Sodium Ions Regulate GPCR Activation by Remodeling Allosteric Coupling Networks and Hydration Patterns
该研究通过分子动力学模拟和自由能计算，揭示了钠离子通过重塑变构耦合网络和破坏激活所需的水柱来调节多巴胺 D2 受体失活的分子机制，并发现了新的钠离子结合位点，为靶向离子敏感状态的药物设计提供了新见解。
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biophysics
609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Cost-function Optimized Maximal Overlap Drift Estimation for Single Molecule Localization Microscopy
本文提出了一种名为 COMET 的新方法，通过成本函数优化的最大重叠漂移估计技术，显著提升了单分子定位显微成像（SMLM）中漂移校正的精度、准确性和时间分辨率，从而有效克服了传统算法的局限性并实现了更高分辨率的成像。
Residue burial encodes a protein's fold
该研究指出，通过二元编码表示氨基酸是否埋藏于蛋白质核心（即“核心身份”），能够比接触图或机器学习嵌入等现有方法更高效地预测蛋白质骨架构象，从而将确定蛋白质天然折叠的问题重新定义为预测各残基的埋藏状态。
Volume and surface methods for microparticle traction force microscopy: a computational and experimental comparison
该研究通过计算模拟与基于 DNA 水凝胶微粒的实验验证，系统比较了体积法与表面法在微粒牵引力显微镜中的应用，发现表面法在重构牵引力分布时误差更小，从而确立了 DNA 微粒作为测量细胞力的高性能探针。
Programmable Edge-to-Edge Assembly of RNA Nanostructures
该研究提出了一种名为 alphaKL 的紧凑型可编程 RNA 连接器，它通过结合四核苷酸接吻环与三链螺旋相互作用，实现了 RNA 纳米结构沿螺旋边缘的精准组装，从而突破了传统接吻环仅能进行端对端连接的局限，极大地拓展了可编程 RNA 纳米结构的几何设计空间。
Mutation-induced reshaping of protein conformational dynamics revealed by a coarse-grained modeling framework
该研究提出了一种基于内坐标和本质动力学优化的粗粒化弹性网络模型（ICed-ENM），通过量化突变引起的振动熵变来系统揭示疾病相关错义突变如何重塑蛋白质构象能量景观及功能动态。
Determinants of metal import and specificity in a bacterial transporter
本研究通过高通量筛选与结构演化分析，揭示了 Deinococcus radiodurans Nramp 金属转运蛋白中 Mn²⁺与 Mg²⁺转运特异性的分子决定因素，阐明了核心位点突变与调节位点突变在长程上位效应及构象平衡调控中的协同作用机制。
Disentangling fluorescence signals from diffusing single molecules by independent component analysis
该论文提出了一种基于三阶累积量张量分解的独立荧光成分分析（IFCA）框架，通过高效算法成功从低光子率的单分子扩散数据中解混并定量表征了多种荧光物种及亚毫秒级动态亚群。
Fiber optical parametric amplification of low-photon-flux microscopy signals
该研究展示了光纤光学参量放大技术能够显著增强近红外波段低光子通量显微信号，在提供高达 50 dB 增益、1.6 GHz 带宽及优于传统光电倍增管灵敏度的同时，将成像所需功率降低 10 倍以上，为提升激光扫描显微镜在近红外波段的性能开辟了新途径。
Piezoelectric Response of Lysozyme-PVA Composite Films for Flexible and Biocompatible Applications
本文报道了一种将溶菌酶掺入聚乙烯醇基质中制备的可持续生物复合薄膜，该材料利用溶菌酶固有的分子偶极子实现了显著的压电响应，并成功应用于柔性生物兼容的人体运动传感。