🧬 Category

q-bio

4605 papers

🧬 biology

Longitudinal molecular and serological surveillance of elephant endotheliotropic herpesviruses through relocation in a captive herd of Asian elephants (Elephas maximus)

Deze tweejarige longitudinale studie naar negen in gevangenschap gehouden Aziatische olifanten die een verplaatsing ondergaan, toont aan dat het combineren van serologische testen met surveillance via snuitspoelingen waardevolle inzichten biedt in EEHV-blootstelling en vatbaarheid, waarbij wordt onthuld dat virale uitscheiding in snuitspoelingen vaak voorafgaat aan viraemie en dat antilichaamniveaus kunnen toenemen als reactie op een systemische infectie.

Jack W. Wheelahan, Peter Münster, Paola K. Vaz, Alistair R. Legione, Sally J. Gazzard, Bonnie McMeekin, Willem Schaftern (…)2026-08-31
🧬 biology

Beavers on the selection-drift seesaw: imprints of the past and present-day processes on the MHC genes variability in the Eurasian beaver

Deze studie toont aan dat de variabiliteit van het MHC-gen van de Euraziatische bever werd gevormd door historische positieve en balancerende selectie, ernstig werd verminderd door een populatiebottleneck in de 20e eeuw, en slechts gedeeltelijk is hersteld door recente expansie zonder bewijs van huidige selectie.

Jan Náhlovský, Marco Heurich, Steven K. Windels, Frank N. Rosell, Christian A. Robstad, Alexander P. Saveljev, Aleš Vore (…)2026-08-31
🧬 biology

Long-Term Seagrass Decline and Spatial Reorganization of Blue Crabs in the Indian River Lagoon

Langdurig verlies van zeegras in de Indian River Lagoon, gedreven door nutriëntenverrijking en klimatologische gebeurtenissen, heeft gezorgd voor een significante afname van de abundantie en grootte van blauwe krabben en heeft een ruimtelijke reorganisatie van populaties naar het zuidelijke deel van de lagune getriggerd, wat het cruciale belang van de afhankelijkheid van blauwe krabben van continue begroeide kraamhabitats benadrukt.

Jackson L. Evans, Hyun Jung Cho2026-08-31
🧬 biology

Evaluating Computational Tools for CRISPR-Cas9 Design: A Case Study on the TP53 Gene

Deze studie evalueert drie populaire CRISPR-Cas9 gRNA-ontwerptools (CHOPCHOP, Benchling en IDT) gericht op het TP53-gen, waarbij significante discrepanties in hun hoogst gerangschikte kandidaten worden onthuld als gevolg van verschillende score-algoritmen, wat de noodzaak van cross-validatie via meerdere platforms onderstreept voor effectief ontwerp van gen-knockout.

Mara Ioana Manolescu, Bogdan Emil Manolescu2026-08-31
🧬 biology

Proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens reveals candidate intraoperative diagnostic biomarkers for Hirschsprung disease

Deze studie maakte gebruik van proteomische profilering van met formaline gefixeerd en in paraffine ingebed weefsel om vier nieuwe kandidaat-biomarkers (CTNNA2, EPDR1, NACAD en NCAM2) te identificeren die specifiek tot expressie komen in gangliënregio's, wat veelbelovende instrumenten biedt voor de intraoperatieve diagnose van de ziekte van Hirschsprung.

Shigemitsu Kojima, Ayako Yamazaki, Masahito Yoshihara, Ryo Konno, Kenichiro Konishi, Shinya Takazawa, Akira Nishi, Jun F (…)2026-08-31
🧬 biology

Context-aware LLM extraction and controlled-vocabulary normalization of GEO transcriptomic sample metadata

Dit artikel presenteert een lokaal inzetbare large language model-pipeline die ongestructureerde GEO-transcriptomische metadata extraheert en normaliseert naar gestructureerde labels met een gecontroleerde vocabulaire voor weefsel, conditie en behandeling, waarbij een hoge nauwkeurigheid wordt bereikt en deterministische matchingsmethoden aanzienlijk wordt overtroffen.

Mateusz Szczepaniak, Jonathan Wren2026-08-31
🧬 biology

Associations between bacteriome and chemical pollutants in indoor dust from Czech households

Deze studie analyseert binnenstof uit 88 Tsjechische huishoudens om significante associaties te onthullen tussen specifieke bacteriële genera, zoals *Methylobacterium-Methylorubrum* en *Sphingomonas*, en diverse chemische verontreinigingen zoals PAK's en PBDE's, wat suggereert dat interacties tussen biologische en chemische contaminanten de gezondheidsrisico's binnenshuis kunnen veranderen, ondanks de noodzaak van verder mechanistisch onderzoek om causaliteit vast te stellen.

Klvanova Eva, Jan Böhm, Paula Marcinekova, Lisa Melymuk, Petr Kukacka, Petr Senk, Jakub Martinik, Petra Pribylova, Simon (…)2026-08-31
🧬 biology

Comprehensive Comparative Evaluation and Consensus Strategy for CRISPR/Cas9 gRNA Design Targeting the TaDREB1 Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum)

Deze studie stelt een robuuste consensusstrategie vast voor CRISPR/Cas9 gRNA-ontwerp in broodtarwe door vijf voorspellingsinstrumenten gericht op het TaDREB1-gen te vergelijken om een zeer betrouwbare gidssequentie te identificeren en kritieke beperkingen in de huidige algoritmische outputs te belichten.

Tarek Osama Mohamed Amin, Ghufran Siddiq2026-08-31