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biophysics

419 artigos

A biofísica revela como as leis da física explicam os mistérios da vida, desde o movimento de moléculas até o funcionamento de células inteiras. Neste espaço, exploramos descobertas que unem biologia e física para desvendar mecanismos vitais de forma clara e fascinante.

No Gist.Science, processamos cada novo pré-publicação desta categoria diretamente do bioRxiv. Nossa equipe transforma esses estudos complexos em resumos técnicos detalhados e explicações em linguagem simples, garantindo que qualquer pessoa possa compreender as últimas inovações sem barreiras acadêmicas.

Abaixo, você encontrará as mais recentes contribuições em biofísica, prontas para serem lidas e compreendidas.

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A High Throughput SPR-Based Array for Quantitative Profiling of Glycosaminoglycan Protein Interactions

Este artigo apresenta um novo arranjo de Ressonância de Plásmon de Superfície (SPR) de alto rendimento capaz de perfilar quantitativamente interações entre 16 preparações diversas de glicosaminoglicanos e proteínas, validando com sucesso especificidades de ligação conhecidas e descobrindo interações anteriormente não relatadas, tais como a ligação de Slit2 a condroitim e dermatan sulfatos.

Jowitt, T. A., Birchenough, H. L., Popplewell, J. F., Dyer, D. P., Day, A. J.2026-07-04
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De novo design of RNA pseudoknots with deep learning

Este artigo demonstra que ferramentas de aprendizado profundo, guiadas por um modelo de fundação RNet treinado em dados de mapeamento químico, podem projetar de novo pseudonós de RNA com estruturas secundárias precisas e dobras 3D bem ordenadas, igualando o desempenho humano em uma competição Eterna sem exigir soluções prévias para o problema geral de predição de estrutura 3D de RNA.

Townley, J., Kladwang, W., Baker, D., Blair, H. M., Choe, C., El Nesr, G., Favor, A., Fisker, E., Haack, D. B., He, S. (…)2026-07-03
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Using spIsoNet to address the preferred-orientation problem in cryoEM reconstructions

Este artigo apresenta um protocolo prático para o uso da ferramenta de aprendizagem profunda autossupervisionada e de código aberto spIsoNet para mitigar artefatos de orientação preferencial em reconstruções de criomicroscopia eletrônica (cryoEM) por meio de dois fluxos de trabalho complementares: correção de anisotropia de mapa e correção de desalinhamento de partículas.

Fan, H., Liu, Y.-T., Zhou, Z. H.2026-07-03
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Who's driving? Common evolutionary mechanism of activation of class A GPCRs

Ao alavancar a coevolução e o aprendizado de máquina para derivar uma variável coletiva independente de sequência, este estudo estabelece um mecanismo unificado e evolutivamente conservado para a ativação de GPCRs da classe A que permite a predição de transições conformacionais e efeitos de ligantes através de diversos membros da família, incluindo receptores órfãos.

Marciniak, A., Kozielewicz, P., Mitrovic, D., Delemotte, L.2026-06-30
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Collinearity of Decomposed Energy Terms in MM-GBSA Binding Free Energy Calculations

Este estudo demonstra que os termos de energia decompostos nos cálculos de energia livre de ligação MM-GBSA são altamente colineares em vez de independentes, revelando que as suposições tradicionais de separabilidade são inválidas e instigando a combinação de termos correlacionados em contribuições polares, não polares e entrópicas eficazes para uma modelagem preditiva mais robusta.

Sevim, A., Kocak, A.2026-06-29
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Cryo-EM Structures of Apo, Agonist- and Antagonist-Bound Heteromeric Kainate Receptors

Este estudo apresenta estruturas de criomicroscopia eletrônica (cryo-EM) de receptores de kainato heteroméricos GluK2/GluK5 nos estados apo, ligado ao agonista e ligado ao antagonista, revelando que os heterotetrâmeros exibem dinâmica conformacional reduzida em comparação aos homômeros e demonstrando que o direcionamento à subunidade GluK5 com UBP310 é mais eficaz do que o direcionamento à GluK2 ao travar o receptor em uma conformação de poro ocluído.

Tajima, N., Zhou, C., Segura-Covarrubias, G., Hoffman, A. M.2026-06-27
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Emergent Tissue Rheology in a 3D Mechanically Adaptive Viscoelastic Cell Network Model

Este artigo apresenta um modelo de rede celular viscoelástica mecanicamente adaptável em 3D que vincula interações discretas de células individuais e a remodelagem de conexões à reologia em escala tecidual, validando com sucesso sua capacidade de reproduzir fenômenos complexos como o redemoinho (swirling) e o entupimento (jamming) frente a ensaios experimentais de aspiração por micropipeta e compressão.

Kidambi, V., Tomizawa, Y., Hoshino, K.2026-06-19
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Role of stereochemistry on electron transport in peptides

Este estudo demonstra que modificações estereoquímicas em oligopeptídeos controlam significativamente o transporte de elétrons ao alterar o empilhamento de cadeias laterais aromáticas em sequências baseadas em tirosina e as conformações de estrutura secundária em sequências baseadas em alanina, oferecendo novos caminhos para o design de materiais eletrônicos baseados em peptídeos.

Samajdar, R., Chhabra, H., Meigooni, M., Yi, S., Liu, X., Wu, J. L., Tajkhorshid, E., Schroeder, C. M.2026-06-16
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A framework for the organization of microtubules in developing neurons

Este artigo propõe um arcabouço conceitual unificado e um modelo biofísico demonstrando como efeitos geométricos, amplificação paralela e mecanismos de polarização por compartilhamento de recursos estabelecem coletivamente as distintas orientações de microtúbulos que definem a diferenciação entre axônio e dendrito em neurônios em desenvolvimento.

Nicolaou, K., Mulder, B. M., Kapitein, L. C., Berger, F.2026-06-16