Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology
Deze empirische analyse toont aan dat het beperken van kandidaatruimtes in benchmarks voor genregulatoire netwerken de rangschikking van methoden over verschillende weefsels aanzienlijk destabiliseert, wat aangeeft dat keuzes in de definitie van kandidaten de vergelijkende conclusies kunnen veranderen en gerapporteerd moeten worden naast de resultaten in plaats van als neutraal te worden beschouwd.