Chlorotoxin does not target matrix metalloproteinase-2in glioblastoma
尽管分子模拟表明氯毒素及其片段能与 MMP-2 的非催化区域进行有利结合并抑制胶质母细胞瘤细胞的迁移,但它们并不直接抑制 MMP-2 的酶活性,这表明氯毒素可能针对胶质母细胞瘤中的其他替代机制。
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生物物理学是一门迷人的交叉学科,它像一座桥梁,将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里,研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠,甚至探索意识背后的物质基础,让抽象的生命现象变得清晰可测。
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尽管分子模拟表明氯毒素及其片段能与 MMP-2 的非催化区域进行有利结合并抑制胶质母细胞瘤细胞的迁移,但它们并不直接抑制 MMP-2 的酶活性,这表明氯毒素可能针对胶质母细胞瘤中的其他替代机制。
本研究引入了一种“形状即信号”策略,利用具有明确刚性几何结构的完全基因编码、低分子量蛋白质标签,实现在无需体积庞大的外源探针的情况下,通过冷冻电子断层扫描在拥挤的细胞环境中对特定蛋白质进行直接且无歧义的识别。
本研究表明,源自高分辨率 X 射线晶体学的多构象系综模型能够通过共同计入蛋白质与溶剂的构象熵,从而准确预测蛋白质-配体结合熵,进而实现基于结构的药物设计中对熵的显式考量。
由于发现存在需要进一步完善的不准确之处,作者已撤回题为“利用拉曼光谱定量分析人类细胞中的脂质”的这份手稿,并要求不要对其进行引用。
本文通过引入 PottsMPNN,对将原生序列恢复(NSR)作为蛋白质设计模型主要指标的依赖提出了挑战,该模型通过在噪声结构和多序列比对上进行训练,牺牲了 NSR 性能,以实现更优越的序列生成和能量景观预测。