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A bioinformática une biologia e computação para desvendar os mistérios da vida através de dados. Nesta área, pesquisadores transformam sequências genéticas complexas em informações compreensíveis, permitindo descobertas rápidas sobre doenças, evolução e tratamentos personalizados sem depender apenas de laboratórios físicos.

No Gist.Science, processamos diariamente cada novo pré-publicação na categoria de bioinformática enviada pelo bioRxiv. Nosso compromisso é tornar esse conhecimento acessível, oferecendo tanto resumos em linguagem simples para o público geral quanto análises técnicas detalhadas para especialistas, garantindo que ninguém fique de fora das últimas inovações científicas.

Abaixo, você encontrará as últimas pesquisas publicadas nesta área, organizadas para facilitar sua leitura e compreensão dos avanços recentes.

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SpliceSelectNet: A Hierarchical Transformer-Based Deep Learning Model for Splice Site Prediction

O artigo apresenta o SpliceSelectNet (SSNet), um modelo de aprendizado profundo baseado em Transformer hierárquico que alcança desempenho de última geração na previsão de sítios de splicing e detecção de splicing aberrante ao capturar eficientemente dependências de longo alcance em sequências de DNA de até 100 kb, oferecendo ao mesmo tempo interpretabilidade biológica através de seus mecanismos de atenção.

Miyachi, Y., Nakai, K.2026-03-12
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Fleming: An AI Agent for Antibiotic Discovery in Mycobacterium Tuberculosis

O Fleming é um agente de IA integrado que combina modelos discriminativos e generativos para explorar novos espaços químicos e identificar com alta eficácia compostos líderes promissores para o tratamento da tuberculose, superando as limitações de agentes genéricos e alcançando taxas de sucesso elevadas em testes in vitro e perfis ADMET favoráveis.

Wei, Z., Ektefaie, Y., Zhou, A., Negatu, D., Aldridge, B. B., Dick, T. B., Skarlinski, M., White, A., Rodriques, S. G. (…)2026-03-12
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Igniting full-length isoform analysis in single-cell and spatial RNA-seq data with FLAMESv2

O artigo apresenta o FLAMESv2, um pacote modular e flexível para processamento e análise de dados de RNA-seq de leitura longa em nível de célula única e espacial, permitindo a caracterização abrangente de isoformas de RNA e a heterogeneidade celular em diversos protocolos experimentais.

Wang, C., Prawer, Y. D. J., Voogd, O., Schuster, J., Pasquali, C., De Paoli-Iseppi, R., Li, A., Hallab, J., Tian, L., Pe (…)2026-03-12
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mnDINO: Accurate and robust segmentation of micronuclei with vision transformer networks

O artigo apresenta o mnDINO, um modelo baseado em redes de transformadores de visão que, treinado com um conjunto diversificado de mais de cinco mil micronúcleos anotados, alcança alta precisão e robustez na segmentação dessas estruturas subcelulares raras em diversas condições experimentais, disponibilizando o código e os dados para a comunidade científica.

Ren, Y., Morlot, L., Andrews, J. O., Thrane Hertz, E. P., Mailand, N., Caicedo, J. C.2026-03-12
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Joint Geometric--Chemical Distance for Protein Surfaces

O artigo apresenta o IFACE, um novo framework de correspondência que alinha superfícies proteicas através do acoplamento probabilístico de geometria intrínseca e campos químicos espaciais, permitindo derivar uma distância conjunta geométrica-química que supera os métodos tradicionais de comparação de dobras na identificação de variações conformacionais e sítios catalíticos conservados.

Swami, H., Eckmann, J.-P., McBride, J. M., Tlusty, T.2026-03-12
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Cyclic peptides space: The methodology of sequence selection to cover the comprehensive physical properties

Este artigo propõe uma nova metodologia que integra o modelo de linguagem de proteínas ESM-2 com a média de permutação cíclica de embeddings para criar um "espaço de peptídeos" abrangente, permitindo a seleção de bibliotecas de peptídeos cíclicos que cobrem uniformemente propriedades físicas e químicas diversas e superando as limitações de viés de inicialização dos algoritmos convencionais de otimização.

Tsuchihashi, R., Kinoshita, M.2026-03-12
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Comparative Analysis of Structural and Dynamical Properties of Lipid Membranes Simulated with the AMBER Lipid21 ForceField Using SPC/E, TIP3P, TIP3P-FB, TIP4P-FB, TIP4P-Ew, TIP4P/2005, TIP4P-D, and OPC Water Models

Este estudo demonstra que, entre oito modelos de água testados com o campo de força AMBER Lipid21 para simular membranas lipídicas, o modelo SPC/E é a escolha ótima por reproduzir com maior precisão as propriedades estruturais e dinâmicas experimentais sem necessidade de modificações.

Chakraborty, D. S., Singh, P. P., Dey, C., Kaur, J.2026-03-12
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User-driven development and evaluation of an agentic framework for analysis of large pathway diagrams

Este artigo descreve o desenvolvimento e avaliação orientados pelo usuário do Llemy, um sistema baseado em modelos de linguagem para explorar mapas de interação molecular complexos, destacando a importância da colaboração contínua com especialistas para aprimorar a utilidade da ferramenta e promover a transição para modelos de linguagem de pesos abertos no ambiente de pesquisa.

Corradi, M., Djidrovski, I., Ladeira, L., Staumont, B., Verhoeven, A., Sanz Serrano, J., Rougny, A., Vaez, A., Hemedan (…)2026-03-12