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🧬 biologia

Metagenomic insights into the soil microbiome of ex situ Cathaya argyrophylla: differentiation patterns and implications for conservation

Este estudo utiliza o sequenciamento metagenômico e a análise físico-química do solo para revelar padrões de diferenciação distintos e direcionadores ambientais das comunidades bacterianas, arqueanas e fúngicas no solo de conservação ex situ da espécie ameaçada *Cathaya argyrophylla*, ao mesmo tempo em que identifica uma maior abundância de genes funcionais de interrupção imunológica em sua rizosfera para informar futuras estratégias de manejo de conservação.

Jingyuan Luo, Xiaoming Tian, Zhaoshan Wang, Hao Lv2026-10-08
🧬 biologia

Rank-based integration identifies convergent disease mechanisms across omics

Este artigo apresenta o ORBIT, uma ferramenta de integração baseada em ranking e consciente de direção que identifica eficazmente mecanismos de doenças robustos e concordantes através de camadas ômicas heterogêneas ao superar variações de plataforma e de coorte, conforme demonstrado através de sua aplicação aos conjuntos de dados de doença renal crônica e cardiomiopatia dilatada.

Yang Luo, Zifeng Qiu, Duncan Palmer, Luke Jostins-Dean, Andrew Lewis, Katherine Bull, Jagdeep Nanchahal2026-10-08
🧬 biologia

Uncovering aquatic diversity patterns in Plecoptera and Trichoptera (Insecta) immatures in the riffles of the Xingu River

Este estudo revela que, embora os gradientes ambientais não tenham explicado significativamente os padrões de assembleia de Plecoptera e Trichoptera nos corredeiras do Rio Xingu, a beta-diversidade taxonômica foi primordialmente impulsionada pela substituição de gêneros e a beta-diversidade funcional por mudanças equilibradas de abundância, destacando a importância dessas métricas para avaliar a diversidade de insetos aquáticos amazônicos.

Eduarda Silva de Lima, Larissa Sousa de Barros, Ana Gabrielle Nascimento dos Santos, Emilly Vieira Drosdosky, Iluany da (…)2026-10-08
🧬 biologia

Cross-kingdom Microbial Reassembly During Organic Amendment-Assisted Biodegradation of PAHs in Soil

Este estudo demonstra que as emendas orgânicas de folhas reestruturam as comunidades bacterianas e fúngicas do solo e suas associações entre reinos de maneira dependente da dose, impulsionando a biodegradação de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HAPs) através de reestruturação funcional e processos de montagem específicos, com altos níveis de emenda (70%) causando perturbação significativa e redução na recuperação.

Olanrewaju Roland Akinseye, Charles W. Knapp2026-10-08
🧬 biologia

EukaUTR: a foundation model unifying functional modelling and design of eukaryotic 3′ UTRs

O EukaUTR é um modelo de fundação treinado em diversas sequências de 3′ UTRs eucarióticas que unifica a predição funcional e o design de novo, superando os baselines existentes em múltiplas tarefas regulatórias e permitindo a otimização direcionada de sequências para reduzir as taxas de degradação de mRNA.

Xiaolin Li, Mei Lang, Xingyu Fang, Mingxuan Chen, Zhen Wang, Zhaowen Cheng, Xiagu Zhu, Kin Yip Tam, Junwei Zhang2026-10-08
🧬 biologia

Toward a Transferable Representation of Protein Dynamics for Functional Prediction and Mechanistic Discovery

Este artigo apresenta a Rede de Grafos Dinâmicos Invariante à Topologia (TIDGN), uma estrutura de aprendizado profundo que codifica a dinâmica conformacional de proteínas em uma "assinatura de movimento proteico" transferível para alcançar alta precisão na predição funcional e insights mecanísticos através de diversas famílias de proteínas, superando as linhas de base existentes mesmo em avaliações de sequências disjuntas.

Nahid Monowar2026-10-08
🧬 biologia

From Rice to Dairy Cattle: A Cross-Kingdom Machine Learning Framework for Identifying Conserved Molecular Biomarkers of Thermal Stress.

Este artigo apresenta o Algoritmo de Fusão de Biomarcadores Estáveis Conservados (CSBFA), uma estrutura de aprendizado de máquina inter-reinos que identifica com sucesso biomarcadores moleculares evolutivamente conservados de estresse térmico ao integrar relevância preditiva, estabilidade e coerência biológica por meio de um estudo de caso comparando a transcriptômica de arroz e de gado leiteiro.

Nitin Kumar, Devender Kumar2026-10-08