🧬 Category

q-bio

4852 papers

🧬 biology

Senescent MSC activates EMT through the non-classical TGF-β/PI3K/AKT pathway to promote the migration of SMAD4-deficient colorectal cancer

Deze studie onthult dat senescente mesenchymale stamcellen de migratie en invasie van SMAD4-deficiënte colorectale kankercellen bevorderen door het uitscheiden van TGF-β om de niet-klassieke PI3K/AKT-route te activeren, waardoor epitheliale-mesenchymale transitie (EMT) wordt geïnduceerd die effectief kan worden omgekeerd door de TGF-β-receptorremmer LY-2109761.

Yanju Li, Shu Xu, Xiaoshuang Yuan, Luxin Zhang, Xu Yang, Bo Yang, Yang Liu, Feiqing Wang2026-08-04
🧬 biology

Automated dataset integrating structural and bioactivity data for structure-based drug discovery

DockTData is een onlangs uitgebrachte, open gelicenseerde dataset die 24.719 experimenteel bepaalde eiwit-ligandstructuren uit de PDB integreert met gestandaardiseerde bioactiviteitsmetingen van BindingDB en ChEMBL, wat een grotere en reproduceerbare bron biedt voor het trainen van machine learning-modellen in structuurgebaseerde medicijnontdekking.

José Renato Duarte Fajardo, Matheus Müller Pereira da Silva, Leon Sulfierry Corrêa Costa, Fabio Lima Custódio, Isabella (…)2026-08-04
🧬 biology

Aberrant DNA repair signaling through NER, BER, and TC-NER pathways in Myelodysplastic Neoplasms

Deze studie identificeert verhoogde ERCC8 mRNA-expressie als een significante biomarker geassocieerd met hoog-risico myeldysplastische neoplasmata en progressie naar acute myeloïde leukemie, wat de cruciale rol van abberante DNA-reparatiesignalering in de pathogenese van de ziekte benadrukt.

P. Katsiampoura, C.-N. Kontandreopoulou, S. Douka, P. Diamantopoulos, S. Chatzidavid, C. Stafylidis, D. Vlachopoulou, S. (…)2026-08-04
🧬 biology

OmicFormer: a statistical priors–informed transformer for accurate and generalizable omics prediction of diseases and complex traits

OmicFormer is een nieuwe Transformer-gebaseerde architectuur die statistische priors inbedt om complexe biologische afhankelijkheden te vangen, waarmee het bestaande methoden aanzienlijk overtreft in nauwkeurigheid en generaliseerbaarheid over diverse ziektevoorspellings-taken en omics-datasets.

Weikang Gong, Hanlin Jiang, Chang Yang, Menghan Qin, Jia You, Jianfeng Feng, Jin-Tai Yu, Wei Cheng2026-08-04
🧬 biology

A unified framework to understand and control dynamics in Boolean biological networks

Dit artikel introduceert een verenigd kader voor het modelleren en besturen van Booleaanse biologische netwerken door temporele, structurele en hybride besturingsmechanismen te integreren om attractoren en staatstrajecten te manipuleren, waardoor rationele engineering van complexe biologische processen zoals celdifferentiatie mogelijk wordt.

Antonio Bensussen, Elena Alvarez-Buylla, Juan Carlos Martinez-Garcia2026-08-04
🧬 biology

A systemically delivered X-ray-triggered nanovesicle platform for in situ activation of endogenous neural stem cells and brain circuit repair

Deze studie presenteert XSingletO, een systemisch toegediend nanovesikelplatform dat röntgenstraling gebruikt om gelokaliseerde singletzuurstof binnen de hersenen te genereren, waardoor endogene neurale stamcellen via een PPARγ-afhankelijk mechanisme worden geactiveerd om neuronale regeneratie, circuitherstel en functioneel herstel in modellen van traumatisch hersenletsel te stimuleren.

Yang Tian, Yifan Da, Xiaohui Li, Mingwei Guo, Ziyu Li, Yuandong Liu, Jing Sun, Jingjing Wan, Qiangqiang Zhang, Yudan Chi (…)2026-08-04
🧬 biology

The Dynamics of Thought: A Biophysical Framework for Cognitive Transduction via Multiplicative Gain-Driven Phase Transitions

Dit artikel introduceert BMIM II, een biofysisch raamwerk dat cognitieve transductie modelleert als een door een Hopf-bifurcatie gedreven faseovergang in gekoppelde Stuart-Landau-oscillatoren, waarbij multiplicatieve neurale winsten en thermodynamische ruis de opkomst van geïntegreerde gedachte en de etiologie van cognitieve stoornissen bepalen, gevalideerd door middel van een realtime computationeel prototype en voorgestelde klinische meetprotocollen.

Francisco Domínguez2026-08-04
🧬 biology

Analytical and Finite-Population Properties of Defector-Responsive Strategy Switching

Dit artikel analyseert de analytische en eindpopulatie-dynamiek van op defectors reagerende strategie-wisseling in het Prisoner's Dilemma, waarbij exacte kostenrestricties voor de levensvatbaarheid ervan worden afgeleid en wordt aangetoond dat terwijl constante wisseling snel vergelding vestigt ten koste van onvoorwaardelijke coöperatoren, reactieve wisseling een superieure afweging biedt door coöperatie te behouden nadat deze uit de handen van defectors is gered.

Aarush Gunjal2026-08-04
🧬 biology

Production of L-asparaginase by Pseudomonas reptilivora ATCC 13626 (NRRL B-6bs): First fractional factorial screening and discovery of ureolytic activity

Deze studie rapporteert de eerste systematische screening van L-asparaginaseproductie door *Pseudomonas reptilivora* ATCC 13626, waarbij lage agitatie en asparagine-suppletie werden geïdentificeerd als sleutelfactoren voor een hoge enzymopbrengst, terwijl tegelijkertijd een induceerbare ureolytische capaciteit werd ontdekt die de klassieke classificatie van de soort uitdaagt.

Carlos Tinoco-Gutierrez, Hugo Israel Olvera-Calderón, Itan Homero Ruiz-Hernandez, Juan Carlos González-Hernández2026-08-04
🧬 biology

Distribution, phenotype and role of Emx1 and Otp glutamatergic cell lineages in pallial and medial amygdala

Deze studie maakt gebruik van triple transgene muizen om de onderscheidende distributie, moleculaire fenotypes en differentiële geur-geëvoceerde activatiepatronen van Emx1-afgeleide palliale en Otp-afgeleide telencephalische-opto-hypothalame glutamaterge neuronen binnen de volwassen amygdala te karakteriseren, waarbij wordt onthuld hoe hun embryonale oorsprong bijdraagt aan de functionele en geslachtsspecifieke verwerking van olfactorische prikkels.

Júlia Freixes, Alba González-Alonso, Ester Desfilis, Loreta Medina2026-08-04