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🧬 biologia

Single-Cell Foundation Models in Biotechnology: A Scoping Review and Bibliometric Analysis of Multimodal AI for Cell-State, Perturbation, and Biomarker Prediction

Esta revisão de escopo e análise bibliométrica de 1.042 estudos revela que, embora os modelos de fundação de célula única estejam se expandindo rapidamente na biotecnologia, o campo sofre com reprodutibilidade inconsistente, falta de rigor em benchmarks e carência de recursos abertos, com baselines simples frequentemente provando ser competitivas contra arquiteturas complexas.

Behin Omidi, Mohammmad Mahdi Hemati Aalm, Arshia Farmahini Farahani, Amir Reza Hassan Poor Barkadehi2026-06-30
🧬 biologia

Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

Este estudo integra análise transcriptômica, aprendizado de máquina e validação clínica para identificar C4A, GANAB e TUBA4A como biomarcadores diagnósticos chave relacionados à UFMilação para a periodontite, elucidando seus papéis em vias imunológicas e metabólicas e propondo potenciais alvos terapêuticos.

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
🧬 biologia

Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

Em um estudo de coorte prospectivo de 6,5 anos com estudantes do ensino secundário quenianas, o uso de coletres menstruais reduziu significativamente o risco de transição de um microbioma vaginal de domínio ótimo de *L. crispatus* para um estado não ótimo, sugerindo que o fornecimento de coletres antes da estreia sexual é crucial para manter a saúde vaginal.

Supriya Mehta2026-06-30
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Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

Este estudo utiliza uma estrutura de aprendizado de máquina de dois estágios combinando agrupamento GMM e regressão XGBoost em dados do NHANES 2017–2023 para revelar que as respostas da PCR impulsionadas por macronutrientes variam significamente por fenótipo metabólico e etnia, destacando um "Paradoxo da Resiliência à Fibra" em populações negras não hispânicas e defendendo uma abordagem de nutrição de precisão estratificada.

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
🧬 biologia

EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

Este estudo demonstra que a variância do sinal de EEG é um biomarcador robusto para distinguir estados ictais e valida que um classificador Random Forest, treinado no conjunto de dados da Universidade de Bonn com partição rigorosa de dados por nível de sujeito para evitar vazamento, alcança alta acurácia (96,2%) e sensibilidade (98,3%) na detecção de crises.

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30
🧬 biologia

Differential Signaling in Adaptive Immunity: Deciphering the Mechanism to Identify the Physical and Evolutionary Bases of Non‑Self

Este artigo propõe um arcabouço mecanofísico que identifica o deslocamento mecânico diferencial como a variável fundamental que permite aos receptores imunológicos adaptativos discriminar o próprio do não-próprio ao medir desvios abruptos em campos de força física em resolução de aminoácidos, unificando, assim, o reconhecimento humoral e celular por meio de uma cascata de decisão progressiva que resolve paradoxos de especificidade imunológica de longa data.

Yasir Arafat Maassoom2026-06-30
🧬 biologia

Fungal diversity in forest's soil: Moderate-term post-thinning effect of a Mediterranean mature Pinus halepensis forest.

Um estudo de uma floresta de *Pinus halepensis* mediterrânea em Israel revela que, embora o desbaste moderado reduza ligeiramente a diversidade fúngica total, a remoção completa das árvores altera significativamente as características do solo e desloca as comunidades fúngicas de espécies simbióticas associadas ao pinheiro para táxons saprotróficos e patogénicos típicos de áreas não florestais.

Segula Masaphy, Noam Levi, Limor Zabari, Ezra Orlofsky2026-06-30
🧬 biologia

A multi-omics dataset of the developing zebrafish intestine: longitudinal transcriptomic and microbiome profiles in wild-type and IgZ knockout models

Este estudo apresenta um conjunto de dados multiômicos integrando perfis longitudinais de transcriptômica e microbioma de peixes-zebra selvagens (wild-type) e com nocaute de IgZ para elucidar o papel do desenvolvimento de IgZ na regulação da imunidade intestinal e da homeostase microbiana.

Raktakamol Pharrat, Xuyang Zhao, Zhengben Wu, Congran Bei, Yongyao Yu2026-06-30
🧬 biologia

Optimization of the 5' untranslated region and codon of the mRNA vaccines

Este estudo demonstra que a otimização sistemática da região 5' não traduzida e do uso de códons de vacinas de mRNA aumenta significativamente os níveis de expressão proteica e a estabilidade, uma estratégia validada através do design e teste bem-sucedidos de vacinas da proteína F do vírus sincicial respiratório (VSR).

Qiuji Wang, Xiaorong Peng, Yaqian Zeng, Xindeng Guo, Weineng Meng, Ning Deng2026-06-30
🧬 biologia

Integrative single-cell and bulk transcriptomic analysis with Shennong machine learning reveals the landscape of calmodulin associated prognostic genes in breast cancer

Este estudo integra análises transcriptômicas de célula única e de bulk com o aprendizado de máquina Shennong para identificar uma assinatura prognóstica relacionada à calmodulina de oito genes no câncer de mama, revelando sua associação com a dinâmica das células epiteliais, vias de sinalização específicas e potenciais alvos terapêuticos.

Jian Chen, Wenhui Lai, Can Yang2026-06-30