Cell Cycle-Dependent Chromatin Motion: A Role for DNA Content Doubling Over Cohesion
该研究利用高分辨率扩散映射技术结合遗传学实验与聚合物模型，揭示在人类细胞周期中，DNA 含量的加倍而非黏连蛋白介导的姐妹染色单体束缚，是导致染色质运动性随细胞周期进程（从 G1 期到 G2 期）逐渐降低的根本原因。
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biophysics
609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
From gHBfix to NBfix: Reweighting-Driven Refinement of Hydrogen-Bond Interactions in RNA Force Fields
本文提出了一种基于重加权优化的系统策略，将 RNA 力场中用于修正氢键相互作用的外部 gHBfix 势函数成功转化为内嵌于标准非键框架的 NBfix 参数，在保持原有精度的同时显著简化了力场的部署与计算流程。
Phase diagrams for biophysical fitness landscape design
该研究通过推导解析理论并利用包含 6.2 万种抗体变体的实验数据，验证了蛋白质结合亲和力作为可调参数来定制生物物理适应度景观的可行性，并成功构建了与理论高度吻合的实验相图。
CASPULE: A computational tool to study sticker spacer polymer condensates
本文介绍了一种名为 CASPULE 的高效计算流程，该工具利用 LAMMPS 引擎结合独特的力场与“详细平衡证明”协议，用于模拟和分析由贴纸 - 间隔聚合物构成的生物凝聚体，旨在揭示其形成与功能背后的动力学和热力学机制。
Compaction and swelling of single stretched DNAs driven by molecular crowding
该研究提出了一种理论模型，阐明了大分子拥挤环境产生的渗透压如何通过依赖拥挤剂尺寸和密度的压缩效应（在临界力下导致 DNA 塌陷）以及大尺寸拥挤剂引发的涨落修正（导致 DNA 膨胀），共同调控受拉伸双链 DNA 的力 - 延伸行为。
Open Fourier Ptychographic Microscopy (OpenFPM)
本文介绍了 OpenFPM，这是一个基于树莓派和 3D 打印低成本硬件的开源傅里叶叠层显微镜平台，能够利用 Python 接口实现大视场（1 毫米）下的高分辨率复振幅成像。
Advanced in High-Resolution Cryo Volume Electron Microscopy (cvEM) Imaging for Unicellular and Multicellular Organisms
本文介绍了针对冷冻体积电子显微镜（cvEM）成像中样品制备、电荷平衡、束损伤及采集时间等关键挑战所开发的新实验流程，并通过在秀丽隐杆线虫和含内共生藻的草履虫上的应用，证明了该方法能在近天然状态下实现多细胞和单细胞生物三维超微结构的高分辨率成像。
Visible Light Optical Coherence Tomography Reveals Aging at the RetinalPigment Epithelium-Bruch's Membrane Interface
该研究利用可见光光学相干断层扫描技术，在无病理改变的活体人眼中定量揭示了视网膜色素上皮 - 布鲁赫膜界面随年龄增长发生的增厚及对比度降低等亚临床变化，证实了这些改变与光感受器异常相关，并为从正常衰老到早期年龄相关性黄斑变性的无创精准分级提供了新手段。
Glutamine Tautomerization Drives RhoGAP-Aided GTP Hydrolysis in Small Rho GTPases
该研究利用经典与混合量子 - 经典分子动力学模拟，揭示了 RhoGAP 通过驱动 Gln63 酰胺 - 酰亚胺互变异构来促进 RhoA 小 GTP 酶进行解离型亲核取代反应，从而完成 GTP 水解的分子机制。
Non-Equilibrium Spatial Encoding of Nanoscale Mechanical Relaxation in Growing Plant Epithelial cells
该研究提出了一种基于物理的反演框架，将动态原子力显微镜测量的拟南芥表皮细胞壁储能与损耗模量转化为空间分辨的刚度、粘度和弛豫时间场，揭示了非平衡态下机械弛豫时间与储能耗散耦合的直接关系，从而建立了从纳米尺度流变学到连续体生长描述的通用路径。