q-bio papers | Gist.Science

A Predictive, Cumulative Framework for Multivalent Transcription Factor Specificity

Deze studie vestigt een voorspellend, biofysisch gefundeerd kader dat aantoont dat de wijze van multivalente transcriptiefactorassemblage — variërend van flexibele fase-scheiding tot rigide oligomerisatie — bepaalt of genomische specificiteit wordt beheerst door cumulatieve zwakke sitedichtheid of strikte geometrische afstand, waardoor de manier waarop endogene repetitieve sequenties genexpressie reguleren, wordt geherdefinieerd.

Bing Li, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Wanli Yang, Yuqian Feng, Xiang Xu, Siang Lv, Mingqian Hu, Qi Zhang, Ningzhe Li, Mengy (…)2026-06-24

🧬 biologie

CORA: a COrrelation-Redundancy-Aware FDR adjustment with genomic applications

CORA is een nieuwe FDR-correctiemethode die de parsimonie van differentiële expressieanalyse verbetert door paarwijze gencorrelaties te integreren in de Benjamini-Hochberg-drempel om redundante ontdekkingen te bestraffen zonder statistische kracht op te offeren.

Joanna Zyprych-Walczak2026-06-24

🧬 biologie

Structure-Guided Design of Therapeutic Antibodies Targeting SARS-CoV-2 Omicron Variants

Deze studie toont aan dat een op structuur gebaseerde computationele ontwerpstrategie het COV2-2196-antilichaam succesvol heeft geoptimaliseerd om de neutralisatiepotentie tegen SARS-CoV-2 Omicron-varianten te herstellen en te verbeteren, wat een praktisch kader biedt voor de snelle ontwikkeling van breed effectieve therapeutica tegen evoluerende virale stammen.

Jesper Pallesen, Jianqiu Du, Yuanhan Wu, Sukanya Ghosh, Kelly Bayruns, Roopak Sadeesh, David Weiner2026-06-24

🧬 biologie

A simple mathematical model for the discontinuity in average nucleotide identity distributions in prokaryotes

Dit artikel presenteert een vereenvoudigd gemiddeld-veld wiskundig model dat aantoont hoe de wisselwerking tussen mutatie, homologe recombinatie en het verval van recombinatie-efficiëntie bij sequentiedivergentie de grootte, afstand en positie van de Average Nucleotide Identity (ANI) gap vormgeeft die de grenzen van prokaryotische soorten bepaalt.

Sebastian Silva-Solar, Rudolf Amann, Tomeu Viver, Ramon Rossello-Mora, Javier Santibañez-Molina, Luis Miguel Rodriguez (…)2026-06-24

🧬 biologie

Estrogen-related receptor alpha (ERRα) promotes gastrointestinal stromal tumor progression and epithelial-mesenchymal transition through Wnt/β-catenin

Deze studie toont aan dat estrogeneen-gerelateerde receptor alfa (ERRα) de progressie van gastro-intestinale stromale tumoren (GIST) en de epitheliale-mesenchymale transitie aanstuurt door het Wnt/β-catenine-signaalpad te activeren, wat suggereert dat ERRα-inhibitie een veelbelovende therapeutische strategie is.

Ronald DeMatteo, Taylor Hartlein, Shan Zeng, Ferdinand Rossi, Montana Morris, Jonathan Sussman, Michael Beckman, Iulia B (…)2026-06-24

🧬 biologie

Assessing Latent Heterogeneity in Breast Cancer Survival: A Frailty Model Approach Using METABRIC Data

Met behulp van de METABRIC-cohortgegevens bevestigt deze studie de prognostische waarde van PAM50-subtypen voor borstkankerterugval, terwijl wordt aangetoond via shared frailty-modellering dat de niet-gemeten latente heterogeniteit binnen deze subtypen minimaal is.

Sherif Mohammed, Leonard Kyei, Francis Okyere, Francis Amuyao2026-06-24

🧬 biologie

Using cryopreserved coral sperm for larval production at a restoration-relevant scale

Deze studie toont aan dat cryogepreserveerd koraalsperma kan worden gebruikt om larven te produceren op schalen die relevant zijn voor herstel (tot 960.000 per liter) met een bevruchtingssucces en overleving van rekruten die vergelijkbaar zijn met vers sperma, waardoor grootschalig gebruik van gebiobankte genetische bronnen voor rifherstel mogelijk wordt.

Jonathan Daly, Rebecca Hobbs, F. Mikaela Nordborg, Andrea Severati, Line Bay, Justine O'Brien2026-06-24

🧬 biologie

Implied Motion as a Mechanism for Spontaneous Belief Computation in Humans

Deze studie toont aan dat het menselijk brein spontaan de overtuigingen van anderen berekent door deze te coderen als geïmpliceerde beweging van agent naar object, een mechanisme dat wordt ondersteund door intracraniële EEG-bewijzen die een gedeelde neurale verwerking in de temporopariëtale junctie laten zien voor zowel het bijhouden van overtuigingen als visuele flow.

Patricia Christian, James Cahill, Adeline Fecker, Martha Paskin, Ronja Löfström, Zane Zook, Ahmed Raslan, Kelly Collins (…)2026-06-24

🧬 biologie

The human limbus functions as an instructive epithelial transition zone

Deze studie herdefinieert de volwassen menselijke limbus als een instructieve, dynamische transitiezone in plaats van een rigide lijn-barrière, en demonstreert dat bipotente limba-progenitoren de cornea- of conjunctiva-bestemming bepalen via een moleculaire schakelaar die wordt beheerst door KGF- en EGF-signalering.

Natasha Frank, Yuzuru Sasamoto, Yoshiko Fukuda, Catherine Lee, Shuoshuo Wang, Sheethal Umesh, Shinri Sato, Kosei Suzuki (…)2026-06-24

🧬 biologie

Descriptor-Aware Meta-Ensemble Learning Reveals Cross-Target Pharmacophore Recognition Patterns Across CNS-Related Therapeutic Targets

Deze studie introduceert een descriptor-bewust Meta-Ensemble leerframework dat meerdere machine learning-algoritmen en heterogene descriptors integreert om robuuste, interpreteerbare cross-target farmacofoorherkenning voor CNS-gerelateerde therapeutische targets te bereiken, om uiteindelijk nieuwe inhibitoren te identificeren en te valideren door middel van virtuele screening en uitgebreide moleculaire dynamica-simulaties.

Tangilal Dihan Chowdhury, Maisha Farzana, Md Ushama Shafoyat, Md Tobibul Islam, Arpita Shil Puja, Jafrin Sultana, Syed R (…)2026-06-24

← Vorige Volgende →