Real-Time Visualization of G2L4 Reverse Transcriptase in DNA Repair via Microhomology-Mediated End Joining
该研究利用高速原子力显微镜直接可视化了 G2L4 逆转录酶通过稳定微同源序列、填补缺口及在锰离子刺激下产生分支中间体来介导微同源末端连接(MMEJ)修复双链断裂的实时动态过程,并揭示了 T4 DNA 连接酶在稳定修复产物和抑制异常分支中的关键作用。
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生物物理学是一门迷人的交叉学科,它像一座桥梁,将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里,研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠,甚至探索意识背后的物质基础,让抽象的生命现象变得清晰可测。
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该研究利用高速原子力显微镜直接可视化了 G2L4 逆转录酶通过稳定微同源序列、填补缺口及在锰离子刺激下产生分支中间体来介导微同源末端连接(MMEJ)修复双链断裂的实时动态过程,并揭示了 T4 DNA 连接酶在稳定修复产物和抑制异常分支中的关键作用。
该研究通过核磁共振和冷冻电镜技术揭示了钙离子通过结合α-突触核蛋白A53T突变体的C端区域松弛其构象并增强长程分子内接触,从而促进其从无序单体向具有不同折叠结构的纤维聚集体转化的机制。
该研究通过粗粒化分子动力学模拟,揭示了核纤层蛋白间的相互作用及其与核膜的结合亲和力如何共同调控核纤层网络拓扑结构,从而解释了从晶格状到纤维状等多种实验观测到的结构形态及其在疾病中的潜在机制。
该研究通过分析多种物种的 ATP 合酶结构,揭示其固有的静电势会直接调节质子动力势中的电势分量,从而在不同物种(包括人类)中显著改变局部驱动电压及 ATP 合成与产热的能量分配效率。
该研究利用粗粒化模型 DNAfold2 揭示了空间限域通过熵排斥效应重塑含三向连接 DNA 的折叠景观,使其在生理拥挤环境中优先稳定紧凑拓扑结构并诱导高度协同的折叠转变。
该研究揭示了谷氨酸门控氯离子通道 AVR-14B 及人类甘氨酸受体具有温度依赖性门控机制,即温度升高可诱导非失敏的持续电流并改变药物疗效,从而确立了抑制性配体门控离子通道作为内源性温度感受器在调节神经活动、药物作用及生物体热耐受性中的关键作用。
该研究通过解析人源 TMEM260 O-甘露糖基转移酶与供体及受体形成的复合物冷冻电镜结构,揭示了其识别特定序列、修饰半胱氨酸受体及受体酪氨酸激酶的分子机制,为理解相关先天性畸形提供了结构基础。
本文介绍了 RELION-5.1 中针对淀粉样蛋白纤维冷冻电镜图像处理的新工具,包括基于特征信号的自动拾取算法、在线预处理流程、基于聚类的纤维类型选择工具以及专用去噪神经网络,并通过实验数据验证了其在解析新型纤维结构方面的有效性。
该研究通过结合大规模模拟、Binder 累积量计算及严格的有限尺寸标度方法,精确绘制了典型内在无序蛋白低复杂度结构域(PLCD)的临界相图,揭示了其相行为可划分为三个由不同网络拓扑特征定义的区域,并指出直接计算二体相互作用系数比传统标度法更能准确估算θ温度。
该研究通过冷冻电镜解析了 S320F 突变 tau 纤维结构,并结合细胞实验证实半胱氨酸残基(特别是 C322)是调控 tau 蛋白自发聚集及种子诱导聚集的关键决定因素,其重要性可与核心淀粉样基序相媲美。