🧬 biology

UNIPRO enables protein inference and panel expansion across single-cell and spatial transcriptomics

UNIPRO is een verenigd graafgebaseerd framework dat bestaande CITE-seq-bronnen benut om transcriptomische gelijkenis en ruimtelijke context gezamenlijk te modelleren, wat nauwkeurige eiwitinferentie, ruimtelijke reconstructie en panelexpansie mogelijk maakt over diverse single-cell en ruimtelijke transcriptomica-datasets heen.

Yadong Wang, Jichong Mu, Tianyi Zhao, Yuzhi Sun, Yachen Yao, Guohua Wang2026-08-07
🧬 biology

Breeding emperor penguins repeatedly use shelf/slope-associated foraging areas across contrasting sea-ice seasons in the northwestern Weddell Sea

Deze studie onthult dat de broedende keizerspinguïns van Snow Hill Island in de noordwestelijke Weddellzee een sterke trouw vertonen aan specifieke aan het continentale plat of de helling geassocieerde foerageergebieden tijdens contrasterende zeeïstijden, waarbij hun habitatgebruik wordt beïnvloed door de zeeijsconcentratie en de afstand tot de kolonie, waardoor de relevantie van het voorgestelde mariene beschermde gebied in de Weddellzee voor hun behoud wordt gevalideerd.

Hugo R. Guímaro, Peter T. Fretwell, Klemens Pütz, José C. Xavier, Victoria Warwick-Evans, George Day, Juliana A. Vianna (…)2026-08-07
🧬 biology

A genomically validated loss of chromosome Y transcriptional program is a modest prognostic signal independent of tumour stage in male lung adenocarcinoma

Bij mannen met een adenocarcinoom van de long dient een genomisch gevalideerd verlies van het chromosoom Y (LOY) transcriptioneel programma als een bescheiden, statistisch significant prognostisch signaal dat slechts marginaal onafhankelijk is van het tumorstadium en grotendeels wordt geconfundeerd door generieke proliferatie, wat de directe bruikbaarheid ervan als een zelfstandige klinische biomarker beperkt.

Shilei Qin, Ling Yan, Zanjin Wu, Yang Wang2026-08-07
🧬 biology

CHAP-GWAS: Leveraging Chromosomal Haplotypes to Improve Genome-Wide Association Studies

Het artikel introduceert CHAP-GWAS, een nieuw, fenotype-gestuurd algoritme dat chromosoom-schaal haplotypes benut om dynamisch met kenmerken geassocieerde blokken te definiëren, waardoor de statistische kracht aanzienlijk wordt verbeteren en genetische loci worden geïdentificeerd die door conventionele single-SNP en statische haplotype-gebaseerde GWAS-methoden worden gemist.

Zhenyu Jia, Shibo Wang, Qiong Jia, Yanru Cui, Han Qu, Ruidong Li, Lei Yu, Xuesong Wang, Chin-Sheng Teng, Si Liu, Chenwu (…)2026-08-07
🧬 biology

Effects of 3DP coral-inspired shelter geometry on reef fish occupancy and shelter use

Deze studie toont aan dat met 3D-geprinte koraal-geïnspireerde schuilplaatsen met vergrote geometrieën de abundantie en interactiefrequentie van rifvissen aanzienlijk verhogen, wat het potentieel benadrukt van het manipuleren van specifieke architecturale kenmerken om ontwerpen voor kunstmatige riffen te optimaliseren.

Raz Levy, Asa Oren, Liat Biniuri, Natalie Chernihovsky, Ezri Tarazi, Nadav Shashar2026-08-07
🧬 biology

Identification and functional analysis of the TOPLESS-related co-repressor CcTPR4 in jute: a negative regulator of fiber yield through modulation of cellulose biosynthesis and gibberellin homeostasis

Deze studie identificeert en karakteriseert functioneel CcTPR4 als een negatieve regulator van de jutevezelopbrengst die de cellulosebiosynthese onderdrukt en de homeostase van gibberelline moduleert, waarmee het wordt vastgesteld als een belangrijk doelwit voor moleculaire veredeling.

Qiuying Hou, Haixiong Ma, Huifan Kang, Siyan Wu, Mengen Niu, Zonera Arshad, Jianmin Qi, Pingping Fang, Jiantang Xu, Aife (…)2026-08-07
🧬 biology

A brain splicing-QTL colocalization map of candidate effector genes for major depressive disorder

Door een grootschalige GWAS van een majeure depressieve stoornis te integreren met een uitgebreide humane hersen-splicing-QTL-resource, identificeert deze studie 56 hoog-betrouwbare kandidaat-effectorgenen waarvan de ziekteassociaties duidelijker worden opgelost door alternatieve splicing dan door genexpressie alleen, wat een complementaire regulatoire laag biedt voor functionele en translationele prioritering.

Bozhi Li, Weijia Gu, Xiaqiu Wu2026-08-07
🧬 biology

Shared Genetic Architecture of Premenstrual Disorder and Postpartum Depression: Registry-Based and Genetic Evidence

Deze studie levert het eerste bewijs van een substantiële gedeelde genetische architectuur tussen premenestruale stoornissen en postpartum depressie door middel van registergebaseerde en genomische analyses, waarbij nieuwe risicoloci in *PCDH9* en *KCTD16* worden geïdentificeerd die wijzen op GABA-gemedieerde inhiberende signalering en hippocampale regulatie bij de abnormale hersenrespons op hormonale schommelingen.

Susu Qu, Kejia Hu, Jerry Guintivano, Elgeta Hysaj, Piotr Jaholkowski, Alexey A. Shadrin, Alicia Nevriana, Rebecka Keijse (…)2026-08-07
🧬 biology

Septal venous drainage facilitates oxygen-transfer kinetics in the human placenta

Deze studie identificeert EphB4⁺-aders binnen de deciduale septa als een cruciale maternale excretiebaan die de zuurstofoverdrachtskinetiek in de menselijke placenta versnelt, waarbij wordt aangetoond dat hun afwezigheid bij hoog-risico zwangerschappen de zuurstofvernieuwing significant vertraagt en de vatbaarheid voor doodgeboorte verhoogt.

Lopa Leach, Dimitrios Amanitis, Fenia Deligianni, Reem Abuhaimed, Hatoon Alkeraim2026-08-07
🧬 biology

DNA phosphorothioation enhances Bacillus subtilis probiotic efficacy against alcoholic gut-liver injury

Deze studie toont aan dat DNA-fosforothioatie de stressbestendigheid van *Bacillus subtilis* en de probiotische effectiviteit tegen door alcohol geïnduceerde darm-leverbeschadiging verbetert door reactieve zuurstofcomponenten te neutraliseren en taurochenodeoxycholzuur om te zetten in tauroursodeoxycholzuur om de gastheer-TGR5-signalering te activeren, waardoor de integriteit van de darmbarrière behouden blijft en leverontsteking wordt onderdrukt.

Xinyi He, Tingfei Dong, Biao Zhu, Meiling Yu, Ketong Yin, Ruimin He, Wenyue Hu, Haitong Diao, Yuli Wang, Xinyu Zhang, Zh (…)2026-08-07