609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
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以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
本研究通过筛选发现黄热病毒 NS3 蛋白酶结构域能高特异性、高亲和力地结合平行构象的 G-四链体，并通过关键残基（如 PHE40）采取插入与堆叠复合模式进行相互作用，为开发基于 G-四链体的抗病毒策略提供了新靶点。
该研究利用纽结理论中的缠绕数（writhe）和二阶 Vassiliev 不变量（V2）等拓扑纠缠指标，对超过 28,000 个模拟无序蛋白序列进行分析，揭示了纠缠特征在序列组成、构象几何与生物功能之间的结构化关联，并证明了这些拓扑特征在进化上的保守性，从而为理解内在无序蛋白的组织机制提供了新的生物学维度。
本文提出了一种名为 RESURF 的轻量级深度学习框架，通过集成序列低分辨率帧来提取时空相关信号，仅需 8 帧即可在 30 毫秒内实现实时超分辨率波动成像，有效解决了活细胞快速动态过程观测中的时空分辨率瓶颈。
该研究利用重组脂质囊泡和荧光探针发现，膜曲率通过增加脂质尾部与水的接触而显著增强氧化反应，且这种曲率依赖效应受脂质组成（如不饱和度与胆固醇含量）的调控，揭示了膜曲率与成分共同决定膜氧化易感性的机制。
该研究提出并验证了突变鲁棒性指数（基于 ThermoMPNN 预测的氨基酸替换稳定性变化）能有效预测天然及从头设计蛋白质的局部动力学特征，其预测能力不仅媲美 AlphaFold2 的置信度评分，还能提供互补信息，揭示了突变敏感性与结构刚性之间的物理联系。
该研究通过冷冻电镜解析了大肠杆菌 KdpFABC 钾离子泵在脂质纳米盘中的高分辨率结构，揭示了其转运循环中的构象变化机制，并证实了结构脂质和周边脂质对维持该复合物结构与功能的关键作用。
该研究通过建立首次通过更新框架，揭示了蛋白质在 DNA 上搜索靶点时，由缓慢动力学引发的宽滑动时间分布是实现高效搜索的普遍指纹特征，并阐明了间歇性脱离机制在优化平均搜索时间及其波动中的关键作用。
该研究通过结合可解释人工智能、蛋白质语言模型与能量景观分析，揭示了蛋白激酶中变构位点因处于“中性挫败”的能态区域而难以被算法精准识别，这种独特的能量组织模式恰恰赋予了其适应多样化调控信号的生物学可塑性。
该研究提出了一种名为 amyAMP 的生成式深度学习框架，结合分子动力学模拟，成功揭示了兼具抗菌活性与淀粉样蛋白自组装特性的多肽设计原则，为开发针对耐药菌的新型多肽疗法提供了通用范式。
该研究提出了一种基于自返回排除体积（SR-EV）模型的集成解释框架，表明染色质的拓扑关联结构域（TADs）等特征并非单细胞中固定的三维结构，而是异质性聚合物集合在统计上的富集现象，从而为整合单细胞三维构象与多模态实验观测提供了统一的物理基础。