The Black Death Anomaly: A Non-Abelian Field Theory of Epidemiological Safe Zones

Este artigo propõe uma teoria de campo de gauge não abeliana, baseada na formalização de Doi-Peliti, para demonstrar que as zonas de segurança geográfica inexplicáveis durante a Peste Negra, como a Polônia e a Boêmia, são na verdade nós topológicos macroscópicos estáveis resultantes da interferência destrutiva de ondas de mutação patogênica acopladas a um campo ambiental SU(N)SU(N).

Jose de Jesus Bernal-Alvarado, David DelepineWed, 11 Ma🧬 q-bio

Toda-like Hamiltonian as a probe for quantized prey-predator dynamics

Este artigo analisa as características do espaço de fase de uma versão reduzida do Hamiltoniano tipo Toda, demonstrando que, ao emular a dinâmica presa-predador de Lotka-Volterra, o sistema exibe estabilidade quântica e permite a obtenção não perturbativa de perfis de distorção quântica sobre trajetórias clássicas, estabelecendo uma base teórica para descrever padrões quânticos em sistemas biológicos competitivos microscópicos.

Alex E. Bernardini, Orfeu BertolamiWed, 11 Ma⚛️ quant-ph

Misspecification of the generation time distribution and its impact on Rt estimates in structured populations

Este estudo demonstra que a suposição de uma distribuição de tempo de geração uniforme em populações estruturadas pode levar a estimativas imprecisas do número de reprodução efetivo (Rt), propondo metodologias para corrigir essa viés e enfatizando a necessidade de dados detalhados para orientar políticas de saúde pública.

Ioana Bouros, Robin Thompson, David Gavaghan, Ben LamberWed, 11 Ma🧬 q-bio

Generalizing matrix representations to fully heterochronous ranked tree shapes

Este artigo estende a representação matricial conhecida como matrizes **F**, anteriormente aplicada a árvores filogenéticas isocrônicas, para árvores totalmente heterocrônicas, estabelecendo uma bijeção explícita que permite a enumeração direta de todas as formas de árvores válidas e o desenvolvimento de modelos probabilísticos.

Chris Jennings-Shaffer (Cherith), Ziyue (Cherith), Chen, Julia A Palacios, Frederick A Matsen IVTue, 10 Ma🔢 math

A Class of Unrooted Phylogenetic Networks Inspired by the Properties of Rooted Tree-Child Networks

Este artigo propõe as novas classes de redes filogenéticas não enraizadas chamadas redes qq-cortáveis, demonstrando que, ao contrário das redes orientáveis para árvore-filho (cujo reconhecimento é NP-difícil), elas são reconhecíveis em tempo polinomial e permitem resolver o problema de contenção de árvores em tempo polinomial para q3q \geq 3.

Leo van Iersel, Mark Jones, Simone Linz, Norbert ZehTue, 10 Ma🔢 math

Modeling the spillover risk of highly pathogenic avian influenza from wild birds to cattle in Denmark: A data-driven risk assessment framework

Este estudo desenvolve um modelo quantitativo baseado em dados para avaliar o risco de transmissão do vírus da gripe aviária altamente patogênica (H5N1) de aves selvagens para o gado na Dinamarca, identificando períodos e áreas geográficas de maior risco para orientar a vigilância e a preparação do país.

You Chang, Jose L. Gonzales, Erik Rattenborg, Mart C. M. de Jong, Beate ConradyThu, 12 Ma🧬 q-bio

SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction

O artigo apresenta o SDSR, um método escalável de dividir-e-conquistar baseado em teoria espectral de grafos para reconstrução de árvores filogenéticas, que oferece ganhos significativos de velocidade sem comprometer a precisão ao lidar com grandes conjuntos de dados e discordância genética.

