🧬 Category

q-bio

5359 papers

🧬 biologie

Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

Deze studie integreert transcriptomische analyse, machine learning en klinische validatie om C4A, GANAB en TUBA4A te identificeren als belangrijke UFMylatie-gerelateerde diagnostische biomarkers voor parodontitis, waarbij hun rollen in immuun- en metabole paden worden verduidelijkt en potentiële therapeutische doelwitten worden voorgesteld.

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
🧬 biologie

Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

In een 6,5-jarige prospectieve cohortstudie onder Keniaanse middelbare scholieressen verminderde het gebruik van een menstruatiecup het risico op de overgang van een optimaal door *L. crispatus* gedomineerd vaginaal microbioom naar een niet-optimale staat significant, wat suggereert dat het verstrekken van cups vóór de seksuele debut cruciaal is voor het behoud van de vaginale gezondheid.

Supriya Mehta2026-06-30
🧬 biologie

Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

Deze studie maakt gebruik van een tweestaps machine learning-framework dat GMM-clustering en XGBoost-regressie combineert op NHANES 2017–2023-data om aan te tonen dat door macronutriënten gedreven CRP-responsen significant variëren per metabool fenotype en etniciteit, waarbij een "Vezel-Resiliëntie Paradox" in niet-Hispanic zwarte populaties wordt belicht en gepleit wordt voor een gestratificeerde precisievoedingsbenadering.

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
🧬 biologie

EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

Deze studie toont aan dat de variantie van het EEG-signaal een robuuste biomarker is voor het onderscheiden van iatale toestanden en valideert dat een Random Forest-classifier, getraind op de University of Bonn-dataset met strikte subject-niveau datapartitionering om lekkage te voorkomen, een hoge nauwkeurigheid (96,2%) en sensitiviteit (98,3%) bereikt bij het detecteren van insulten.

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30
🧬 biologie

Differential Signaling in Adaptive Immunity: Deciphering the Mechanism to Identify the Physical and Evolutionary Bases of Non‑Self

Dit artikel stelt een mechanofysisch kader voor dat differentiële mechanische verplaatsing identificeert als de fundamentele variabele die adaptieve immuunreceptoren in staat stelt om zelf van niet-zelf te onderscheiden door abrupte afwijkingen in fysieke krachtvelden op aminozuurniveau te meten, waardoor humorale en cellulaire herkenning worden verenigd via een progressieve beslissingscascade die langlopende paradoxen in immuunspecificiteit oplost.

Yasir Arafat Maassoom2026-06-30
🧬 biologie

Fungal diversity in forest's soil: Moderate-term post-thinning effect of a Mediterranean mature Pinus halepensis forest.

Een studie van een mediterraan *Pinus halepensis*-bos in Israël onthult dat hoewel matige uitdunning de totale schimmeldiversiteit licht vermindert, volledige boomverwijdering de bodemkenmerken aanzienlijk verandert en de schimmelgemeenschappen verschuift van symbiotische, door dennen geassocieerde soorten naar saprotrofe en pathogene taxa die typerend zijn voor niet-bosrijke gebieden.

Segula Masaphy, Noam Levi, Limor Zabari, Ezra Orlofsky2026-06-30
🧬 biologie

A multi-omics dataset of the developing zebrafish intestine: longitudinal transcriptomic and microbiome profiles in wild-type and IgZ knockout models

Deze studie presenteert een multi-omics dataset die longitudinale transcriptomische en microbiële profielen van wild-type en IgZ-knockout zebravissen integreert om de ontwikkelingsrol van IgZ bij het reguleren van darmimmuniteit en microbiële homeostase te verduidelijken.

Raktakamol Pharrat, Xuyang Zhao, Zhengben Wu, Congran Bei, Yongyao Yu2026-06-30
🧬 biologie

Optimization of the 5' untranslated region and codon of the mRNA vaccines

Deze studie toont aan dat het systematisch optimaliseren van de 5'-untranslated regio en het codongebruik van mRNA-vaccins de eiwitexpressieniveaus en stabiliteit significant verbetert, een strategie die is gevalideerd door middel van het succesvolle ontwerp en testen van vaccins tegen het respiratoir syncytieel virus (RSV) F-eiwit.

Qiuji Wang, Xiaorong Peng, Yaqian Zeng, Xindeng Guo, Weineng Meng, Ning Deng2026-06-30
🧬 biologie

Integrative single-cell and bulk transcriptomic analysis with Shennong machine learning reveals the landscape of calmodulin associated prognostic genes in breast cancer

Deze studie integreert single-cell en bulk transcriptomische analyses met Shennong machine learning om een acht-genen calmodulin-gerelateerde prognostische signatuur in borstkanker te identificeren, wat de associatie ervan met epitheelceldynamiek, specifieke signaalpaden en potentiële therapeutische doelwitten onthult.

Jian Chen, Wenhui Lai, Can Yang2026-06-30
🧬 biologie

Transcriptomic insights into gametogenesis and steroidogenic enzyme gene regulation in Australasian snapper (Chrysophrys auratus) gonads during the reproductive cycle

Deze studie presenteert de eerste transcriptoombrede analyse van de gonaden van de Australische snapper gedurende hun reproductieve cyclus, waarbij geslachts-specifieke genexpressiepatronen in steroidogene enzymen en ontwikkelingsprocessen worden onthuld, terwijl tegelijkertijd de genoomannotatie van de soort wordt verbeterd om toekomstig aquacultuur- en reproductief onderzoek te ondersteunen.

Samuel J. Modern, Matthew J. Wylie, Igor Ruza, Craig Radford, Maren Wellenreuther2026-06-30