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🧬 biologia

SSR marker-based genetic diversity and population structure of large-leaf tea germplasm across four major tea-producing regions of Yunnan, China

Este estudo utilizou marcadores SSR para analisar 216 acessões de chá de folha grande de quatro regiões de Yunnan, revelando abundante diversidade genética primariamente dentro das populações e uma fraca diferenciação regional impulsionada pelo fluxo gênico extensivo e intercâmbio histórico, fornecendo, assim, uma base para futuros esforços de conservação e melhoramento.

Qihuan Ding, Wuxiang Fu, Ning Chi, Jianmei Su, Shanshan Wu, Zhanxia Ma2026-07-01
🧬 biologia

GcQCR7 Mediates Pathogenicity via Maintaining Cell Wall Integrity and Enhancing Oxidative Stress Tolerance in Glomerella cingulata

Este estudo demonstra que a subunidade mitocondrial GcQCR7 é essencial para a patogenicidade de *Glomerella cingulata* ao manter a integridade da parede celular, o metabolismo energético e a tolerância ao estresse oxidativo, identificando-a, assim, como um novo alvo para o manejo da mancha foliar de *Glomerella* na produção de maçã.

Mingjuan Yang, Xinyue Cui, Shan Zhang, Fang Wang, Weichao Ren, Pingliang Li, Na Liu, Baohua Li, Chengying Jiang, Sen Lia (…)2026-07-01
🧬 biologia

Mechanosensing at the endoplasmic reticulum by IRE1

Este estudo identifica o retículo endoplasmático como uma organela mecanossensível autônoma onde a proteína transmembrana IRE1 detecta diretamente a tensão de membrana para desencadear a sinalização JNK e aumentar a síntese global de proteínas, ligando, assim, forças mecânicas à adaptação muscular independentemente de seu papel canônico na resposta a proteínas mal dobradas.

Hesso Farhan, Michaela Mayr, Luiz Garcia-Souza, Murphy McDermott, Utku Horzum, Yannick Frey, Margot Haun, Stephan Geley (…)2026-07-01
🧬 biologia

Transglutaminase 2 contributes to the blood clotting cascade

Este estudo desafia a visão de longa data de que o Fator XIIIa é a única transglutaminase responsável pela estabilização do coágulo, demonstrando que a transglutaminase tecidual (TG2) também desempenha um papel significativo no reforço dos coágulos sanguíneos e na redução da fibrinólise.

Gerry Melino, Mauro Piacentini, N Mutch, Alessandro Mauriello, Manuel Scimeca, Mara Mancini, Valerio Da Ros, Francesco B (…)2026-07-01
🧬 biologia

Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis

O Shotgun-NF é um pipeline Nextflow portátil, modular e reprodutível que unifica um conjunto abrangente de ferramentas para análise de metagenômica shotgun de ponta a ponta, desde dados de sequenciamento brutos até insights comparativos em nível de linhagem, enquanto garante a consistência da execução através de diversos ambientes computacionais por meio de conteinerização e rastreamento automatizado de proveniência.

Fereshteh Izadi, Sepideh Mofidifar, Emily A. Wasson, Carla S. Möller-Levet, André P. Gerber2026-07-01
🧬 biologia

Predicting Microbiologically Influenced Corrosion Risk from Quorum Sensing Biofilm Community Features: A Random Forest-SHAP Approach

Este estudo introduz uma estrutura de aprendizado de máquina Random Forest-SHAP que prevê com sucesso o risco de corrosão influenciada microbiologicamente ao integrar novos recursos de comunidades de biofilme de quorum sensing com parâmetros ambientais e microbianos tradicionais, alcançando um F1 score de 0,762 e demonstrando o valor preditivo de sinais de comunicação bacteriana na avaliação de corrosão.

Bipul Bhattarai, Naina Maharajan, Sulav Dahal2026-07-01
🧬 biologia

AI-Based Pipeline for Vascularization Detection in Histological Images; low-cost solution Using Moderate Computing Resources

Este artigo apresenta um pipeline de IA de baixo custo e fácil utilização que combina o processamento simples de imagens com um método de busca de similaridade interativo e de autoaprendizado para permitir que patologistas detectem de forma rápida e precisa a vascularização em imagens histológicas utilizando recursos computacionais modestos e rotulagem manual mínima.

Jan Žídek, Bretislav Lipový, Veronika Pavliňáková, Martin Knoz, Jakub Holoubek, David Izsák, Vladimir Váňa, Jan Herudek (…)2026-07-01
🧬 biologia

Ecological Inference Is Structured Empirical Risk Minimization: Generalization Across Space, Nested Units, and Niche Support

Este artigo argumenta que a falha frequente de modelos geográficos em generalizar entre sítios decorre de um desajuste fundamental de estimando em dados de pesquisa aninhados, demonstrando que a inferência ecológica é estruturalmente equivalente à minimização de risco empírico sob generalização de domínio e requer validação de retenção ao nível populacional, em vez da validação cruzada padrão ao nível individual, para garantir uma transferência espacial confiável.

R. Craig Stillwell2026-07-01
🧬 biologia

BioGPT-ClinVar: Parameter-Efficient Fine-Tuning of a Biomedical LLM for Genomic Variant Interpretation

Este estudo apresenta o BioGPT-ClinVar, um framework de ajuste fino eficiente em parâmetros utilizando Adaptação de Baixo Rank (LoRA) para adaptar o modelo BioGPT de 150 milhões de parâmetros para a interpretação de variantes genômicas, demonstrando convergência eficaz em um conjunto de dados curado do ClinVar ao mesmo tempo em que fornece um pipeline de código aberto e reprodutível para futuras aplicações clínicas e de vigilância.

Sepideh Moafi2026-07-01