Ortal Reshef (Hebrew University of Jerusalem), Ofer Glassman (Weizmann Institute of Science), Or Zuk (Hebrew University of Jerusalem), Yariv Aizenbud (Tel Aviv University), Boaz Nadler (Weizmann Institute of Science), Ariel Jaffe (Hebrew University of Jerusalem)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Macroscopic Dominance from Microscopic Extremes: Symmetry Breaking in Spatial Competition

O artigo apresenta um modelo estocástico que demonstra como a quebra de simetria inicial na competição espacial, regida pela estatística de valores extremos, exige uma população exponencialmente maior para superar desvantagens, mas que a dominância macroscópica robusta só é alcançada através de um viés de interação não recíproco que estabiliza flutuações locais.

Stuti Guha, Shawn D. Ryan, Bhargav R. KaramchedThu, 12 Ma🧬 q-bio

Conditionally Site-Independent Neural Evolution of Antibody Sequences

O artigo apresenta o CoSiNE, um modelo que combina cadeias de Markov contínuas com redes neurais para capturar a dinâmica evolutiva e as interações epistáticas em anticorpos, superando os métodos atuais na previsão de efeitos de variantes e permitindo a otimização direcionada da afinidade de ligação.

Stephen Zhewen Lu, Aakarsh Vermani, Kohei Sanno, Jiarui Lu, Frederick A Matsen, Milind Jagota, Yun S. SongMon, 09 Ma🤖 cs.LG

Risk mapping novel respiratory pathogens with large-scale dynamic contact networks

Este estudo desenvolve um modelo baseado em agentes de grande escala que integra dados demográficos e de mobilidade dos Países Baixos para mapear a propagação de patógenos respiratórios em redes de contato dinâmicas, demonstrando como perfis geográficos e demográficos iniciais influenciam a epidemia e avaliando estratégias de intervenção como o isolamento e restrições de viagem.

Matthijs Romeijnders, Michiel van Boven, Debabrata PanjaMon, 09 Ma🔬 physics

Can deleterious mutations surf deterministic population waves? A functional law of large numbers for a spatial model of Muller's ratchet

O artigo demonstra que, sob uma escala apropriada, o modelo espacial da roda de Muller converge para um sistema de equações diferenciais parciais, permitindo determinar rigorosamente a velocidade de propagação da população e confirmar que mutações deletérias podem "surfear" as ondas populacionais.

João Luiz de Oliveira Madeira, Marcel Ortgiese, Sarah PeningtonMon, 09 Ma🔢 math

Extracting useful information about reversible evolutionary processes from irreversible evolutionary accumulation models

O artigo investiga se modelos de acumulação evolutiva que assumem irreversibilidade podem fornecer informações úteis sobre processos reversíveis, demonstrando que, embora a estimativa de incertezas e interações seja propensa a erros, as inferências sobre a ordem relativa de aquisição de características e a estrutura dinâmica central dos caminhos evolutivos permanecem robustas.

Iain G. JohnstonFri, 13 Ma🧬 q-bio

A mean-field theory for heterogeneous random growth with redistribution

Este estudo desenvolve uma teoria de campo médio para crescimento aleatório heterogêneo com redistribuição, identificando que, embora migrações fortes previnam a localização extrema em taxas de crescimento estáticas, a adição de ruído temporal introduz uma fase parcialmente localizada que mitiga, mas não elimina, a concentração extrema, com implicações para desigualdade de riqueza e crescimento populacional.

Maximilien Bernard, Jean-Philippe Bouchaud, Pierre Le Doussal2026-03-11💰 q-fin

A hybrid discrete-continuum modelling approach for the interactions of the immune system with oncolytic viral infections

Este artigo apresenta um novo modelo estocástico agente-baseado acoplado a equações de balanço para descrever a interação entre o sistema imune e vírus oncolíticos, derivando seu limite contínuo e demonstrando que uma resposta imune excessivamente rápida pode comprometer a eficácia da terapia, destacando a importância da modulação personalizada da resposta imune.

David Morselli, Marcello E. Delitala, Adrianne L. Jenner + 1 more2026-03-10🧬 q-bio