A membrane insertion code for intrinsically disordered proteins
该研究通过大规模模拟与数据分析揭示了芳香族中心基序插入细胞膜的序列编码规则,并据此开发了高精度的预测工具 AroMIP,从而阐明了内在无序蛋白利用此类基序驱动膜插入的机制。
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生物物理学是一门迷人的交叉学科,它像一座桥梁,将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里,研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠,甚至探索意识背后的物质基础,让抽象的生命现象变得清晰可测。
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该研究通过大规模模拟与数据分析揭示了芳香族中心基序插入细胞膜的序列编码规则,并据此开发了高精度的预测工具 AroMIP,从而阐明了内在无序蛋白利用此类基序驱动膜插入的机制。
该研究通过定义连续单分子追踪所需的动力学条件,利用嗅觉结合蛋白与荧光探针构建了名为 EverGreen 的系统,实现了突破光漂白限制的超过 24 小时不间断单分子追踪。
该研究通过活体成像与计算建模发现,转录因子 Dorsal 在果蝇胚胎中形成的动态簇(hub)是由增强子序列决定的结合动力学所驱动的涌现特征,其丰度和持久性虽随结合位点数量增加而提升,但并不直接预测转录爆发行为。
该研究通过结合 SiM-KARTS、热变性实验和圆二色光谱,证明了优化探针骨架化学(特别是引入锁核酸 LNA 的 DNA 探针)能够显著提高对长非编码 RNA(lncRNA)不同结构的区分精度,并实现对其结合与解离动力学的精确调控,从而为复杂 lncRNA 的单分子分析提供了关键的设计原则。
本文介绍了一种基于 3D 打印平台(Brick-MIC)和新型铁茂衍生物光稳定剂的极简单分子 FRET 方案,该方案利用蓝绿光谱区染料实现了低成本、高灵敏度的生物分子构象变化检测。
该研究开发了一种基于工程化 TPR 重复模体与自标记酶的模块化蛋白标尺,通过在不同表达系统和标记策略下提供一致的 FRET 效率及可预测的校准曲线,成功实现了从体外到细胞内多种 FRET 检测模态(如单分子 FRET、流式细胞术及 FLIM-FRET)的数据标准化与相互转换。
本文提出了一种结合机械相互作用的离散数学模型来模拟生物组织生长,并推导出了描述细胞密度演化的反应 - 扩散连续极限方程,该模型成功复现了实验观察到的界面平滑行为,并揭示了机械性质与集体扩散系数及曲率依赖性之间的内在联系。
该研究通过设计模拟整合酶 IntI 保守 C 端α螺旋的肽段,特异性破坏其介导的突触复合物机械稳定性,从而在不具备直接抗菌活性的情况下显著抑制细菌对抗生素的适应性进化,为遏制抗生素耐药性传播提供了新的治疗策略。
该研究表明,在α1β2γ2 GABA_A 受体的α1 亚基 M2-M3 连接区引入脯氨酸可解除通道激活的分子制动,从而增强其对 GABA 的敏感性并诱导自发开放,而β2 和γ2 亚基在该位点的类似突变则表现出不同的功能效应。
该研究开发了一种将衣藻封装于巨型脂质体中的生物混合微泳体"Chlamylipo",揭示了其通过周期性膜变形将内部鞭毛产生的流体动力有效传递至外部,从而实现自主游动及光控定向的物理机制。