⚛️ Category

biophysics

365 artigos

A biofísica revela como as leis da física explicam os mistérios da vida, desde o movimento de moléculas até o funcionamento de células inteiras. Neste espaço, exploramos descobertas que unem biologia e física para desvendar mecanismos vitais de forma clara e fascinante.

No Gist.Science, processamos cada novo pré-publicação desta categoria diretamente do bioRxiv. Nossa equipe transforma esses estudos complexos em resumos técnicos detalhados e explicações em linguagem simples, garantindo que qualquer pessoa possa compreender as últimas inovações sem barreiras acadêmicas.

Abaixo, você encontrará as mais recentes contribuições em biofísica, prontas para serem lidas e compreendidas.

⚛️ biophysics

Binding Paths: Describing Small Molecule Interactions with Disordered Proteins via a Markov State Model

Este artigo introduz uma estrutura baseada em Modelo de Estados de Markov que caracteriza as interações de pequenas moléculas com proteínas desordenadas através de "caminhos de ligação" dinâmicos em vez de bolsões estáticos, racionalizando, assim, os mecanismos de reconhecimento e identificando regiões druggáveis para facilitar a descoberta de fármacos para alvos anteriormente intratáveis.

Louet, A. A. B., Hummer, G., Vendruscolo, M.2026-02-09
⚛️ biophysics

Early-Enrichment Hit Discovery via Reversible-Work c(t) Estimation in Metadynamics (CTMD)

Este artigo apresenta o CTMD, um protocolo de metadinâmica rápido, baseado em física e de código aberto que utiliza o estimador de trabalho reversível c(t) para alcançar um enriquecimento precoce robusto em triagem virtual, estabelecendo efetivamente a ponte entre métodos aproximados de docking/IA e cálculos de energia livre dispendiosos, ao mesmo tempo em que evita os artefatos de memorização e os vieses de conjuntos de treinamento observados em abordagens recentes de co-dobramento por IA.

Adury, V. S. S., Tiwary, P., Gu, X., Shekhar, M.2026-02-08
⚛️ biophysics

Unbend: Correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model

O artigo apresenta o "Unbend", um novo recurso no software cisTEM que utiliza um modelo de spline cúbica 3D para corrigir o movimento localizado da amostra induzido pelo feixe em imagens de criomicroscopia eletrônica (cryo-EM), melhorando significativamente as taxas de detecção de partículas e as relações sinal-ruído em diversos tipos de espécimes, ao mesmo tempo em que introduz distorção adicional mínima.

Kong, L., Zottig, X., Elferich, J., Grigorieff, N.2026-02-07
⚛️ biophysics

Structural basis for hydrolytic splicing of a circularly permuted group II intron

Este estudo apresenta dados bioquímicos e estruturas de criomicroscopia eletrônica (cryo-EM) de alta resolução de um íntron do grupo II circularmente permutado de *Comamonas testosteroni* para elucidar a mudança mecanística das vias de ramificação para as vias de splicing hidrolítico, revelando rearranjos no sítio ativo que permitem a produção de RNA circular e oferecendo novas estratégias para engenharia terapêutica.

Ling, X., Jinbiao, M., Chen, Z.2026-02-07
⚛️ biophysics

Active Site Local Environment Allows Acidic and Basic Synergy in Enzymatic Ester Hydrolysis by PETase

Este artigo revela que a enzima PETase alcança uma catálise ácida e básica sinérgica para a hidrólise de ésteres por meio do ambiente local de seu sítio ativo, o qual utiliza um transportador de prótons para a geração de nucleófilos e ligações de hidrogênio para a estabilização do estado de transição, sugerindo, assim, estratégias específicas de engenharia de proteínas para aumentar sua reatividade de degradação de plástico.

Fan, J., Ha, Y.2026-02-05
⚛️ biophysics

Droplet on Demand Tape Drive and XES Prototypes for Time-Resolved Serial Crystallography at VMXi, Diamond Light Source

Este artigo apresenta experimentos de protótipo na linha de luz VMXi da Diamond Light Source demonstrando a viabilidade de combinar a entrega de amostras por acionamento de fita de gota sob demanda com a espectroscopia de emissão de raios X (XES) para cristalografia serial resolvida no tempo em um sincrotron de terceira geração, uma metodologia anteriormente restrita a XFELs.

Aller, P., Sanchez-Weatherby, J., Telfer, A., Bosman, R., Devenish, N. E., Hinchliffe, P., Horrell, S., Ip, J., Littlewo (…)2026-02-04
⚛️ biophysics

Going around phase defects: reliable phase mapping for realistic data

Este artigo introduz um método de "mapeamento de fase estendido" aprimorado que detecta e contabiliza explicitamente defeitos de fase causados por blocos de condução ou limites anatômicos, eliminando, desta forma, falsas detecções e fornecendo uma caracterização mais confiável e fisiologicamente consistente de drivers rotacionais em arritmias cardíacas através de conjuntos de dados simulados, experimentais e clínicos.

Verstraeten, B., Lootens, S., Van Den Abeele, R., Van Nieuwenhuize, V., Okenov, A., Hendrickx, S., Santos bezzera, A., N (…)2026-02-04
⚛️ biophysics

The monomeric conformational ensembles of Aβ40 and Aβ42 encode their differential amyloid aggregation propensity

Através de simulações extensas e análises avançadas, este estudo demonstra que a propensão de agregação distinta da Aβ42 em comparação com a Aβ40 é codificada no nível do monômero pela maior propensão à estrutura β da Aβ42, conformações mais estendidas e maior exposição hidrofóbica, particularmente na região C-terminal.

Cadenelli, I., Ciccolo, A., Tagliabue, A., Rossi, G., Conti Nibali, V., Bochicchio, D.2026-02-02
⚛️ biophysics

Lipid droplet isolation as a novel platform for spectroscopic investigation of cargo modifications

Este estudo utiliza a espectroscopia Raman livre de rótulos de gotículas lipídicas isoladas para revelar uma remodelação metabólica distinta e específica do tratamento, bem como a heterogeneidade lipídica em células de Schwann normais versus células de MPNST malignas após o tratamento com canabidiol, radiação ionizante e sua combinação, estabelecendo, assim, uma nova plataforma para investigar mecanismos de radiossensibilização mediada por lipídios.

Chrabaszcz, K., Panek, A., Pogoda, K.2026-02-02