🧬 biologia

Cross-trait fine-mapping and sequence modeling prioritize an AHSG splicing mechanism at an otosclerosis locus

Ao integrar o mapeamento fino de traços cruzados, a modelagem de sequências e dados genômicos históricos, este estudo prioriza um mecanismo de splicing específico do AHSG envolvendo as variantes rs4917 e rs4918 como uma provável via causal para a otosclerose, apesar da incapacidade de estabelecer definitivamente a causalidade ao nível de nucleotídeo ou a fase histórica.

Baptiste Dumoulin2026-10-07
🧬 biologia

Sublaterodorsal tegmental nucleus α-Synuclein seeding uncouples neuropathology from Parkinson's disease- relevant functional deficits in wild-type mice

Embora a semeadura bilateral de α-sinucleína no núcleo tegmentar sublaterodorsal de camundongos selvagens tenha induzido com sucesso a agregação e propagação proteica generalizadas, ela falhou em produzir os déficits funcionais esperados relacionados à doença de Parkinson, características do transtorno do comportamento do sono REM ou neurodegeneração, indicando que fatores de suscetibilidade adicionais são necessários para que a patologia se traduza em disfunção clínica.

Annelore Anthonissen, Dries Crauwels, Wilhelmus Drinkenburg, Patrik Verstreken, Juan Diego Pita Almenar, Abdallah Ahnaou2026-10-07
🧬 biologia

The processing class of the second residue is conserved across three domains of life, and retention of the initiator methionine is coupled to packing into the protein fold

Este estudo demonstra que a conservação evolutiva do destino de processamento da metionina iniciadora — determinada pela classe do segundo resíduo em todos os três domínios da vida — é impulsionada por pressões funcionais distintas, especificamente o enriquecimento no aparato de tradução para resíduos de tipo remoção e os requisitos de empacotamento estrutural para resíduos de tipo retenção.

Yie-Hwa Chang2026-10-07
🧬 biologia

Omitting tumor proliferation from prognostic gene expression models: a preregistered cross-cancer test, a transcriptome-wide measurement, and a survey of how often the omission is made

Este estudo pré-registrado demonstra que omitir a proliferação tumoral de modelos prognósticos de expressão gênica em carcinoma hepatocelular e em outros cânceres enviesa sistematicamente quase todas as estimativas gênicas, contudo, as previsões específicas do autor em relação à consistência e magnitude desse viés através de coortes foram amplamente refutadas pelos dados.

SOON WOO NAM2026-10-07
🧬 biologia

A context-dependent glucocorticoid receptor-SCARA5 axis coupled to ferritin/iron handling in osteoporotic bone marrow stromal cell fate: transcriptomic reanalysis and regulatory nomination

Este estudo integra a reanálise transcriptômica e evidências regulatórias para propor um eixo receptor de glicocorticoide–SCARA5 dependente de contexto que acopla o manejo de ferro ao desequilíbrio de destino osteogênico–adipogênico em células estromais de medula óssea osteoporóticas, embora a validação funcional desta nomeação regulatória ainda seja necessária.

Beiji Lu2026-10-07
🧬 biologia

Does RNA-seq Add Prognostic Value Beyond Clinical Variables Under Site-Held-Out Validation in TCGA-KIRC?

Em uma coorte TCGA-KIRC, um ganho prognóstico modesto ao adicionar dados de RNA-seq às variáveis clínicas não foi atenuado quando sítios inteiros de origem de tecido foram retidos durante a validação, sugerindo que a variação correlacionada ao sítio não explica totalmente as melhorias de desempenho relatadas, embora os achados sejam limitados pelo desenho de coorte única e pelas escolhas específicas de modelagem do estudo.

Vikhram S2026-10-07
🧬 biologia

Transcriptomic Prediction of Bone Metastasis in Breast Cancer: A Methodological Investigation Revealing Limited Generalizability of Machine Learning Models

Este estudo demonstra que modelos de aprendizado de máquina treinados em dados transcriptômicos falham em generalizar para conjuntos de teste independentes para a predição de metástase óssea de câncer de mama, destacando a importância crítica de protocolos de avaliação rigorosos e livres de vazamento sobre resultados otimistas de validação cruzada.

Shunxin Yao2026-10-07
🧬 biologia

Patient-level coronary artery disease classification from cardiac MRI using out-of-fold heart segmentation and same-slice region controls

Este estudo demonstra que as representações de região de interesse cardíaca fora da dobra (out-of-fold) derivadas de ressonância magnética cardíaca superam significativamente a imagem completa e os controles extracardíacos na classificação de doença arterial coronariana em nível de paciente, embora os achados permaneçam uma prova de conceito metodológica limitada por uma coorte pequena e restrições de conjunto de dados.

David Vlad Marghidan2026-10-07