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🧬 biologia

Machine Learning-Driven Identification of Therapeutic Checkpoints in Rheumatoid Arthritis: A Network-Based Approach to Discover Resolution- Promoting Agents

Este estudo emprega uma análise de rede impulsionada por aprendizado de máquina de dados transcriptômicos sinoviais para identificar pontos de controle terapêuticos fundamentais (MYC, PTPRC, JUN) e reposicionar a Manumicina A e a Salermida como agentes promotores de resolução para a Artrite Reumatóide, culminando em um dashboard interativo para acelerar a medicina de precisão.

Ahmad Fathinejad2026-09-25
🧬 biologia

Distinct cortical immune-signaling profiles in autism spectrum disorder and severe mental illness

Este estudo revela que, embora tanto o transtorno do espectro autista quanto a doença mental grave envolvam uma sinalização neuroimune cortical alterada, eles exibem perfis proteicos distintos em vez de um estado inflamatório compartilhado, com o TEA sendo caracterizado por marcadores relacionados à IL-1 elevados e a DMA por um aumento de eotaxina.

Evan Haley, Erin L. Carlson, Kari L. Hanson, Alicja Omanska, Joseph Schauer, Sabrina Ereshefsky, Dana Tzuahzia Lee, Rebe (…)2026-09-25
🧬 biologia

Brain-inspired cascaded EEG speech decoding with conformal calibration and adaptive exit: simulation validation and five-stage real-data assessment

Este artigo propõe e valida um framework de decodificação de fala por EEG em cascata inspirado no cérebro que integra calibração conformada com mecanismos de saída adaptativa e inferência conformada adaptativa de Gibbs–Candès para alcançar quantificação de incerteza estatisticamente rigorosa e desempenho robusto em tempo real, enquanto diagnostica sistematicamente falhas de cobertura e estabelece baselines metodológicos para o rastreamento neural de fala confiável.

daqian chen2026-09-25
🧬 biologia

External Transportability and Tissue Context of Parsimonious Breast Tumour-Normal Transcriptomic Score

Este estudo demonstra que um escore transcriptômico parcimonioso de tumor mamário-normal, embora mantenha alta discriminação externa, captura primordialmente a perda de programas de metabolismo lipídico e adiposo normais em vez de apenas uma assinatura de célula maligna portátil, destacando o papel crítico do contexto tecidual na transportabilidade de classificadores.

Subhajit Ghosh, Abhirup Saha, Vetrivel Baskar2026-09-25
🧬 biologia

An Explainable XGBoost Framework for Anxiety and Depression Risk Prediction with SHAP and Counterfactual Reasoning

Este estudo apresenta uma estrutura de XGBoost explicável para a previsão de risco de ansiedade e depressão que aborda o desequilíbrio de classes e o rigor de avaliação, integrando SHAP e raciocínio contrafactual para fornecer insights transparentes e interpretáveis sobre as decisões do modelo sem substituir o diagnóstico clínico.

Anima Dahal, Bibash Basnet2026-09-25
🧬 biologia

A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the Gansu Red Deer (Cervus elaphus kansuensis)

Este estudo apresenta uma montagem de genoma de referência de alta qualidade, em nível de cromossomo, e a sua anotação do cervo-do-gansu (Cervus elaphus kansuensis), endêmico e protegido nacionalmente, fornecendo um recurso genômico crucial para avançar pesquisas futuras sobre sua diversidade genética, história evolutiva e conservação.

Hai Liu, Yun Fang, Xiaochan Bai, Zuoqing Yan, Qingling Wa, Nan Sun, Guogang Li2026-09-25
🧬 biologia

HiDAC: A Hierarchical Dictionary-Aided Compression Framework for Genomic Sequences

O artigo propõe o HiDAC, um framework de compressão hierárquica auxiliado por dicionário que alcança razões de compressão de DNA competitivas, ao mesmo tempo em que permite análises subsequentes significativamente mais rápidas, como consultas de frequência de substrings, diretamente na representação tokenizada comprimida sem a descompressão total.

Manthan Shah, Rahul Semwal, Imlimaong Aier, Prabhat Tripathi, Pritish Kumar Vardwaj2026-09-25
🧬 biologia

Carbon-Convergent Co-utilization of Ethanol and CO2 Enables 3-Hydroxypropionate Biosynthesis in Komagataella phaffii

Este estudo demonstra que a *Komagataella phaffii* engenheirada alcança uma produção de novo recordista de 3-hidroxipropionato ao utilizar uma estratégia "2+1" redox-complementar que co-consome etanol e CO2, convertendo com sucesso fluxos de redução de CO2 químico não purificados em produtos multicarbonetos de alto valor.

Jianming Liu, Tong Liu, Hanbin Lei, Zhiqiang Chen, Yudian Zhu, yongjun mao, Jiacheng Feng, An-ping Zeng2026-09-25
🧬 biologia

LucaCell: a sequence-centric foundation model for cross-species single-cell analysis

O LucaCell é um modelo de fundação centrado em sequências que utiliza embeddings de sequências de mRNA pré-treinados em vez de identificadores de genes fixos para permitir uma análise de célula única robusta entre espécies, modalidades e contextos, incluindo transferência precisa de tipos celulares, diferenciação de espécies microbianas e predição de interação hospedeiro-vírus.

Yan Sun, Yong He, Minsi Ren, Yanhui Wang, Penghao Xu, Yong Hou, Yu Kang, Tingjun Hou, Jieping Ye, Huanming Yang, Zheng W (…)2026-09-25