🧬 biologia

Loss of restriction-modification methyltransferases drives persistence to fluoroquinolones in Pseudomonas aeruginosa

Este estudo revela que a perda de metiltransferases de restrição-modificação do tipo I em *Pseudomonas aeruginosa* altera a estrutura do nucleoide e retarda o crescimento, aumentando assim a população de células persistentes não resistentes que sobrevivem ao tratamento com fluoroquinolona, um fenômeno particularmente observado em isolados de fibrose cística.

Stefano Pagliara, Maureen Micaletto, Nicolas Gomez, Anna Olina, Aleksei Agapov, Urszula Łapińska, Matthias Preuße, María (…)2026-10-19
🧬 biologia

Developmental progression toward embryogenic competence in Theobroma cacao L.: an integrated cytohistological and molecular analysis

Este estudo integra análises cito-histológicas e moleculares para identificar que o acúmulo de fenólicos e a expressão precoce de genes específicos (BBM, ABI3, AGL15 e IAA20) servem como marcadores confiáveis para a competência embriogênica em *Theobroma cacao*, oferecendo critérios para melhorar a embriogênese somática em genótipos recalcitrantes.

Liliana Victoria Monsalve Zapata, Tatiana Osorio-Montoya, Liliana Alexandra Pila Quinga, Aura Ines Urrea Trujillo, Laura (…)2026-10-19
🧬 biologia

RNase E-dependent guide generation and activation of the SPARMA defense system

Este estudo revela que o sistema de defesa procariótico SPARMA depende da RNase E do hospedeiro para a biogênese do RNA guia e utiliza um mecanismo dependente de concentração onde a ligação ao alvo desencadeia a dimerização e a formação de filamentos para ativar domínios efetores do tipo Mrr para a degradação colateral do DNA e infecção abortiva.

Daan Swarts, Théophile Niault, Balwina Koopal, Donata Dakineviciene, Jinte Jespers, Dai-ke Zhang, Simon Lindhoud, Ane Sa (…)2026-10-19
🧬 biologia

A gene-level batch effect quantification method based on condition-aware correction and adaptive thresholding

Este artigo apresenta os "Efeitos Técnicos de Grupo conscientes da condição" (condition-aware Group Technical Effects), um novo framework que aprimora a quantificação de efeitos de lote em nível de gene em dados de célula única ao desenredar os efeitos da condição biológica do ruído técnico por meio de uma estratégia de penalização baseada em pontuação de condição e um método de limiarização adaptativa.

Wen Li, Xiao Chang2026-10-19
🧬 biologia

A state model of transcription and co-transcriptional processing enables measurement of the underlying kinetics

O artigo apresenta o SKaTER, um modelo de estado matemático que permite a quantificação simultânea da cinética de elongação da transcrição, splicing e clivagem, revelando como características de sequência, organização nuclear e estados de cromatina moldam coletivamente o processamento de RNA co-transcricional.

Matthew Gamble, Joshua Saltzberg, Alyssa Fronk, Charles Query, Kenny Ye2026-10-19
🧬 biologia

Joint spatial and gene fine-mapping reveals convergent neuroanatomical niches but limited overlap among associated genes in psychiatric disorders

O estudo introduz o SDESE, um novo framework que integra transcriptômica espacial com mapeamento fino genético para revelar que, embora cinco transtornos psiquiátricos comuns convirjam em nichos neuroanatômicos compartilhados no córtex pré-frontal, eles são impulsionados por conjuntos de genes amplamente distintos, porém funcionalmente convergentes.

Miaoxin Li, Ying Luo, Chao Xue, Meng Liu, Liubin Zhang, Wenjie Peng, Lihang Ye, Wu Wei, Lin Jiang2026-10-19
🧬 biologia

First detection of porcine associated bacterium Inconstantimicrobium in a reptilian host: gastrointestinal microbiome characterisation of healthy and unhealthy green turtles (Chelonia mydas) using full-length 16S rRNA sequencing

Este estudo utilizou o sequenciamento de RNA ribossômico 16S de comprimento total PacBio HiFi para caracterizar os microbiomas gastrointestinais de tartarugas-verdes saudáveis e não saudáveis, revelando uma disbiose significativa em indivíduos debilitados e relatando a primeira detecção da bactéria associada a suínos *Inconstantimicrobium* em um hospedeiro reptiliano, potencialmente ligada ao escoamento ambiental.

J. Bowtell, N. Blais, A. Hammond, Z. Egerton, E. Kay, C. Madden, M Jelocnik, H Duong, K. A. Townsend2026-10-19
🧬 biologia

Untreated controls reveal that pre-treatment prediction of cancer cell fate mostly reflects growth fitness

Este estudo demonstra que as previsões transcriptômicas do destino das células cancerígenas pré-tratamento refletem primariamente o fitness de crescimento intrínseco em vez de uma tolerância específica a drogas, visto que modelos de controle não tratados alcançam precisão preditiva comparável à de modelos específicos para drogas.

Rabeya Noor, Khairum Jahan Roza2026-10-19✓ Author reviewed ⓘ
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Topoisomerase IIIα resolves inter- and intra-molecular intertwines during DNA replication

Este estudo demonstra que a Topoisomerase IIIα resolve diretamente tanto emaranhados de DNA inter quanto intramoleculares gerados durante a terminação da replicação, particularmente no DNA de fita simples da fita descontínua, garantindo assim a integridade do genoma e a progressão da forquilha quando a Topoisomerase IIα está comprometida.

James Dewar, Sabrina Van Ravenstein, Lillian Campos, Gabor Harami, Darren Heintzman, Steven Dahmen, William Dunphy, Keir (…)2026-10-19