Contributions of error correction and the spindle assembly checkpoint to mitotic timing and fidelity
该研究通过构建并验证粗粒度模型，揭示了染色体正确分离的概率取决于纺锤体组装检查点失效率与错误校正速率之比，并提出了通过有丝分裂时长变化来区分检查点缺陷与错误校正缺陷的简单判据，从而为理解有丝分裂时序与保真度提供了定量框架。
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biophysics
609 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Spatially correlated fluctuations govern relative chromatin motion
该研究通过活细胞成像与聚合物模拟发现，核质中非平衡的空间相关涨落导致染色质位点间的相对运动显著慢于独立扩散预测，这种机制通过降低短距离相遇频率并延长相遇持续时间，对基因调控产生了关键影响。
Theory of Cell Body Lensing and Phototaxis Sign Reversal in "Eyeless" Mutants of Chlamydomonas
本文通过结合细胞体透镜效应与适应性光趋性模型，定量解释了衣藻“无眼”突变体中因内部焦散线导致透镜聚焦光信号（其时间导数更高）压倒直接光照信号，从而引发光趋性方向反转的机制。
An essential dynamics-based elastic network model to unravel the conformational dynamics of DNA, RNA, and protein-nucleic acid complexes
本文提出了一种基于重要动力学优化的弹性网络模型（edENM），通过整合分子动力学模拟参数，成功实现了对 DNA、RNA 及其与蛋白质复合物（如染色质亚基和核糖体）构象动力学的精确描述，并扩展了 eBDIMS 框架以模拟其大规模功能运动。
Investigating the function of C-terminal tails of human tubulin isotypes in the motility regulation of cytoplasmic dynein
这项计算机模拟研究揭示了人脑肿瘤中高表达的六种β-微管蛋白异构体 C 末端尾巴的序列差异，特别是 TUBB2A、TUBB2B 和 TUBB2C，通过调节侧向相互作用影响动力蛋白微管结合结构域的构象运动，进而调控其运动速度、持续性及在神经疾病和癌症中的运输缺陷。
3D printed titanium anodized effects on human gingival fibroblasts response and bacterial colonization: a dual approach
该研究证实，通过选择性激光熔化（SLM）制造并经阳极氧化处理的 Ti6Al4V 表面在保持良好生物相容性的同时，能增强人牙龈成纤维细胞的粘附并改善软组织整合，且不影响牙龈卟啉单胞菌等细菌的定植。
Segment Any Plant (SAP): Foundation-Model Segmentation for Plant Time-Series Phenotyping
本文提出了 SAP（Segment Any Plant）框架，该框架利用预训练的 Segment Anything Model 2 (SAM2) 实现了无需特定任务重训练、仅需少量样本提示即可对多种植物在不同生长阶段和成像条件下进行高精度时间序列分割与表型分析。
Do AI Models for Protein Structure Prediction Get Electrostatics Right?
该研究发现，尽管 AlphaFold2 等 AI 模型在预测天然蛋白质结构方面表现优异，但它们未能正确编码静电学原理，经常错误地将可电离残基预测为埋藏在疏水核心中，而通过分子动力学模拟可有效修正这一缺陷。
Scanning DIA on the ZenoTOF 8600 system enables ultra-sensitive and quantitative proteomics from single cells to post-translational modifications in a compact platform
本文介绍了紧凑型 ZenoTOF 8600 质谱系统，该系统通过集成 Zeno 阱增强 MS/MS、电子激活解离及扫描四极杆数据非依赖性采集（ZT Scan DIA）技术，在单细胞蛋白质组学、大规模高通量分析、低丰度靶向定量及翻译后修饰检测等方面实现了超高灵敏度与定量准确性，且其 ZT Scan DIA 模式在鉴定数量和定量重现性上均优于传统方法。
Mapping Active-Site Conformational Ensembles Along Competing Catalytic Pathways of the Hairpin Ribozyme
本研究利用全原子分子动力学模拟与增强采样技术，系统探索了发夹核酶活性位点在不同质子化状态下的构象系综，结果表明涉及 G8 去质子化的双阴离子通用酸碱机制难以形成催化构象，而由非桥接氧原子作为质子中继的单阴离子路径则能产生有利于反应进行的几何构型，从而为理解该核酶的催化机理提供了统一的构象视角。