🧬 Category

q-bio

1432 papers

🧬 biology

SpikeTrainPatternDetector: a provenance-aware R/Shiny framework for neuronal firing-pattern detection and review

SpikeTrainPatternDetector (STPD) is een open-source R/Shiny-framework dat is ontworpen om de herkomst van beslissingen over het detecteren van neuronale vuurpatronen te waarborgen door middel van geautomatiseerde kandidaatgeneratie, deterministische conflictresolutie en handmatige beoordeling, dienend als een reproduceerbare infrastructuur voor expertvalidatie in plaats van een zelfstandige biologische classifier.

Houchun Zhou, Alexey Sedov2026-07-06
🧬 biology

Root water-uptake depth and leaf trait adjustments along a water table gradient: trade-offs among trees and shrubs in a tropical coastal forest

Deze studie toont aan dat in tropische kustrestinga-bossen bomen en struiken hun wortelwateropname-diepte aanpassen als reactie op grondwaterstanden om de watertoestand te handhaven, maar deze ondergrondse investering creëert een afruil die specifiek de bovengrondse fotosynthetische kenmerken en groenheid in bomen beperkt.

Cristina Antunes, Sergio Chozas, Rafael Flora, Cristina Máguas, Carlos Joly, Simone Vieira2026-07-06
🧬 biology

Sublethal Toxicity of Chlorpyrifos in the Freshwater Fish Puntius chola: Integrated Assessment of Behavioral Responses, Biochemical Alterations, and Histopathological Damage

Deze studie toont aan dat subletale blootstelling aan het organofosfaatinsecticide chlorpyrifos significante metabole stress, biochemische onbalans in koolhydraat- en lipidenprofielen en ernstige histopathologische schade aan meerdere organen induceert bij de zoetwatervis *Puntius chola*, wat de potentie ervan benadrukt als een gevoelige biomarker voor het monitoren van pesticidenverontreiniging in aquatische ecosystemen.

Balaganesh Balakumar, Thangaraj Sangappillai, Stalin Arumugam, Gokula Varadharajan2026-07-06
🧬 biology

Streamline-Based Analysis: A novel framework for tractogram-driven streamline-wise statistical inference

Dit artikel introduceert Streamline-Based Analysis (SBA), een nieuw non-parametrisch framework dat statistische inferentie direct op individuele tractografie-streamlines uitvoert om hoogresolutie, whole-brain witte stof analyse met controle over de family-wise error te bereiken, waardoor de kloof tussen voxel-, fixel- en tract-niveau methoden wordt overbrugd.

Simone Zanoni, Jinglei Lv, Sharon Naismith, Robert Smith, Fernando Calamante2026-07-06
🧬 biology

Adipocyte GDI2 suppresses lipophagy to restrain adaptive thermogenesis and promotes diet-induced obesity

Deze studie identificeert GDI2 als een kritieke remmer van adipocyten-lipofagie die beige vetthermogenese onderdrukt en dieet-geïnduceerde obesitas bevordert, waarbij wordt aangetoond dat de deletie ervan de lipidenafbraak en metabole gezondheid verbetert door een PPARα/PGC1α-afhankelijk transcriptioneel programma te activeren.

Fei Gao, Yongjiao Zhang, Dong Liu, Yufan Song, Yang Sun, Meitian Wang, Sumei Lu, Guangyong Zhang2026-07-06
🧬 biology

A z-averaged ensemble of three orthogonal models improves protein–ligand virtual screening on leakage-controlled benchmarks

Dit artikel toont aan dat een z-gemiddeld ensemble van drie representationeel orthogonale deep-learningmodellen de prestaties van proteïne-ligand virtuele screening op lekgecontroleerde benchmarks significant verbetert door echte out-of-distribution generalisatie te bereiken, waardoor de beperkingen van single-model benaderingen op nieuwe targets worden overwonnen.

Yuguang Mu, Yang Liu, weifeng li2026-07-06
🧬 biology

Bioacoustics: Deep-Learning Model Selection, Optimization, and Deployment for Wildlife Sound Classification on Edge Devices

Dit artikel presenteert een reproduceerbare, end-to-end workflow voor het selecteren, optimaliseren en implementeren van nauwkeurige, controleerbare bioakoestische modellen op uitsluitend op CPU gebaseerde edge-apparaten, gebruikmakend van een specifieke architectuur van log-mel spectrogrammen, vision-pre-trained CNN's en aandachtmechanismen om realistische uitdagingen zoals ruis en domeinverschuiving te overwinnen, terwijl het gevalideerd is op de BirdCLEF+ 2026 Pantanal benchmark.

Rommel Sharma2026-07-06
🧬 biology

The removal of iron and phosphate from culture medium by Rhodococcus ruber SiAl

De bacterie *Rhodococcus ruber* SiAl vertoont een zeer selectieve en efficiënte verwijdering van ijzer (tot 99%) en fosfaat uit kweekmedia, een capaciteit die wordt ondersteund door geïdentificeerde siderofoor- en fosfaattransportgenen, terwijl er een minimale magnesiumopname en groeiremming door mangaan wordt waargenomen.

Galina Khokhlova, Konstantin Tikhonov, Olga Mironova, Tatiana Kulakovskaya, Mikhail Vainshtein2026-07-06
🧬 biology

Development of a simple and easily interpretable cultivar identification system using 18 InDel markers in Japanese Pummelo (Citrus maxima)

Deze studie heeft een eenvoudig en praktisch systeem voor cultivaridentificatie voor de Japanse pompeloe ontwikkeld met behulp van 18 geselecteerde InDel-markers die detecteerbaar zijn via standaard PCR en gelelektroforese, wat niet alleen een efficiënte bescherming van de rechten van kwekers mogelijk maakt, maar ook inzichten biedt in de genetische verwantschappen en de afstamming van belangrijke cultivars.

Riki Shimada, Tatsumi Netsu, Horiike Tokumasa, Tomoaki Watanabe, Keisuke Nonaka, Akiyoshi Tominaga2026-07-06
🧬 biology

AIGCRS-AMP30: AI Framework for Antimicrobial Peptide Generation, Classification, Regression, and Selection

Het artikel introduceert AIGCRS-AMP30, een geïntegreerd AI-framework dat diffusiegebaseerde generatie-, classificatie- en regressiemodellen combineert om korte, krachtige antimicrobiële peptiden te ontwerpen, die experimenteel zijn gevalideerd om een hoge effectiviteit tegen multiresistente pathogenen te tonen met een lage gasthetoxiciteit.

Jielu Yan, Jianxiu Cai, Yifan Li, Zhongyao Lin, Weizhi Xian, Xuekai Wei, Iun Fan Lei, François-Xavier Campbell-Valois, S (…)2026-07-06