Do Pathology Foundation Models Learn Biology? Uncertainty-Based Evaluation on AML Cytomorphology

Deze studie toont aan dat hoewel algemene visiemodellen de pathologiespecifieke foundation-modellen kunnen overtreffen op standaard clustering-metrieken, het vermogen van de laatste om biologisch betekenisvolle structuren te vangen beter wordt onthuld door stabiele onzekerheidspatronen die onderscheid maken tussen celrijpheidsstadia in acute myeloïde leukemie.

Aadil Bhat, Sajad Kawa, Mohammad Munzir2026-08-31
🧬 biology

Chromosome-scale genome assembly and population genomic analysis of Phomopsis asparagi pathogen reveal genetic diversity among geographical populations

Deze studie presenteert een hoogwaardige chromosoomschaal-genoomassemblage van de aspergepathogeen *Phomopsis asparagi* en een uitgebreide populatiegenomische analyse van Chinese isolaten, die een significante genetische diversiteit onthult en kandidaat-genen identificeert die gekoppeld zijn aan fenotypische variatie om toekomstige ziektebeheersingsstrategieën te ondersteunen.

Yu Shi, Chun-Xia Yang, Hao-Han Ning, Yi-Ran Wang, Yuan Wang, Guo-Bing Cui, Wu-Jun Gao, Shu-Fen Li2026-08-31