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🧬 biology

The Encoding Gauge of Fermionic Variational Quantum Algorithms: Classical Simulability is Encoding-Relative, Trainability is Invariant

Este artigo estabelece que, embora a simulabilidade clássica de algoritmos quânticos variacionais fermiônicos dependa da codificação e possa ser otimizada via transformações de gauge, sua treinabilidade é estritamente invariante à codificação, implicando que a vantagem quântica genuína deve basear-se em recursos independentes de codificação, como a dimensão da álgebra de Lie e a não-estabilizabilidade, em vez de métricas específicas de codificação, como o peso de Pauli.

S. M. Yousuf Iqbal Tomal, Abdullah Al Shafin2026-07-21
🧬 biology

Discovery of Bioactive Triterpenoid Saponins and Antioxidant-Rich Tissues in the Endemic Cyclamen adzharicum from Adjara (Georgia)

Este estudo documenta a alta diversidade e o endemismo da flora efemeróide de Adjara, identifica o *Cyclamen adzharicum* como uma espécie medicinal fundamental e revela que suas folhas são uma fonte superior de saponinas triterpenoides ricas em antioxidantes em comparação com seus tubérculos, apoiando, desta forma, os esforços de conservação e futuras pesquisas farmacológicas.

Natela Varshanidze, Aleko Kalandia, Maia Vanidze, Nazi Turmanidze, Nana Zarnadze, Ketevan Dolidze, Inga Diasamidze, Eter (…)2026-07-21
🧬 biology

Extremophilic Adaptations Across the Archaeal Domain Are Governed by Lineage Clustering

Este estudo demonstra que incompatibilidades aparentes entre traços extremófilos de arqueias, tais como a halofilia e a metanogênese, são primariamente artefatos de agrupamento de linhagens e pseudorreplicação filogenética, em vez de restrições bioquímicas intrínsecas, conforme evidenciado pela frequente coocorrência dessas adaptações em linhagens não pertencentes às Halobacteria quando analisadas utilizando métodos filogeneticamente corrigidos.

Ajay Vellanki2026-07-21
🧬 biology

GPCR mechanical pivots are packed closer to the membrane center than pivots in other polytopic membrane protein folds

Este estudo demonstra que os pivôs mecânicos dos receptores acoplados à proteína G (GPCRs), definidos pelo empacotamento atômico local mais apertado, estão significativamente mais próximos do centro da membrana do que os de outros dobramentos de proteínas de membrana politópicas, indicando que este posicionamento central é uma característica distintiva da superfamília dos GPCRs em vez de uma propriedade universal de feixes transmembrana.

Huazhang Shen2026-07-21
🧬 biology

MicroSC: A Tiny, Performant Single-Cell Foundation Model

O artigo apresenta o MicroSC, uma família de modelos de fundação de célula única minúsculos e de alto desempenho (1,5M–7,7M de parâmetros) que alcançam paridade quase total com professores muito maiores de 51M de parâmetros, como o scGPT, por meio de uma destilação de conhecimento eficiente, permitindo a implantação rápida e de baixo custo em hardware comum, ao mesmo tempo em que demonstra que a utilidade prática dos modelos atuais de célula única é altamente compressível.

Olivia Denvis2026-07-21
🧬 biology

Differentiable subset binding: gradient-based cross-view itemset mining for heterogeneous data

Este artigo introduz o Differentiable Subset Binding (DSB), um método escalável e baseado em gradiente que supera as limitações combinatórias do tradicional agrupamento de subconjuntos baseado em Apriori para identificar eficientemente conjuntos de itens de coocorrência máxima através de visões de dados heterogêneas, superando os modelos de referência existentes tanto em benchmarks sintéticos quanto em aplicações biológicas do mundo real.

Yayoi Natsume-Kitatani2026-07-21
🧬 biology

Automatic clustering of self-defined groups to minimize false disease associations and maximize within-group genetic similarity

O artigo apresenta o HAPLOCLUST, um método de agrupamento em nível populacional com restrição de tamanho que agrupa indivíduos com base na semelhança genética HLA para minimizar falsas associações de doenças e maximizar a homogeneidade intra-grupo, oferecendo uma alternativa robusta às classificações étnicas autorrelatadas para melhorar o emparelhamento de transplantes e estudos genéticos.

Sapir Israeli, Martin Maiers, Sigal Manor, Bracha Zisser, Yoram Louzoun2026-07-21
🧬 biology

Generating and navigating single cell dynamics via a geodesic bridge between nonlinear transcriptional and linear latent manifolds

O GeoBridge é um novo framework que modela a dinâmica celular como trajetórias geodésicas dentro de um espaço métrico Riemanniano aprendido para permitir a reconstrução de programas transcricionais contínuos e robustos ao ruído e a navegação controlada entre estados celulares distintos a partir de dados esparsos e não pareados de sequenciamento de RNA de célula única.

Luonan Chen, Junchao Zhu, Zhenyi Zhang, Yuhao Sun, Hao Dai, Wen Han, Peijie Zhou2026-07-21