🧬 biology

Hierarchically supervised computational pathology stratifies HER2 categories and ERBB2 amplification risk from routine H&E slides in breast cancer

O artigo apresenta o CHERISH, um framework de patologia computacional hierarquicamente supervisionado que utiliza lâminas de H&E de rotina para estratificar com precisão as categorias de HER2 e prever o risco de amplificação de ERBB2 ao incorporar a lógica de testes clínicos em sua arquitetia, superando assim as limitações de modelos convencionais e reduzindo a necessidade de testes confirmatórios de uso intensivo de recursos.

Xiaohua Zeng, Yansong Ba, Long Wang, Xiaomin Xiong, Xin Zhou, Qingming Jiang, Sihao Liu, Shanqi Li, Zhigang Pei, Tao Zha (…)2026-06-29
🧬 biology

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

Este artigo apresenta o Spec-ReX, um método de IA explicável baseado em responsabilidade causal para espectroscopia vibracional no diagnóstico de câncer, e valida rigorosamente seu desempenho contra outras técnicas de XAI através de conjuntos de dados in silico, in vitro e ex vivo para abordar a necessidade crítica de uma tomada de decisão clínica transparente.

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biology

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

Este estudo revela que a extrusão de alças mediada por coesina ancora forquilhas de replicação adjacentes para promover seu retardamento e reversão durante o estresse de replicação ao inibir a PRIMPOL, integrando, assim, a organização do genoma com a tolerância ao dano de DNA para proteger a estabilidade genômica.

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
🧬 biology

The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

A missão Artemis I induziu mudanças dependentes do genótipo nos perfis de aminoácidos das sementes e no crescimento pós-voo em *Arabidopsis thaliana*, revelando que o metabolismo de aminoácidos de cadeia ramificada é um fator crítico que influencia as respostas das plantas à exposição ao espaço profundo.

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biology

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

Este estudo estabelece um arcabouço robusto integrando fenotipagem multiespectral baseada em UAV e estudos de associação genômica de séries temporais para identificar loci genéticos dinâmicos e o gene candidato *Zm00001d048615* que regulam o índice de área foliar do milho, oferecendo alvos valiosos para a melhoria da arquitetura do dossel e do rendimento.

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
🧬 biology

Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

Este estudo desafia a visão de longa data de que a espermiogênese envolve o silenciamento transcricional global ao demonstrar que o genoma haploide permanece transcricionalmente ativo e dinamicamente organizado ao longo desta fase, necessitando de uma redefinição da diferenciação dos espermátidas tardios como um período de especialização transcricional em vez de desligamento.

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29
🧬 biology

Daily symptom reports enable four-phase menstrual cycle tracking without wearables: Implications for equitable digital health

Este estudo demonstra que um modelo híbrido de aprendizado de máquina utilizando a variabilidade diária de sintomas autorrelatados pode classificar com precisão quatro fases do ciclo menstrual sem o uso de sensores vestíveis, oferecendo uma solução escalável e equitativa para o monitoramento da saúde reprodutiva global.

Bernhard Specht, Mohammad EL-Khozondar, Samaher Garbaya, Reinhard Schneider, Djamel Khadraoui, Zied Tayeb2026-06-29
🧬 biology

Efficient exploration of conformational ensembles via protein interaction-informed deep learning

Este artigo apresenta o DynoM, um framework de aprendizado profundo generativo treinado em interações de complexos proteicos que supera significativamente os modelos existentes baseados apenas em monômeros na previsão de conjuntos conformacionais precisos e na supressão de alucinações estruturais ao aproveitar as restrições físicas de longo alcance inerentes aos dados de complexos.

Zilin Ren, Duo Liu, Qianyi Jia, Qiantong Jin, Yubin Liu, Chan Liu, Zhixiang Sui, Luyao Han, Yixiang Zhang, Xin Yang, Pin (…)2026-06-29
🧬 biology

Delayed downstream detection and persistence of fish eDNA in a low-flow stream: a field observation

Este estudo fornece evidências de campo de que, em riachos de baixo fluxo, os sinais de eDNA de peixes exibem um aparecimento tardio a jusante e persistem por um período após a remoção do organismo de origem, destacando a necessidade de considerar a dinâmica de transporte e a persistência temporal ao interpretar dados de eDNA em ecossistemas lóticos.

KeonHee Kim, KyuJin Kim, JongWook Kim, JaeGoo Kim, Ji-Woong Choi, Min-Ho Jang2026-06-29