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🧬 biologia

ClusterSyn: Cell-Line-Specific Topology-Aware Drug-Combination Response Prediction on the O'Neil Dataset

O ClusterSyn é um framework baseado em grafos e consciente de topologia que aproveita a topologia de medição estruturada do conjunto de dados O'Neil para prever respostas a combinações de drogas específicas de linhagens celulares ao modelar células cancerígenas como grafos de interação ponderados, identificar módulos de drogas locais via agrupamento de Markov e integrar esses recursos por meio de um modelo de ensemble modular para superar métodos de linha de base.

‌Babak Bahrialiabadi, Shokoofeh Ghiam, Changiz Eslahchi2026-09-28
🧬 biologia

AFTERGLOW: a half-life-aware workflow for sampling-time-aware interpretation of bulk transcriptomes

O artigo introduz o AFTERGLOW, um fluxo de trabalho que aprimora a interpretação de dados de transcriptoma em massa ao incorporar explicitamente o tempo de amostragem e suposições de meia-vida do RNA para distinguir evidências estáveis e condicionadas ao modelo de resultados sensíveis ao delineamento experimental quando medições cinéticas diretas não estão disponíveis.

Jinlu huyan, Jianbo Xiu2026-09-28
🧬 biologia

First documented occurrence of Pseudamia sp. from the marine cave environment of Turtle Tomb, Sipadan Island, Sabah, Malaysia

Este artigo relata a primeira ocorrência documentada de uma espécie de *Pseudamia* na caverna marinha Turtle Tomb da Ilha de Sipadan, Malásia, identificada por meio de observações de vídeo subaquáticas não invasivas em conformidade com as regulamentações de conservação locais que proíbem a coleta de espécimes.

Roihan Han, Abdul-Rahim Azman2026-09-28
🧬 biologia

A Static Core in a Dynamic Inheritance: Spatial Partitioning and Redundancy Ensure Century-Long Stability of Jiuyao Microbiota

Este estudo revela que a estabilidade secular da microbiota de Jiuyao ao longo de 361 gerações é mantida por um núcleo estático de espécies-chave e redundância funcional estruturada espacialmente, onde o teor de água impulsiona a sucessão comunitária e zonas distintas de superfície-núcleo garantem o amortecimento metabólico e o desempenho consistente da fermentação.

Tiantian Liu, Shuangping Liu, Haipo Liu, Ting Zhao, Zhihui Li, Huijun Zou, Hongyan Qu, Chen Yang, Xiao Han, Jian Mao2026-09-28
🧬 biologia

Hidden diversity and barcode gaps in Balearic annelid polychaetes (Western Mediterranean) revealed by an integrative checklist

Este estudo apresenta o primeiro checklist taxonomicamente padronizado de poliquetas das Baleares, revelando uma riqueza de espécies significativamente maior e assembleias espaciais distintas do que o conhecimento prévio, ao mesmo tempo em que destaca lacunas críticas na cobertura de DNA barcode que necessitam de recursos moleculares expandidos para o futuro monitoramento da biodiversidade e conservação.

Enrique Arboleda, Maria Barroso, Daniel Martin, Imene Benali, Tommaso Cancellario, Noemi Colinas, Alejandro Damian-Serra (…)2026-09-28
🧬 biologia

Trilobatin combats copper overload-induced cognitive impairment by blocking FDX1-dependent cuproptosis and restoring mitochondrial dynamics

O trilobatin atenua o comprometimento cognitivo e a lesão hipocampal induzidos pela sobrecarga de cobre ao regular bidirecionalmente os transportadores de cobre para reduzir o depósito intracelular de cobre e ao inibir a cuproptose dependente de FDX1 para restaurar a dinâmica e a função mitocondrial.

Guozhen Lan, Wang Ran, Zhishu Yang, Fangqin Hou, Wenfang Zhang, Dongjing Liu, Nana Chen, Haibo Li, Jianmei Gao, Guohui L (…)2026-09-28
🧬 biologia

Neurogenesis ablation exacerbates dopaminergic dysfunction and fine motor deficits induced by 6-OHDA in rats

Este estudo demonstra que a ablação da neurogênese adulta em ratos exacerba a disfunção dopaminérgica induzida por 6-OHDA e os déficits motores finos, revelando uma interação bidirecional crítica entre a neurogênese e a patologia da doença de Parkinson que poderia informar novas estratégias terapêuticas.

Bruna Araújo, Rita Caridade-Silva, Ana Vilaça-Ferreira, Joana Martins-Macedo, Catarina Teixeira, Carla Soares-Guedes, Te (…)2026-09-28
🧬 biologia

The type of mismatch repair deficiency shapes dinucleotide repeat expansion and WRN inhibitor sensitivity in colorectal cancer

Este estudo utiliza o sequenciamento de leitura longa para demonstrar que deficiências específicas no reparo de incompatibilidade no câncer colorretal impulsionam diferencialmente expansões de repetições de dinucleotídeos, particularmente longas repetições de TA em tumores deficientes em MSH2, MLH1 e PMS2, definindo assim um panorama genético distinto onde é improvável que ocorra resistência adquirida a inibidores de WRN.

Cathy Saab, Emmanuelle Despras, Louisa Bekkouche, Marine Guedet, Gwendolyn Renaudin, Aurelie Siret, Cody Feys, Nathalie (…)2026-09-28
🧬 biologia

Gut microbial structural variation improves disease discrimination and reveals a strain-level regulatory mechanism in rheumatoid arthritis

Este estudo demonstra que analisar variantes estruturais (SVs) microbianas, em vez de apenas a abundância de espécies, revela variações genômicas ao nível de linhagem na artrite reumatoide, melhorando significativamente a discriminação da doença e revelando mecanismos regulatórios específicos envolvendo *Faecalibacterium prausnitzii* e *Agathobacter rectalis*.

Yang Ou, Shengyan Zhao, Jiachun Weng, Yichen Long, Huamei Li, Yue Hou, Qing Xiong, Sha Liu, Zhikang Wang, Guangxiang Hua (…)2026-09-28