Inverse FoldDir: Structure-conditioned Protein Sequence Design by Dirichlet Flow Matching
Het artikel introduceert Inverse FoldDir, een controleerbare inverse-folding methode gebaseerd op Dirichlet flow matching die diverse, experimenteel gevalideerde eiwitsequenties genereert met door de gebruiker gedefinieerde restricties door iteratieve denosing uit te voeren op de aminozuurwaarschijnlijkheidssimplex, waarbij staat-van-de-kunst structurele herstelmetrieken bereikt en succesvolle functionele herontwerp van een anti-GFP nanobody realiseert.