q-bio papers | Gist.Science

A leakage-controlled evaluation framework for ontology-grounded semantic representations of single-cell clusters

Dit artikel introduceert een op lekken gecontroleerd evaluatiekader dat aantoont dat bevroren, op ontologie gebaseerde semantische representaties van single-cell clusters consistent beter presteren dan gennaam-embeddings over externe datasets heen, terwijl onbeperkte door LLM gegenereerde interpretaties en post hoc afstemming geen robuuste waarde bieden zodra methodologische vooroordelen zijn geëlimineerd.

Mohamed KONE, Gaoussou HAIDARA, Chao HOU, Shulin Wang2026-08-13

🧬 biology

Decoding Glycolysis Mechanisms and Cellular Heterogeneity in Intervertebral Disc Degeneration via scRNA-seq and Bulk RNA-seq

Deze studie integreert bulk- en single-cell RNA-sequencing om te onthullen dat glycolytische herprogrammering intervertebrale discusdegeneratie aandrijft via cellulaire heterogeniteit, waarbij FOS en CEBPB worden geïdentificeerd als belangrijke opgereguleerde regulatoire genen die dienen als veelbelovende diagnostische biomarkers en therapeutische doelwitten.

Liangzeng Huang, Xindi Bian, Yunbing Jia, Hongwei Li, Yong Yang, Xuewen Kang2026-08-13

🧬 biology

Integrative Taxonomic and Chemotaxonomic Authentication of Ageratum conyzoides and Conoclinium coelestinum (Asteraceae): The Pharmacological Annotation Diagnostic Key (PADK), a Reproducible Chemotaxonomic Framework

Deze studie introduceert de Pharmacological Annotation Diagnostic Key (PADK), een reproduceerbaar integratief kader dat met succes de morfologisch convergente medicinale soorten *Ageratum conyzoides* en *Conoclinium coelestinum* authenticeert door middel van convergerend bewijs uit morfologie, anatomie, chemotaxonomie en uit de literatuur afgeleide farmacologische profielen.

Ozioma Michael, O. M. Agbogidi, A. H. Erhenhi2026-08-13

🧬 biology

Source-dependent microbial and functional partitioning shapes polyethylene biofilm resistomes in wastewater systems

Deze studie toont aan dat polyethyleen-biofilms in afvalwaterinlaat fungeren als bronafhankelijke interfaces die microbiële gemeenschappen en resistomen selectief herstructureren in plaats van te dienen als universele hotspots voor de accumulatie van antibioticaresistentiegenen, hetgeen een multidimensionale aanpak voor risicobeoordeling noodzakelijk maakt.

Chen Zhang, Wen Li, Yue Lei, Haijuan Hu, Zhichao Zhuang, Xin Gao, Zhiyun Wang, Xianhua Liu, Xiaoyan Li2026-08-13

🧬 biology

LC-Q-Orbitrap HRMS Profiling and Functional Characterization of Ocimum basilicum var. purpureum Extract as an Ampicillin-Modulating Agent against Escherichia coli

Deze studie toont aan dat een ethanolextract van *Ocimum basilicum* var. *purpureum*, rijk aan aan cafeïnezuur afgeleide polyfenolen, de activiteit van ampicilline tegen *Escherichia coli* potentieert door bacteriële bio-energetica (protonenflux en ATPase-activiteit) te verstoren en de oxidatieve stressrespons te moduleren, in plaats van te fungeren als een direct antibacterieel agens.

Anush Babayan, Barbara Kusznierewicz, Szymon Litewski, Marika Mróz, Mikayel Ginovyan, Agnieszka Bartoszek, Naira Sahakya (…)2026-08-13

🧬 biology

SiFEA4 encoding the bZIP transcription factor regulates panicle architecture in foxtail millet (Setaria italica)

Deze studie identificeert de bZIP-transcriptiefactor SiFEA4 als een belangrijke regulator van de panicularchitectuur van vingergierst, waarbij wordt aangetoond dat zowel een promotordeletie in de WY159-landras als een door CRISPR/Cas9 gemedieerde knockout leiden tot downregulatie van het gen, wat resulteert in abnormale differentiatie van het inflorescentiemeristeem, panikelapexvertakking en veranderde plantkenmerken door de modulatie van hormoonsignaleringsroutes en directe regulatie van downstream doelgenen.

Tianguo Wang, Lu Chen, Shujie Dai, Shangkun Niu, Yanyu Yang, Yuqin Zhao, Shiyuan Wang, Yixuan Ma, Lejie Yang, Kai Zhao (…)2026-08-13

🧬 biology

Responses of Hepatic and Splenic Nrf2-HO1- NF-κB pathways to Gallic Acid and Artesunate Combination Therapy in Plasmodium berghei-Infected Mice

Deze studie toont aan dat de combinatie van galluszuur en artesunaat effectief de Nrf2-HO1 antioxidante en NF-κB ontstekingsroutes moduleert in de lever en milt van met *Plasmodium berghei* geïnfecteerde muizen, waarbij de milt een meer dynamische en gecoördineerde respons vertoont die het potentieel van de combinatie als een immunomodulerende malariatherapie benadrukt.

A. Igunnu, J. B. Babashola, O. A. George, J. O. Adebayo2026-08-13

🧬 biology

Transancestral TWAS Enrichment of NMN- Informed Pathways in Type 2 Diabetes: CPT2- Linked Fatty-Acid Oxidation and MAP2K1/MAPK3 Drivers as Translational Bridges

Deze studie integreert transancestrale transcriptoombrede associatiestudies met NMN-geïnformeerde pathways om CPT2-gelinkte vetzuuroxidatie en MAP2K1/MAPK3-signalering te identificeren als sleutel, voorouderspecifieke genetische drijfveren van type 2 diabetes, waardoor een translationele brug wordt geslagen tussen NAD+-precursorbiologie en menselijke ziektegenetica.

Ngo Cheung2026-08-13

🧬 biology

Bcl-2 suppresses ER-mitochondrial Ca2+ transfer by directly limiting ER-mitochondrial contact sites

Deze studie onthult dat het anti-apoptotische Bcl-2 de mitochondriale Ca2+-overbelasting in niet-apoptotische cellen onderdrukt door direct het aantal ER-mitochondriale contactplaatsen op optimale afstanden (10–20 nm) te beperken op een IP3R-afhankelijke wijze, waardoor de mitochondriale respiratie wordt verbeterd zonder celdood te induceren.

Geert Bultynck, Manon Callens, Jens Loncke, Dmitry Lim, Rita La Rovere, Ophélie Champion, Tim Vervliet2026-08-13

🧬 biology

Post-defecation stability of fecal cortisol concentrations in Leopardus pardalis and L. wiedii under human care in the humid tropics of Mexico

Deze studie toont aan dat de fecale cortisolconcentraties bij gevangenschap ocelots en margays in de vochtige tropen van Mexico tot 24 uur na defecatie stabiel blijven, wat het gebruik van fecaal cortisol valideert als een betrouwbare biomarker voor het beoordelen van stress bij deze Neotropische katachtigen onder dergelijke omgevingscondities.

Alejandra Riechers, Eduardo J. Naranjo, José Jorge Chanona-Pérez, Miguel Ángel Peralta-Meixueiro, Javier Gutiérrez-Jimén (…)2026-08-13

← Vorige Volgende →