5305 papers
De Genetics of DNA Methylation Consortium (GoDMC) heeft een uitgebreid, door de gemeenschap gedreven softwareframework ontwikkeld dat de verwerking op cohortniveau standaardiseert en reproduceerbare, op samenvattende statistieken gebaseerde analyses mogelijk maakt die DNA-methylatie en genetische variatie integreren.
Deze studie presenteert een nieuw hybride machine learning-framework dat LightGBM combineert met op PyTorch gebaseerde aandachtmechanismen om de resuscitatie van VBNC-bacteriën nauwkeurig te voorspellen, waarbij een superieure prestatie wordt behaald ten opzichte van traditionele methoden en nutriëntconcentratie en cAMP-signalering worden geïdentificeerd als cruciale determinanten voor herstel.
Het artikel introduceert Tabula, een privacy-bewarend single-cell fundatiemodel dat federated learning gebruikt om de tabulaire structuur van genomische data expliciet te vatten, wat het ontdekken van regulatoire logica en de identificatie van verjongingsfactoren mogelijk maakt zonder ruwe data tussen instellingen te delen.
Dit artikel presenteert de Pacific eDNA Coastal Observatory, een grensoverschrijdend netwerk bestaande uit 16 knooppunten van San Diego tot Juneau, dat gedurende vier jaar 1.041 zeewatermonsters heeft gebruikt om een uitgebreide, gevalideerde dataset van de biodiversiteit van nabijgelegen visbestanden in de noordoostelijke Pacific te genereren, waarmee de effectiviteit van gecoördineerde eDNA-monitoring voor grootschalige vergelijkende inferentie wordt aangetoond.
Door een nieuw AI-gemedieerd framework (AHA) toe te passen om duizenden Alzheimer-studies op een gemeenschappelijke dataset te reproduceren en te auditeren, demonstreren de auteurs dat hoewel de gerapporteerde voorspellende prestaties van het vakgebied op grote schaal gereproduceerd kunnen worden, de beschikbare data fundamenteel informatie-onvoldoende zijn om concurrerende hypothesen te onderscheiden, wat een plafond onthult voor de bewijslast die de uiteenlopende onderzoeksrichtingen van het vakgebied verklaart.
Deze systematische review van 65 muizenstudies concludeert dat blootstelling aan muziek de gedragsmatige, neurobiologische en fysiologische uitkomsten bij ratten significant verbetert, hoewel methodologische heterogeniteit verder gestandaardiseerd onderzoek noodzakelijk maakt om mechanismen te verduidelijken en het translationele potentieel voor mensen te bevestigen.
Deze studie presenteert drie hoog-resolutie cryo-EM-structuren van het humane SET8-katalytische domein gebonden aan nucleosomen, die onthullen hoe specifieke arginine-gemedieerde verankering aan de zure patch en dynamische conformationele transities de herkenning en monomethylering van histon H4 lysine 20 faciliteren.
Het artikel introduceert PRIDE-AP, een nieuwe FAIR-conforme, open-data repository binnen de PRIDE-infrastructuur die het gebrek aan een toegewijd archief voor high-throughput affiniteitsproteomics aanpakt door gestandaardiseerde indiening, validatie en cross-technologie integratie van datasets mogelijk te maken om biomarkerontdekking te versnellen.
Dit artikel herformuleert de verspreiding van kunstmatige intelligentiegeletterdheid binnen organisaties als een besmettingsproces, waarbij wordt aangetoond door middel van netwerkepidemiologie en machine learning dat het behoud van leerstof primair wordt gedreven door de structurele eigenschappen van communicatienetwerken en de positie van een individu daarin, in plaats van enkel door persoonlijke attributen.
Dit artikel, dat oorspronkelijk een verband voorstelde tussen de structuur van circadiane klokgenen en PD-L1 in zes kankertypen om melanomasubtypen te definiëren, is door de auteur ingetrokken vanwege zorgen over de nauwkeurigheid, geldigheid en betrouwbaarheid van de inhoud.