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A bioinformática une biologia e computação para desvendar os mistérios da vida através de dados. Nesta área, pesquisadores transformam sequências genéticas complexas em informações compreensíveis, permitindo descobertas rápidas sobre doenças, evolução e tratamentos personalizados sem depender apenas de laboratórios físicos.

No Gist.Science, processamos diariamente cada novo pré-publicação na categoria de bioinformática enviada pelo bioRxiv. Nosso compromisso é tornar esse conhecimento acessível, oferecendo tanto resumos em linguagem simples para o público geral quanto análises técnicas detalhadas para especialistas, garantindo que ninguém fique de fora das últimas inovações científicas.

Abaixo, você encontrará as últimas pesquisas publicadas nesta área, organizadas para facilitar sua leitura e compreensão dos avanços recentes.

💻 bioinformática

BioMod: Biological Module Tokenization for Single-Cell Foundation Modeling

O BioMod é um modelo de fundação de célula única com 50 milhões de parâmetros que melhora a eficiência de representação e o desempenho ao tokenizar células em módulos sobrepostos biologicamente significativos em vez de genes individuais, alcançando resultados de estado da arte em tarefas como anotação de tipos celulares e predição de perturbações, ao mesmo tempo em que permite inferência eficiente em uma única GPU.

Meng, L., Zhu, J., Han, B., Zang, Y., Li, W., Zong, K., Zhong, J., Yang, Y., Liu, J., Jia, J., Sun, R., Yu, G., Han, J. (…)2026-10-13
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Imputing relative abundances via Gaussian random fields

Este artigo introduz uma estrutura de campo aleatório gaussiano explicável para imputação múltipla de dados composicionais longitudinais que lida de forma eficaz com amostras ausentes, dependências temporais e inflação de zeros, demonstrando sua utilidade na reconstrução de trajetórias do microbioma intestinal para melhorar previsões para alergia alimentar e depressão pós-parto.

Shternshis, A., Singh, P., Hugerth, L. W.2026-10-13
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MtbAIM: AI/ML-guided endpoint-specific prediction of small-molecule activity across drug-susceptible and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis

Este estudo apresenta o MtbAIM, uma plataforma impulsionada por IA/ML que utiliza diversas representações moleculares e algoritmos baseados em árvores para prever com precisão a atividade e as concentrações inibitórias mínimas de pequenas moléculas contra isolados de *Mycobacterium tuberculosis* tanto suscetíveis quanto resistentes a drogas.

Singh, J., Singh, K.2026-10-12
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Human Intestinal Absorption Revisited: The 1998 Descriptors Survive, and the Method Extends to Permeability

Este artigo revisita um modelo de 1998 para absorção intestinal humana ao demonstrar que seu desempenho original dependia de uma divisão de dados fortunata e, subsequentemente, estabelece modelos preditivos mais robustos e baseados em consenso para absorção intestinal e vários ensaios de permeabilidade usando conjuntos de descritores selecionados por algoritmo genético e florestas aleatórias através de 250 extrações estratificadas.

Muskal, S. M., Wessel, M. D.2026-10-11
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GenDiMug: a generic inclusive multigraph framework to analyze genomic organizations and -omics data at multiple scales

O GenDiMug é um novo framework de multigrafo que supera as limitações das representações genômicas lineares ao utilizar modelos de rede para integrar dados multiômicos e analisar a organização genômica em múltiplas escalas, revelando padrões estruturais como o agrupamento da expressão gênica e a regulação circadiana.

Teuliere, J., Lopez, P., Corel, E., Llorente, B., Bapteste, E.2026-10-11
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In silico subtractive genomics and reverse vaccinology approach reveal outer membrane proteins OMP47 and LptD as dual-purpose drug and vaccine targets in Pasteurella multocida Pm70

Este estudo emprega um fluxo de trabalho integrado de genômica subtrativa *in silico* e vacinologia reversa para identificar as proteínas da membrana externa OMP47 e LptD como alvos de uso duplo para fármacos e vacinas contra *Pasteurella multocida* Pm70, culminando no design de um construto de vacina multi-epítopo seguro e altamente antigênico.

Khan Chowdhury, A. R., Islam, S., Farid, A., Lamia, F., Ahmad, T. F., Hossain, N. J., Paul, A. R., Afrin, T., Elias, S. (…)2026-10-11
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kitAb: an automated framework for assay-specific antibody developability modeling and large-scale landscape analysis

O artigo apresenta o kitAb, um framework de código aberto e computacionalmente eficiente que gera 59 descritores interpretáveis para modelagem escalável e específica de ensaios de desenvolvibilidade de anticorpos e revela diferenças físico-químicas sistemáticas através de repertórios de anticorpos naturais e terapêuticos de larga escala.

Trofimova, E., Shaburova, E., Antonets, D., Ramensky, V.2026-10-11
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Inferring ecDNA Evolution from Allele Frequency Spectra

Este artigo apresenta o ecEvol, um método computacional que analisa espectros de frequência alélica a partir de sequenciamento de genoma completo em massa para inferir o tempo, a força de seleção e a dominância clonal da emergência de DNA extracromossômico (ecDNA), revelando que a formação precoce de ecDNA impulsionada por oncogenes correlaciona-se com uma menor sobrevida do paciente e que a dinâmica do ecDNA varia significativamente entre tumores não tratados e avançados.

Dameracharla, B., Prasad, G., Luebeck, J., Amin, S., Kirkland, J., Chapman, O. S., Chavez, L., Verhaak, R., Huang, W., M (…)2026-10-11