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🧬 biologia

Basal expression predicts context-specific drug responses only where they are reproducible: a leakage-safe 47-line LOCO benchmark on Tahoe-100M

Este benchmark pré-registrado e livre de vazamento demonstra que a capacidade da expressão do transcriptoma basal em prever respostas a drogas específicas de contexto é fundamentalmente limitada pela baixa reprodutibilidade do sinal alvo, com a predição significativa emergindo apenas para um pequeno subconjunto de drogas onde a resposta residual é suficientemente confiável.

Huazhang Shen2026-09-01
🧬 biologia

HADIA-KB: Evidence-Preserving Digital Knowledge Infrastructure for Jharkhand’s Traditional Rice Beer

O HADIA-KB é uma infraestrutura de conhecimento digital preservadora de evidências que agrega e mapeia dados científicos e culturais fragmentados sobre a cerveja de arroz tradicional de Jharkhand em um grafo reprodutível e com origem comprovada, destacando explicitamente lacunas de documentação e variações regionais em vez de consolidar diversas tradições em uma narrativa única.

Mohammad Amir Khusru Amir2026-09-01✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biologia

GRP: A Representation-Aware Effective Geometry of Protein State Space

Este artigo introduz o GRP, um framework inspirado na relatividade geral que modela espaços de estados proteicos como variedades geométricas conscientes de coordenadas para identificar invariantes estáveis que ligam representações de IA a restrições biológicas, demonstrando que alguns poucos modos dominantes capturam a maior parte da variância conformacional e que caminhos biológicos estruturados exibem propriedades de transporte distintas em comparação com modelos nulos.

Chuanyang Liu2026-09-01
🧬 biologia

Chromosome-level genome of the white jade snail reveals conserved genomic architecture and functional divergence from wild Achatina fulica

Este estudo apresenta a primeira montagem genômica em nível de cromossomo do caracol jade branco cultivado, revelando sua estreita relação filogenética e sintenia conservada com o caracol gigante africano selvagem (*Achatina fulica*), ao mesmo tempo em que destaca divergências funcionais nas vias metabólicas e de resposta ao estresse associadas à domesticação.

Hai Liu2026-09-01
🧬 biologia

Illiosentis furcatus (Acanthocephala: Leptorhynchoididae): Morphological study, molecular characterization, and phylogenetic analysis justify reinstatement of Tegorhynchus cetratus

Este estudo combina o exame morfológico e a análise filogenética molecular para demonstrar que *Illiosentis cetratus* é geneticamente distinta de outras espécies de *Illiosentis*, justificando, assim, o restabelecimento do gênero *Tegorhynchus* para esta espécie.

Kaitlynn M. Stewart, Kristina M. Hill-Spanik, Eric J. McElroy, Isaure de Buron2026-09-01
🧬 biologia

Dopaminergic Degeneration and GBA Mutation Status Predict Prior–Sensory Arbitration Disruption in Parkinson's Disease: A Multimodal Computational Framework

Este estudo computacional multimodal do conjunto de dados PPMI sugere que as alucinações da doença de Parkinson surgem de uma interrupção progressiva na arbitragem entre a evidência sensorial e as expectativas prévias, caracterizada por uma sensibilidade sensorial reduzida e um aumento de falsos alarmos impulsionados pelo ruído, que são fortemente preditos pela degeneração dopaminérgica e pelo status de mutação GBA, apesar das limitações significativas em estimar precisamente o parâmetro central de arbitragem a partir de dados comportamentais de visita única.

Khanh-Dung Tran2026-09-01
🧬 biologia

Intracavity Nuclear Elastography

Este artigo apresenta a elastografia nuclear intracavidade, uma plataforma de detecção não linear que integra células vivas em um laser de microcavidade para amplificar deformações nucleares ínfimas induzidas por ultrassom via dinâmica de bifurcação, alcançando uma sensibilidade mais de 120 vezes superior aos métodos convencionais para o mapeamento quantitativo e não invasivo da mecânica nuclear e fenotipagem celular multidimensional.

Chaoyang Gong, Zhonghao Li, Zhihan Cai, Guifeng Li, Guoquan Wang, Yue Zhao, Xi Yang, Yuan Gong, Hong Zhang, Yang Luo, Ta (…)2026-09-01
🧬 biologia

Machine Learning–Based Classification of Cancer Using Promoter-Associated 5-Hydroxymethylcytosine Signatures in Cell-Free DNA

Este estudo demonstra que uma estrutura de aprendizado de máquina utilizando assinaturas de 5-hidroximetilcitosina (5hmC) associadas a promotores a partir de DNA livre de células pode distinguir de forma eficaz e precisa o câncer de amostras saudáveis, oferecendo uma estratégia não invasiva promissora para a detecção precoce do câncer e oncologia de precisão.

Tisha Sehrawat2026-09-01
🧬 biologia

An epigenetically stabilized regulatory state underlies stable glioblastoma invasion

Este estudo demonstra que a invasão do glioblastoma pode ser mantida como um estado regulatório estável e intrínseco à célula, impulsionado por uma remodelação epigenética coordenada e redes de fatores de transcrição (especificamente ATF4 e MYC/MAX), o que estratifica significativamente a sobrevida dos pacientes e oferece potenciais alvos terapêuticos.

Ann-Christin Hau, Tanja Buhlmann, Sophie Schreiner, Camille Cialini, Vera Laub, Petr Nazarov, Arnaud Muller, Kimia Kafi (…)2026-09-01
🧬 biologia

Gut Microbiome Composition of Wild and Captive Black Capuchin Monkeys (Sapajus nigritus)

Este estudo demonstra que a composição do microbioma intestinal e o potencial funcional previsto de macacos-capuchinhos selvagens e cativos diferem significativamente, com indivíduos cativos exibindo maior riqueza microbiana e perfis taxonômicos e metabólicos distintos, provavelmente impulsionados por diferenças na dieta, no ambiente e nas condições de manejo.

Tiela Trapp Grassotti, Cecile Jacry, Manuela Gamarra Cassol, Michele Bertoni Mann, Aline Alves Scarpellini Campos, Jever (…)2026-09-01