A Multiscale Signaling--Biophysical Framework Reveals Mechanisms of Macrophage-Mediated RBC Clearance in Sickle Cell and Gaucher Disease
该研究构建了一个整合信号动力学、耗散粒子动力学模拟与物理信息神经网络的多尺度混合框架，揭示了镰状细胞病和戈谢病中巨噬细胞介导红细胞清除的分子机制，并展示了其在参数推断及治疗策略探索中的有效性。
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biophysics
609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Exposure to the antimicrobial peptides LL-37 and ATRA-1 induces a lipidome response in Staphylococcus aureus that alters membrane biophysical properties
该研究通过脂质组学和生物物理分析发现，金黄色葡萄球菌在暴露于抗菌肽 LL-37 和 ATRA-1 时会启动特异性的膜脂质重塑机制（如改变 Lysyl-PG、类胡萝卜素及醌类水平），从而调节膜表面电势和刚性以应对肽类压力，这一发现为开发基于抗菌肽的疗法提供了重要依据。
How the Azadithiolate Ligand Impacts O2-Stability of Group B -Hydrogenase ToHydA
本研究通过结合 ATR-FTIR 光谱和分子动力学模拟，揭示了 ToHydA 中 Azadithiolate (ADT) 配体上的氮桥与 C212 侧链形成的氢键对于稳定 H_inact 和 H_trans 态至关重要，而将其替换为 Propanedithiolate (PDT) 会破坏该相互作用，从而抑制这些中间态的形成并改变酶的氧化还原状态分布。
Inferring structure factors of weakly populated excited states in perturbative crystallography experiments
该论文提出了一种基于激发态与基态相关性统计先验的新方法，用于估算微扰晶体学实验中弱布居激发态的结构因子振幅，有效克服了传统线性外推法因放大实验误差和忽略相位差异而导致的模型构建缺陷。
Accurate single-bead force calibration in high-throughput magnetic tweezers reveals the mechanism of directional transcription termination by MTERF1
该研究提出了一种适用于高通量磁镊实验的原位单珠力校准方法（精度达 3%），并借此揭示了线粒体转录终止因子 MTERF1 通过单向 DNA 解旋实现极性路障作用的分子机制。
Positional information and information flows in dynamic tissues
该研究提出了一种适用于动态组织的定位信息分析框架，通过分解互信息流来量化发育过程中的信息生成、保持与丢失，并利用果蝇、小鼠和斑马鱼的全胚胎轨迹数据揭示了形态发生如何通过结构化的细胞混合来优化模式形成。
Small-Molecule Structure Determination and Anisotropic Displacement Analysis at Turkish Light Source
本文通过三种罗丹宁衍生物的晶体结构测定，验证了土耳其光源（Turkish Light Source）的实验室单晶衍射仪结合用户友好处理流程在解析小分子结构（包括处理结构无序和计算各向异性位移参数）方面的可靠性与有效性。
Assessing the Generalizability of Machine Learning and Physics Methods for DNA-Encoded Libraries
该研究通过系统评估机器学习、对接与共折叠方法在 DNA 编码库（DEL）数据上的表现，发现尽管机器学习在分布内预测中表现优异，但针对分布外（OOD）化合物的泛化能力高度依赖于靶点和配体，因此强调在虚拟筛选中必须进行严格的系统特异性试点测试，并为此开源了 DEL-iver 工具包。
Antibiotic-Specific Conformational Landscapes of a Multidrug Transporter
该研究利用单分子荧光共振能量转移技术揭示了多重耐药转运蛋白 LmrP 在不同抗生素作用下呈现异质性的构象景观，发现底物依赖的构象转换速率是驱动高效转运的关键机制，从而阐明了其通过动态构象变化识别并转运结构各异抗生素的分子机理。
Growth-dependent sensory bet-hedging enhances collective navigation
该研究揭示了大肠杆菌通过生长速率依赖的感官表型异质性（即感官风险对冲策略），在个体生存优势与群体协调之间取得平衡，从而在不确定环境中增强集体导航能力。